|
Name : Acear_1156 (Acear_1156) Accession : YP_003827743.1 Strain : Acetohalobium arabaticum DSM 5501 Genome accession: NC_014378 Putative virulence/resistance : Virulence Product : DNA mismatch repair protein MutS Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0249 EC number : - Position : 1239584 - 1242265 bp Length : 2682 bp Strand : + Note : COGs: COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family); InterProIPR005748:IPR007696:IPR000432:IPR016151:IPR 007860:IPR007695:IPR007861; KEGG: hor:Hore_11670 DNA mismatch repair protein MutS; PFAM: MutS III domain protein; DNA mismatch repair protein MutS doma DNA sequence : ATGGCTAAAGAATTAACTCCAATGATGCAGCAGTACTTTTCAATTAAAGATGAATATGATGATGCAATTTTATTATTTAG ATTAGGCGATTTTTATGAAATGTTTGCTGATGATGCTGAGTTAGCAGCTAGGGAACTAGAATTAACCTTAACTTCTCGAA ATAAAGGTAAAGGCAAGAAGACGCCGATGGCAGGCATTCCTTATCATTCAGCCGAATCATATATTGCTACCTTAATCGAT AAAGGCTATCGGGTTGCTATCTGTGAACAGGTAGAAGACCCCAGTGAAACCAACGGCTTAGTCAAGCGGGAAGTGGTTAG AGTAATTACCCCGGGAACTGTAATTGATAATGAAATGTTAGATGATAAGAATAATAATTATCTTTCAGCAGTTGTAGCTA ATGAAGAAGGTTTTGGTATTGCCACAATAGATATCTCGACCGGTGATTTTTCAACAACAGAACTGACAGGAGAAGAAGCT CAGTCTAATTTAATAGATGAATTGGCCCGCATAAATCCTGCGGAATGTTTAGTTGATACTAATTTATACGAAAAGACAGA GGTAATTACTTATATTAATCAGCAGTTAGATCCGATTATTAATGAAATCAAGGAACGATTTAATTATAGTCAGGCTTATG ATTTATTGATAGATCATTTTGAAGTTAATTCTTTAGATGGATTTGGCTGTGAAGATTTAAAGTTTGCTGTAACTGCTGCT GGAGCTGTACTAGATTTCTTAATTGAAACTCAAAAACGGACTTTAGGCCACTTAAATCAGTTAACTACCTACTCAACCAA GGATTATATGACTTTAGATGCCAATACGAGGCGGAATTTAGAACTGACAAAGACAATCCGTGACCAATCATATAAGGGGA GTCTACTCTGGGTATTAGATCAGACAGTCACAGCTATGGGAGGACGTAAGTTACAGAAGTGGTTAGAACAGCCGCTATTG GATGTAGAAGGAATTAATAACCGGTTGGATGCAGTTGGAGAGCTTAAGGATAATATCTTTCTTAAAGAGGAGCTAAAGGA TAATTTAACTGAAGTCTATGATCTTGAGCGGCTAATGAGTAAGATTACCTACGGTTCAGCCAATGCTAGAGACTTAATTG CTCTCAAAACTTCAATAGCCAATCTACCGGCGATTAAGGAATTATTAACTCAGTTTGAATCTTCTAAATTAAAATCGGCT GCTGATAAGTTAGATACTCTAGAAGATGTTCATGAATTAATTGAAAGTTCCATTAAAGAGGAACCGCCGACAACAGTAAC TGAAGGGGATATAATTAAAACAGGTTATGATGAAGAATTAGATGAATTTAGACAGGCTATGAATGAAGGAAAAGACTGGA TTGCTAATTTAGAAAAAGAGGAGAAGGAACGAACAGGAATTAAGTCATTAAAGGTTGGGTTTAATAAGGTCCACGGCTAT TATATAGAAGTAACTAAGGCTAATCTGGATTTAGTGCCTGATAATTATGAACGAAAACAGACTCTTTCTAACAGCGAAAG ATATATTACACCTGAACTAAAAGAAAAGGAGTCCAAAATTTTGGGCGCTGAAGAGAAAAGTGTTGAGTTAGAATATCAAT