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Name : HPSJM_00770 (HPSJM_00770) Accession : YP_003928070.1 Strain : Helicobacter pylori SJM180 Genome accession: NC_014560 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 149048 - 150703 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAATTTATGACCCTTTGGGTAACATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTATT ATTTTTCTTATCTTTAATGATTTTTAAGCTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTCCTTTATGGCTTCCTTTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATCATTGCAGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGTGCAATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACCGCAGCGATTTTAGTGGGATTAGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCTGGGTTATGC CTAATCGCTAATACTGCTCCTGTGGCCTTTGGTGCAGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC GGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTTTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATCGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAGACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATCTCAGCCCTTGTCTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGTCTCATTCACTAAAACTAACCATCATATCTGTAAAA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAGCCTTGTTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC CTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAAACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACTATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGTTTGGCTTTTACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGATGGGTTGGCGTGTTTTTAA CCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC GGTGGGGTTAGCCGGAAAAGAAAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCGCTTGTTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATCAGCGCGATTGCGTATTGGATCCCTGAAGTGGTGCCTAAAATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMIFKLKGYTAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAVSFTKTNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLVFVAIMGVVISAIAYWIPEVVPKIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 5e-99 | 52 |
