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Name : COB47_1302 (COB47_1302) Accession : YP_003840580.1 Strain : Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 Genome accession: NC_014392 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 1420968 - 1423421 bp Length : 2454 bp Strand : - Note : KEGG: ate:Athe_1254 leucyl-tRNA synthetase; TIGRFAM: leucyl-tRNA synthetase DNA sequence : ATGGAATATAATTTTAAAGAGATTGAAAAGAAGTGGCAGCAAAAATGGTTTTCACAGAACAAATACAAAGTATCAGAGGA CAGTCCAAAACCAAAATATTACGTCCTTGAGATGTTTCCATATCCTTCAGGAAAACTTCATATGGGGCATGTGAGAAACT ATTCAATTGGTGATGTTTTTGCACGTTTTATGAGGTTAAAGGGCTACAACGTTTTGCATCCGATGGGTTGGGATGCGTTT GGTCTTCCCGCTGAAAATGCTGCTATAAAACACGGAATTCACCCTTCTGATTGGACATGGTCAAACATTGAGAATATGAA AAGGCAGCTTATAGAACTTGGAATTAGCTATGATTGGGATAGAGAAGTAGCTACATGTCATCCGGATTATTATAAATGGA CTCAGTGGATGTTCTTGCAGTTTTATAAAGCTGGACTTGCTTATAGAAAGAGGTCATATGTGAACTGGTGTCCATCCTGT GAGACAGTGCTTGCAAATGAACAGGTTGTAAATGGAAGATGTGAAAGATGTAAATCACTTGTTGGTAAAAAAGATTTAGA GCAGTGGTTTTTTAGGATTACTAACTATGCCGAAAGGCTTTTACGTGATATAGAAAAACTTGATGGTTGGCCAGAGAAAG TAAAAATAATGCAGAAGAACTGGATAGGAAGAAGTGAAGGTGCAGAGATTGAGTTTGAAATTGAAGGCTTGGGTAAGAAA ATAAAAGTGTTTACTACAAGGCCTGATACCCTTTTTGGTGTCACATACCTTGTTTTGGCTCCAGAACATCCTTTAACAAA GGAGATAATAGCAGGAAAACCTCAGGAGAAAGAGTGTCTTGAGTTTATTGAAAAGATGCAATATCTAAATGAGATTGAAA GAACTTCTACAGAGACAGAAAAAGAGGGAAGGTTTACTGGTGGGTATGCTATCCATCCTCTAACAGGTGAAAGAGTGCCA ATATACATTGCAAACTATGTGCTGGTTGATTATGGAACAGGGGCTGTAATGGGTGTTCCAGCTCATGACCAGAGGGACTT TGAGTTTGCTAAAAAGTATAATCTTCCTATTAAAGTTGTGATAAAAGGTGAAGGTGTTGACATTGAAAATCTTCAGAGTG CTTATGAAGATGAGGGTGTTTTGATTAATTCTGGAATTTTTGATGGGCTTAAAAACACAGATGCTATGAAAAAGATAACA CAGTACCTGGAACAAAAAGGTTTTGGCAGGGCATGCGTAACGTATAAACTCAGAGACTGGTTAATATCCAGGCAACGTTA TTGGGGAGCTCCAATTCCTATTGTATATTGTGATGAATGTGGGATTGTTCCTGTACCTGAGGAAGATTTGCCTGTTTTGC TACCTTACAATGTTGAGTTCAAACCAACAGGCCAGTCACCACTTTCTTACTGTGAAGAGTTTGTTAACACCACATGTCCA AAGTGCGGAAGACCTGCAAAGAGAGAAACTGATACGATGGACACGTTTATATGTTCCTCGTGGTATTATTTTAGATACAC AGACCCCAAAAATGATCAAAAACCTTTCGAAAAATCGCTTGTTTCTTACTGGCTTCCTGTTGACCAGTATATTGGCGGGG TTGAACATGCTATATTGCATCTTCTATATTCGAGGTTCTTTACAAAGGTGCTATATGACCTTGGCTATGTACCTTTTGAA GAGCCTTTCAAGAACCTCTTGACGCAAGGCATGGTGTTAAAAGATGGAGCAAAGATGTCAAAATCGCTTGGAAATATAGT CAGTCCTGAAGACATAGTAGAAAAGTATGGAGCTGACACAGCAAGGCTGTTTATACTCTTTGCTGCACCGCCAGAGAGAG ATTTAGAGTGGTCAGACCAAGGGGTTGAAGGATGTTTTAGGTTTTTAAATAGGCTGTGGAGACTTTATATAGAACTTAAA AATAAACTTGCAGATGATAATCTTGTTGGTGAGTCTGAACTTGACGATGAACTAAGATATAGATTAAATTATACAATTAA AAAGGTCACAGAGGATATAGGAGAGAGGTTCAACTTTAACACTGCTATCAGTACTATCATGGAACTTTTAAATTTCTTGT ATGAGTATAAGGAGAGTGAAAAATTAAATAAAGATTTGATTATAGATACACTCAGGAATTTATTAATATTGATTTATCCA TTTACACCTCACATTGCATGTGAGCTATGGGAGATTATGGGGTTTGGTGAGGACATTGAAGAGGTAAGCTGGCCACAGTA TGATGAAGCTGCTCTTGTTCGAAAGAACGTAGAGATTGCTATTCAGGTAAATGGCAAGGTGAGGTCGAGGATGAATATCT CTGTAGATATGACCGAAGATGAAGTAAAACAGGCAGTTTTGAATGACCAAAAACTGAAATCACTTTTGGATGGAAAAGAA ATTGTGAAATTTGTGTACGTAAAAAATAGACTTGTTAACATCGTGGTGAAATAA Protein sequence : MEYNFKEIEKKWQQKWFSQNKYKVSEDSPKPKYYVLEMFPYPSGKLHMGHVRNYSIGDVFARFMRLKGYNVLHPMGWDAF GLPAENAAIKHGIHPSDWTWSNIENMKRQLIELGISYDWDREVATCHPDYYKWTQWMFLQFYKAGLAYRKRSYVNWCPSC ETVLANEQVVNGRCERCKSLVGKKDLEQWFFRITNYAERLLRDIEKLDGWPEKVKIMQKNWIGRSEGAEIEFEIEGLGKK IKVFTTRPDTLFGVTYLVLAPEHPLTKEIIAGKPQEKECLEFIEKMQYLNEIERTSTETEKEGRFTGGYAIHPLTGERVP IYIANYVLVDYGTGAVMGVPAHDQRDFEFAKKYNLPIKVVIKGEGVDIENLQSAYEDEGVLINSGIFDGLKNTDAMKKIT QYLEQKGFGRACVTYKLRDWLISRQRYWGAPIPIVYCDECGIVPVPEEDLPVLLPYNVEFKPTGQSPLSYCEEFVNTTCP KCGRPAKRETDTMDTFICSSWYYFRYTDPKNDQKPFEKSLVSYWLPVDQYIGGVEHAILHLLYSRFFTKVLYDLGYVPFE EPFKNLLTQGMVLKDGAKMSKSLGNIVSPEDIVEKYGADTARLFILFAAPPERDLEWSDQGVEGCFRFLNRLWRLYIELK NKLADDNLVGESELDDELRYRLNYTIKKVTEDIGERFNFNTAISTIMELLNFLYEYKESEKLNKDLIIDTLRNLLILIYP FTPHIACELWEIMGFGEDIEEVSWPQYDEAALVRKNVEIAIQVNGKVRSRMNISVDMTEDEVKQAVLNDQKLKSLLDGKE IVKFVYVKNRLVNIVVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 6e-173 | 45 |
