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Name : polA (CLOST_1407) Accession : YP_003936432.1 Strain : Clostridium sticklandii DSM 519 Genome accession: NC_014614 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1562559 - 1565225 bp Length : 2667 bp Strand : - Note : Evidence 2a : Function of homologous gene experimentally demonstrated in an other organism; PubMedId : 3125407, 6777244, 9231429; Product type e : enzyme DNA sequence : ATGGATGGAGCTCTTGTATCACTGGAGGATATAATGGACAAATTATTGATTTTGATAGATGGAAACAGTTTAATGAATAG AGCTTACTATGCTCTGCCTGAATTGATGAATAAAAAAGGACAGCATACAAATGCTATTTATGGATTTGCAAATATATTAT TCAAAATAATGGATACCTATAAACCAAGCCATATATCAGTGGCATTTGACTTAAAAGCACCGACCTTTAGGCATAAGCAG TACGATGCGTATAAAGGTAACAGAAAAAAGATGCCGGATGAACTAAGAGAGCAGGTAGAGCCTCTTAAGAAAATGATAGA TGCTTTCGGGATAAATAGAATTGAACTTGAAGGCTATGAAGCAGACGACTTAATAGGTACAGTTGCTAAAAATTTTGAGC AAGATGGTTTTGAAGTTTATATAATTACTGGTGATAAGGATGCTCTTCAATTAGTAAGTGATAAAATAAAGGTTTTATTT ACTAAAAAAGGAATTTCAGAGCTAGATGAATATGATCCAGATAAAATGACTGAAAAATATGAGCTTACGCCTCAGCAATT TATCGATTTAAAGGGATTAATGGGAGATCAGTCAGATAATATTCCTGGAGTAGCAGGAATAGGCGAAAAAACAGGAATTA AGCTTTTGAAAGAGTATGGAAGCATAGAAAATATCTATATGAATATAGATGAGATTTCTAAAAGCGTAAAAGCAAAGCTT GAGGCTGGATATGATATGGCTTTTCTGAGTAAAAGCCTTGCAACTATTATGGTAGATATCCCTTTAGAGCTTAAAGTTGA TGAGTTTGAAAAGAAGGATATAGACAAAAATACTTTAATCAGTTTGTTTTCAGAATTTGAATTTAATAGCTTGATAGGTA AGGTTGGAAATGATGAATCTGGTTTGATTGATAAAGTGCAAAAGGAGTATTTAATTTCAAATGATATTGAGTTATTAATA GATAAAGCAACTAGTTTGAAATCTTTAAATTTATTTTCTATTGCAAAATCTGGATTAGTTAGTGACAAAAGATTGATAAA TTTATTTGTGAAGATAGATGAAGAATTTTTTAATATTGAAGAAAAGGATGTATTAAAGCTTAAGGATGTATTTGAGAATC CAGAAATAAAGAAGTATGGATATAATCTAAAAAATGACTGTTTAATTTTAAAGCCATATGAAATAAATTTGACAGGGCTT TATTTTGATATAGCCATAGCTGAATATCTAATTGATTCAACTAGCTCAAACTACGAAATCAAAGATATAGCGCTTAAATA CAATCTTGGGGATGTGCTATCTTTAGAAGAGCTTTTGGGCAAAGGTAAAAGTAAAAAAGACTTTAAAGATTTATCAGATG CTCAGATATCAGGCTACGCATGTTCAGTTTTAGATATTGTTGATAAAGGAAAAGAAGCTTTAATCACTACTATTGAAAAT TATAATATGCACAATTTATTTTATGAAGTTGAAATGCCACTAGTTGAGATTTTAGCGGATATGGAATATATAGGCATAAG CGCAGATAAAGAAGTACTTAATGAACTAAAACAAAAATTCGATATTGAAATTAAAACTTTAGAAGCAAGCATTTATGAAT