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Name : HPPC_07830 (HPPC_07830) Accession : YP_003927816.1 Strain : Helicobacter pylori PeCan4 Genome accession: NC_014555 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG3846 EC number : - Position : 1574568 - 1575830 bp Length : 1263 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCCGCTCCACTACTTGCTCTGCCCTTTCTTTCTAACCCTTTAGTGCTTGGTGCTTTAGCTGTCATAGGAATGGGTGC TTACTTGTATTCCAATAAGCAAGATTCTTTAGTTGTGCAAGCAGATGGGCTTTATAGTGAAATTCTTGGGTTTTTCATTT CGTTTTCTAGCAAGATCTTGAAAGGAATTGGTGAGCCTTTAGCCAATGTTATCCAACCTTTTGGTATGGTTTTAGGAGTG CTTTTAATCCTTTTGTATTCCTTTAAACGCTATCAAAACAATGATTTATTTGAAATCAAAACCTTTTTAATGCTTTTCGT GTTTGCAGGATACCTTTCTTTGTACCATTATGCTTTTAAATCTGATGGTTCTAGTAGCGGTAATGCCCGCTCCAGTTTTG CCTTTCAAAATCATGTAACAGAAATTTTTGATACGCCTGCTAACTTGCTAAATGCTGGGATTTCTAATGTGATTAAGGAA CATCAAACAAATAGTGCAGGAGAATATAAGAAGATAGACGCACGCCACAGCATCACTAACGCTAACATTTCATTCCATGT CAGACAAATTTTAACGAATTTGAATAAGCTATATGAAAAGTTCACAATTAATAATGGGCTATCATTAAAAACTCTTATTG CAGCTGTTTTATTATTGGTTATTTTAGGATTAGAATTGTTTTTATTGTTCAAAGTTTTCTGTTATGTTTTTATGACTTAT TTAGAAAAAATTATTTATTTGTCTTTGGTTATTTTCATGCTACCGCTAGGGTTTTTTCAGCAGACTAGAGGTTTTTTAGT GTCTTATGTGAAAAAAATTATTTCATTGACTTTTTACATGCCTTTGTTGTTGTTATTGGTGTTGTTCAACTCTTTTGCAT TACAATATGCAATCAAAGTGGGAGGGAGCAATGAAATAGTGGCTAAATTTGGCATTATTGTAGCAATAGGAATTTCACTG ACTTTCATTCAAAAAATCCCCGAAATGATTAACGCTATCTTTGGCACACAAGGTGGTCTAACGGATGCTAAAAGCTTCAT ATATCAAGGTGTGCAAATGGCTAGCGCTGGAGCTGGAGCCATAGCTGGAAGTCTTAAGAGTGTGGGTCGTTCAGCGTTTG GTAGAACGCTAGAAGCTTATAAAGACGCAAAATCTACGATAAACAGCACTGCGGCTAACATGAGAGACATGCCAGGATAT CCTGGTGTTAGAGTGGGTGTGGAGACAATTGAACTTCCCAAGTCTCATAGAGCTAGCAAATGA Protein sequence : MAAPLLALPFLSNPLVLGALAVIGMGAYLYSNKQDSLVVQADGLYSEILGFFISFSSKILKGIGEPLANVIQPFGMVLGV LLILLYSFKRYQNNDLFEIKTFLMLFVFAGYLSLYHYAFKSDGSSSGNARSSFAFQNHVTEIFDTPANLLNAGISNVIKE HQTNSAGEYKKIDARHSITNANISFHVRQILTNLNKLYEKFTINNGLSLKTLIAAVLLLVILGLELFLLFKVFCYVFMTY LEKIIYLSLVIFMLPLGFFQQTRGFLVSYVKKIISLTFYMPLLLLLVLFNSFALQYAIKVGGSNEIVAKFGIIVAIGISL TFIQKIPEMINAIFGTQGGLTDAKSFIYQGVQMASAGAGAIAGSLKSVGRSAFGRTLEAYKDAKSTINSTAANMRDMPGY PGVRVGVETIELPKSHRASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virb6 | YP_002301075.1 | VirB6 type IV secretion protein | Virulence | cag PAI | Protein | 3e-143 | 95 |
