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Name : Acear_0340 (Acear_0340) Accession : YP_003826952.1 Strain : Acetohalobium arabaticum DSM 5501 Genome accession: NC_014378 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 370730 - 373348 bp Length : 2619 bp Strand : + Note : COGs: COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains; InterProIPR019760:IPR002298:IPR020045:IPR012337:IPR 002421:IPR008918:IPR001098:IPR018320:IPR020046:IPR020047; KEGG: hor:Hore_04860 DNA polymerase I; PFAM: DNA-directed DNA polymera DNA sequence : ATGGAAGATAAAAAAGAGCTATTCTTATTAGATGGAAGCAGTTTATTACATCGCGCCTTTTATGCTCTGCCTGAGAGTTT ACAGACTTCAGATGGTGAGTATACCAATGGCGTATTTGGATTTACTAAGATGCTTCTGCGTTTAATTGAGGAAGAAGATC CGGACAGTTTAGCTGTTGCTTTTGATCTGGCCGGTCCTACCTTTCGGCATGAAGAGTATGAAGAGTATAAGGCCAACCGC AAAGAAACGCCGGATAAATTGAAGCCGCAGTTTGGATTAATGAAAGAAGTTTTAGAGGCTTTCAGAATTCCAGTAGTAGA ATTAGAAGGATATGAAGCTGATGATATTATAGGGACTCTGGCCCGCCAGGCTGAAGAAGAAGGCTATCAGGTAACGATTG TAACCGGAGATCGAGATGCTCTTCAGTTAGTAACCGAGCAGACTAAAATAAGATATACTAAGCGGGGAATTACTAATATA GTTGATTATGATCTGGAAAAGGTAGAAGAAGAGTATGAATTAGAACCGCGGAAGTTAATCGATAAAAAAGGATTAATGGG GGATAAATCCGATAATATTCCAGGGGTTGACGGTATTGGAAAGAAGACTTCGACTAAGCTCCTCCATCAGTTCGGCAGTT TAGAGGAAGTATTGGATAATATTGATCAAGTATCAGGTAAGAAGAGAAAACAGACCTTAAAAGAACAGGCCGATAGAGCA AGGATGAGTAAGAAGTTAGCCACGATTAAGCTCGATGTACCGATAGAATGTGATTTAGATGAATTTAAGCTAGAAGAGCC TGATCAGGAGAAGTTAATTAATATTCTTAGTAGGTTGGAATTTAATAGTCTGTTGAAGGAATTTGGAGGCCATGAAACTC TTAATCTTACTGGTGGTTTCGAAGTTATTACCGATTTAACAGAGATAGATAGGGTATTGTCTATGCTTGATGAGGTAGAG AGCTTTGGGTTTAAATTCAATTTTGCCAGCACTAAACTGTATCAGCAGAAAGTAGAAGGCTTGACAGTAGCCAGTGATGA AGAAGCTTGCTATATCGATACTTCAGACTTAGATTTAGCTGAATTAATCGATAAACTGCAGCCTTATTTCGAGGATTATG AGCTTAATAAACTGAGTCTGAATACAAAAGAGAACCTAATTTATTTAAAAGAACAGGGAGTAGAAGTTAAAGGCATAAGC TTTGATCCACTACTGGCTGATTATCTTCTTCGTCCGTCGGCTAAAGAGCAGGACTTAGAGAGCATTCTAACTGATCAACT ACAGATGGAGCTAGAGAAGACAGAGAGTGAAGCTGAAACCGAAGTACAGCAGGTGCGGATTCTATTTAAATTACAGGATA AATTAACTGATAAGTTAGCCGATAAAGGTTTAATGGAACTCTTTATTGATGTAGAGCTGCCGTTGATTCCTATCCTGGCT CAGATGGAGCTGAATGGAATAGCAGTTGATCAGGATATGATTCAGGAATTATCAAATAAATTGGAGGAAAAGCTGGATTC