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Name : HPPC_00710 (HPPC_00710) Accession : YP_003926441.1 Strain : Helicobacter pylori PeCan4 Genome accession: NC_014555 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 138958 - 140607 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTCGCACTTTCGCCTATTGCGCTTTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGCGCTTTCAATCCTTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCCGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATTGGTT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGCATCCCTATTACGGCGATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA GTTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATCCCTTTTTTCATTGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCCGTTACGGGCTTTAGCTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATTTGGGGCCACAGCTTCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATTGCTACCACTTTATTTTTAAAATT CTGGCAACCCAAACGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCAACGATCAGTGCAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATCATATGGACGCAACCTTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTGGTGTTCAAATTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTCGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCCAACACTTCCGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACGGTAAAATACTCCATCGCTTTGGCAATCATTATGGGGATTATTTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCCATCATTCCTAAATAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPTISAEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIIFTLIAYVFPFIIPIIPK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-128 | 56 |