ATGCTGGAGAAAACTTCAATATTAACTCTCCAAAACAGCTTGGACATATTTTATTTGATAAGCTTGGGCTTCCAGCAATC AAAAAAACTAAAACGGGGTATTCTACAAATGCTGAAGTTTTAGAAGCTTTATCAGATAAACATCCTATAATAGATAAAAT TACCTTATATAGACAATATACAAAGCTTCAGTCCACATATGTAGATGGGCTTTTAAATATAATTAATCCAAAAACGGGCA GAATTCACTCATCGTTTAATCAAACTATTACAACTACTGGGCGAATATCTTCAACTGAGCCTAATATGCAAAATATACCA GTACGTCTAGAAATTGGGCGCGAACTAAGAAAAGTATTTGTAGCTCCAGAGGACATGTATTTAGTGGATGCTGACTATTC TCAGATTGAGCTTCGAATCCTAGCACACATTGCTAATGACGAAGGACTTATTGATGCTTTTTCAAAAGGTGATGATATTC ATACAATTACAGCATCAGAAGTATTTAATGTACCCTTAGATGAGGTCACTAAAGAACTCAGGAGCGCTGCAAAGGCAGTT AATTTTGGAATAGTTTATGGGATAAGTGATTTTGGCTTATCAAATAATCTTGGAATATCAAAGCAAGTTGCTAAAGAATA TATCGATAATTACTTTGCAAGATATCCATATGTAAAAAAATACATGGAAGATATAGTAGAAAAGGCAAAAAATGATGGTT ATGTAGAAACTTATATTGGAAGAAGAAGATACATTCCTGAACTGGGTTCAAATAATTTTATAATGAAGAATTTAGGAAAA AGATTAGCTATGAACACTCCAATTCAAGGAAGCGCTGCAGATGTTATAAAAATTGCAATGGTAAAAGTATATGCTAGACT TAAATCTGAAGGGTTAAAATCTAAACTGATACTACAAGTTCATGATGAACTTATAATTGAGTCACCTGATAGTGAAAAAT CATATGTAGCAGATTTATTAAAAGAAGAAATGGAATCCGCTGTAGACTTAAATGTTAAACTTACAGTTGATGCTAAATGG GGAAAATCTTGGTATGAAACAAAATAA Protein sequence : MDGALVSLEDIMDKLLILIDGNSLMNRAYYALPELMNKKGQHTNAIYGFANILFKIMDTYKPSHISVAFDLKAPTFRHKQ YDAYKGNRKKMPDELREQVEPLKKMIDAFGINRIELEGYEADDLIGTVAKNFEQDGFEVYIITGDKDALQLVSDKIKVLF TKKGISELDEYDPDKMTEKYELTPQQFIDLKGLMGDQSDNIPGVAGIGEKTGIKLLKEYGSIENIYMNIDEISKSVKAKL EAGYDMAFLSKSLATIMVDIPLELKVDEFEKKDIDKNTLISLFSEFEFNSLIGKVGNDESGLIDKVQKEYLISNDIELLI DKATSLKSLNLFSIAKSGLVSDKRLINLFVKIDEEFFNIEEKDVLKLKDVFENPEIKKYGYNLKNDCLILKPYEINLTGL YFDIAIAEYLIDSTSSNYEIKDIALKYNLGDVLSLEELLGKGKSKKDFKDLSDAQISGYACSVLDIVDKGKEALITTIEN YNMHNLFYEVEMPLVEILADMEYIGISADKEVLNELKQKFDIEIKTLEASIYEYAGENFNINSPKQLGHILFDKLGLPAI KKTKTGYSTNAEVLEALSDKHPIIDKITLYRQYTKLQSTYVDGLLNIINPKTGRIHSSFNQTITTTGRISSTEPNMQNIP VRLEIGRELRKVFVAPEDMYLVDADYSQIELRILAHIANDEGLIDAFSKGDDIHTITASEVFNVPLDEVTKELRSAAKAV NFGIVYGISDFGLSNNLGISKQVAKEYIDNYFARYPYVKKYMEDIVEKAKNDGYVETYIGRRRYIPELGSNNFIMKNLGK RLAMNTPIQGSAADVIKIAMVKVYARLKSEGLKSKLILQVHDELIIESPDSEKSYVADLLKEEMESAVDLNVKLTVDAKW GKSWYETK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 3e-153 | 44 |