GCTCCGCAGTCGGGCTTATGAATTAGCAGGAGAAGAATTCAATCTTAACTCTCCTAAGCAGTTAGGAGAGATTCTATTTG AGAAACTGGGGCTGCCGGTAATCAAACGGACTAAGACCGGTTATTCGACCAGTGCTTCAGTACTGGAAAAGCTAGAGGAT AAGCATGAGATTGTACCTTTGATTTTAGAATACCGTAAATACCAGAAGTTAAAATCAACCTATGTTGATCCGCTGCCAGA TCTAATTAATCCTAAGACGGAGCGGATTCACACTTCCTTTAATCAGTTGGTGACAGCTACTGGGAGGCTCAGCAGCACTG AACCCAATCTCCAGAATATACCGATTCGGACTGAGGAAGGTCGAAGGATTAGAAAGGTATTTGTAGCTGAGGAAAGAAAG GAATTATTGGCTGTTGATTATTCACAGATAGAATTAAGGGTTTTAGCCCATATTTCCCAGGATGAGAACCTGATTGCTGC TTATCGAGAGGGCCAGGATATCCATACCAAAACAGCAGCCGAAGTATTCGGCCTGGAAGCATCTGAAGTTAGCTATCAGC AGCGCCGTCGGGCTAAAGCAATTAATTTTGGAATTGCCTACGGTATAAGTCCCTGGGGATTAGCAAAAGATATTAATGTC AGCAAACAAGAGGCTGAAGATTACATAAATCAGTACTTAAACCGTTATCCTAAGGTCAAAGAGTATATGGACCACCAGAT CAAGCAGGCCAAAGAAGAAGGTTATGTAACTACTATTCTGAACCGCCGCCGCTATCTGCCGGAGATTAACAGCAGCAATT ATCACCGCCGCAGCTTTGGCGAACGAATGGCCATTAATACTCCGATTCAGGGCAGTGCAGCCGATATTATGAAGCTGGCT ATGCTGGAGTCGGCCCGAGTTTTAGATGAACGGGAACTGGATACGAAGATACTACTTCAGGTGCATGATGAATTGATCTT TGAAGTGCCGCCTGAAGAATTAGAAGAAGTCCAGCAGGTAATTAAAGCAGAGATGGAAGATGTAATTGAGTTGGATGTAC CGCTTAAAGTAGATCTCAAAGTTGGTTCTAACTGGCGGGATATGAATGAAGTCAAGTAG Protein sequence : MEDKKELFLLDGSSLLHRAFYALPESLQTSDGEYTNGVFGFTKMLLRLIEEEDPDSLAVAFDLAGPTFRHEEYEEYKANR KETPDKLKPQFGLMKEVLEAFRIPVVELEGYEADDIIGTLARQAEEEGYQVTIVTGDRDALQLVTEQTKIRYTKRGITNI VDYDLEKVEEEYELEPRKLIDKKGLMGDKSDNIPGVDGIGKKTSTKLLHQFGSLEEVLDNIDQVSGKKRKQTLKEQADRA RMSKKLATIKLDVPIECDLDEFKLEEPDQEKLINILSRLEFNSLLKEFGGHETLNLTGGFEVITDLTEIDRVLSMLDEVE SFGFKFNFASTKLYQQKVEGLTVASDEEACYIDTSDLDLAELIDKLQPYFEDYELNKLSLNTKENLIYLKEQGVEVKGIS FDPLLADYLLRPSAKEQDLESILTDQLQMELEKTESEAETEVQQVRILFKLQDKLTDKLADKGLMELFIDVELPLIPILA QMELNGIAVDQDMIQELSNKLEEKLDSLRSRAYELAGEEFNLNSPKQLGEILFEKLGLPVIKRTKTGYSTSASVLEKLED KHEIVPLILEYRKYQKLKSTYVDPLPDLINPKTERIHTSFNQLVTATGRLSSTEPNLQNIPIRTEEGRRIRKVFVAEERK ELLAVDYSQIELRVLAHISQDENLIAAYREGQDIHTKTAAEVFGLEASEVSYQQRRRAKAINFGIAYGISPWGLAKDINV SKQEAEDYINQYLNRYPKVKEYMDHQIKQAKEEGYVTTILNRRRYLPEINSSNYHRRSFGERMAINTPIQGSAADIMKLA MLESARVLDERELDTKILLQVHDELIFEVPPEELEEVQQVIKAEMEDVIELDVPLKVDLKVGSNWRDMNEVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 9e-148 | 42 |