TATTTACTGAAATTAGAGAAAAGGTAGCCCAGGAGACGGAAAGAGTTCAGAAAGTAGCCGATATTGTAGCTCAACTAGAT GTGCTGGCTTCATTAGCAGAAGTAGCTATCAATAATAACTACTGTCATCCTGAGGTAAATGCCAGTGATGTGATTGATAT CGAGGACGGACGCCATCCTGTGGTTGAAGAGATGTTAGAAGAAGAAAGCTTTGTTCCTAATGATAGTTATATTGATTGTG ATCAGGACCGCTTTTTAATCATTACCGGTCCTAATATGTCCGGAAAGTCTACTTATATGCGTCAGGTGGCTTTAATGGTT TTAATGTCTCAAATCGGGAGCTTTATTCCAGCAGATGAAGCTAAAATAGGTATTGTAGATCGCATCTTTACCCGGGTAGG TGCTTCGGATGATTTAACTACTGGACAGAGTACTTTTATGGTGGAGATGAATGAGGTTGCTAATATTCTCAATAATGCTA CGCAGAATAGTCTTGTTATTTTAGATGAAGTCGGACGCGGAACTAGTACCTATGACGGTTTAAGTATTGCCTGGGCGGTA ACAGAATATATCAGTGATCAGAGCAATATTGGAGCTAAGTCGCTCTTTGCTACTCATTATCATGAGCTAACTGAACTGGA GTCTAAATTACCGGGGGTAAAGAATTACAATGTTGCTGTCAAAGAAGAAGGCAGTGATATCACCTTCTTACGAAAAATTG TACCTGGTAAAGCCAATGATAGCTACGGAATTGAAGTAGCTAAACGGGCCGGAGTGCCTAAGTCGGTAATTGATAGAGCC AATGAAGTTTTAGAAAAGCTAGAGACTGAGATAGATAATTATGAACAGATAAATAACAGTTTAGAGTCTGAGAAGGTAGC TGAAGCCAAAGCTGAAATTACATCAGAGTCTGAATTACAACAGCAGAACCAGTTGGCCTTATTTGCAGCCCAAAATAGCG AACTTATACAAAAGCTTGGTGAGTTAGATATTATGTCAATGACTCCTCTAGAGGCTATGAATAAACTCCACCAGCTACAA CAGGAAGCAAGGGAAGAGTTAAAGAGTCAGGAATTAGCTTAA Protein sequence : MAKELTPMMQQYFSIKDEYDDAILLFRLGDFYEMFADDAELAARELELTLTSRNKGKGKKTPMAGIPYHSAESYIATLID KGYRVAICEQVEDPSETNGLVKREVVRVITPGTVIDNEMLDDKNNNYLSAVVANEEGFGIATIDISTGDFSTTELTGEEA QSNLIDELARINPAECLVDTNLYEKTEVITYINQQLDPIINEIKERFNYSQAYDLLIDHFEVNSLDGFGCEDLKFAVTAA GAVLDFLIETQKRTLGHLNQLTTYSTKDYMTLDANTRRNLELTKTIRDQSYKGSLLWVLDQTVTAMGGRKLQKWLEQPLL DVEGINNRLDAVGELKDNIFLKEELKDNLTEVYDLERLMSKITYGSANARDLIALKTSIANLPAIKELLTQFESSKLKSA ADKLDTLEDVHELIESSIKEEPPTTVTEGDIIKTGYDEELDEFRQAMNEGKDWIANLEKEEKERTGIKSLKVGFNKVHGY YIEVTKANLDLVPDNYERKQTLSNSERYITPELKEKESKILGAEEKSVELEYQLFTEIREKVAQETERVQKVADIVAQLD VLASLAEVAINNNYCHPEVNASDVIDIEDGRHPVVEEMLEEESFVPNDSYIDCDQDRFLIITGPNMSGKSTYMRQVALMV LMSQIGSFIPADEAKIGIVDRIFTRVGASDDLTTGQSTFMVEMNEVANILNNATQNSLVILDEVGRGTSTYDGLSIAWAV TEYISDQSNIGAKSLFATHYHELTELESKLPGVKNYNVAVKEEGSDITFLRKIVPGKANDSYGIEVAKRAGVPKSVIDRA NEVLEKLETEIDNYEQINNSLESEKVAEAKAEITSESELQQQNQLALFAAQNSELIQKLGELDIMSMTPLEAMNKLHQLQ QEAREELKSQELA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | AAA80578.1 | DNA mismatch repair protein | Virulence | SPI-1 | Protein | 2e-142 | 43 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| Acear_1156 | YP_003827743.1 | DNA mismatch repair protein MutS | VFG0562 | Protein | 7e-156 | 44 |
