Gene Information

Name : HPSJM_06880 (HPSJM_06880)
Accession : YP_003929253.1
Strain : Helicobacter pylori SJM180
Genome accession: NC_014560
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport
COG ID : COG3846
EC number : -
Position : 1374253 - 1375512 bp
Length : 1260 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence : 
ATGGCCATTCCACTACTTGCTCTGCCCTTTCTTTCTAACCCTTTAGTGCTTGGTGCTTTAGCTGTCATAGGAGTGGGTGC
TTATTTGTATTCCAATAAGCAAGATTCTTTAATTGTGCAAGCAGATGGGCTTTATAGTGAAATTCTTGGGTTTTTTATTT
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CTTTTGATCCTTTTATATTCCTTTAAACGCTATCAAAACAATGATTTATTTGAAATCAAAACCTTTTTAATGCTTTTTGT
GTTTGTAGGATACCTTTCTTTGTACCATTATGCTTTTAAATCTGATGGTTCTAGTAGCGGTAATGGTCGCTCCAGTTTTG
CCTTTCAAAATCATGTAACAGAAATTTTTGACACGCCTGCTAACTTGCTAAATGCTGGGATTTCTAATGTGGTTAAGGAA
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CTGTTTTGTTATTAGTTATTTTAGGATTAGAATTATTTTTGTTATTCAAAGTTTTCTGTTATGTTTTTACGACTTATTTA
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TTATGTGAAAAAAATTATTTCATTGACTTTTTACATGCCTTTGTTGTTGCTATTAGTGTTATTCAACTCTTTTGCATTAC
AATACGCAATCAAAGTGGGAGGGAGCAATGAAATAGTGGCTAAATTTGGCATTATTGTAGCAATAGGAATTTCACTGACT
TTCATTCAAAAAGTCCCCGAAATGATTAACGCTATCTTTGGCACACAAGGTGGTCTAACGGATGCTAAAAGCTTCATATA
TCAAGGTGTGCAAATGGCTAGTGCTGGAGCTGGAGTCATAGCTGGAAGTCTTAAGAGTGTGGGTCGTTCAGCATTTGGTA
GAACGCTAGAAGCTTATAAAGACGCAAAATCTACGATAAACAGCACCACGGCTAACATGAGAGACATGCCAGGACATCCT
GGTGTTAGAGTGGGTGTGGAGACGATTGAACTTCCCAAGTCTCATAGAGCTAGCAAATGA

Protein sequence : 
MAIPLLALPFLSNPLVLGALAVIGVGAYLYSNKQDSLIVQADGLYSEILGFFISFSSKILKGIGEPLANVVQPFGMVLGV
LLILLYSFKRYQNNDLFEIKTFLMLFVFVGYLSLYHYAFKSDGSSSGNGRSSFAFQNHVTEIFDTPANLLNAGISNVVKE
YQTNSAREHKMDTHHSITNANISFHVRQILTSLNELYENFKINNGLSLKTLIAAVLLLVILGLELFLLFKVFCYVFTTYL
EKIIYLSLVIFMLVLGFFQQARGFLVSYVKKIISLTFYMPLLLLLVLFNSFALQYAIKVGGSNEIVAKFGIIVAIGISLT
FIQKVPEMINAIFGTQGGLTDAKSFIYQGVQMASAGAGVIAGSLKSVGRSAFGRTLEAYKDAKSTINSTTANMRDMPGHP
GVRVGVETIELPKSHRASK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
virb6 YP_002301075.1 VirB6 type IV secretion protein Virulence cag PAI Protein 2e-141 93