Name : sgaT (BP951000_1088) Accession : YP_003785579.1 Strain : Brachyspira pilosicoli 95/1000 Genome accession: NC_014330 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG3037 EC number : - Position : 1192535 - 1193806 bp Length : 1272 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTACAGGAATATTAAATTTTATAGTTTATGATTTATTAGGTACTAGTTCTATATTAGTTGGTTTTATAGCTATGTT TGGTCTTATCTTACAAAAGAAGAAATGGGATAAGGTTGTAATCGGTACTATAAAAACAATAGTTGGATTTATAATTTTTA GTGCTGGTTCTTCTTTGGCAACTAGTTCATTAAATTCTTTCCAAACTTTATTTACAAAAGCATTTAATTTGGAAGGAGTA TTACCTTTAGCTGAAGCTGTTACAGCATTGGCTCAAAATAAATTTGGACCTATAGTTGCTTTAATAATGGTTACCGGTTT TATAGCTAATTTAATAATAGCTAGATTAACTCCATTTAAATATATATTTTTAACAGGTCAGCACAATTTATATTTAGCAG CACTTTTAACTGTAATATTTAAAGCAAACGGTGTATCTGATGGTCTTACTATAGGATTGGGAGCTATTATATTAGGAGCT TCTGCAGCATTATTCCCTGCTATAGCACAAAGAGGTATGAAGAAAATTACTGGTGAAAATGAAATAGCTATGGGACACTA TGTTACATTAGCTTATGCTTTATCATCTTTCATAGGTTCTAAAGTTGGTAAACCAGAAGACAGTACTGAAAAATTAAAAT TACCTTCTTGGCTTATGATATTTAAAGATTATGTTGTTTCAGTAGCTTTATCTGTTGCAGTGTTCTATTATATATCAGCA TTTATGGCTGGTAAAGCAGAAGTTGAGGCTTTATCTGGAAATGTTAGCTGGATATTATTCCCATTTTTACAATCATTATC ATTTGCAGCTTCATTATTTATAATCATCACTGGTGTAAGAATGGTATTAGGTGAAATAGTTTCTGCATTTGTTGGTATTT CTGAAAAACTTATTCCTAATGCAAAACCTGCTTTAGACTGTCCTGTAGTATTCCAGTATGCTCCTACTGCTACTGTTATA GGATTCTTATCTGCTTATATAGGCGGTTTATTATGTATACCTGTATTTATAGCTTTAAAAACACCTGTGATCATACCTGT TGCTGTTCCTTATTTCTTCATAGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACAGGCGGTTGGAAAGGTGCTATTGCTG GAGGATTTATCACTGGTATACTTATAGCTGTTGGACCTGCTTTAATATACCCTATAATGAGTTCTATAGGTTTAACAGGT ACTTCTTTCCCAGAAACAGACTTTGTTAGTGTTGGTTTAATATTAAATGCTATATTAAGCATATTCAATTAA Protein sequence : MITGILNFIVYDLLGTSSILVGFIAMFGLILQKKKWDKVVIGTIKTIVGFIIFSAGSSLATSSLNSFQTLFTKAFNLEGV LPLAEAVTALAQNKFGPIVALIMVTGFIANLIIARLTPFKYIFLTGQHNLYLAALLTVIFKANGVSDGLTIGLGAIILGA SAALFPAIAQRGMKKITGENEIAMGHYVTLAYALSSFIGSKVGKPEDSTEKLKLPSWLMIFKDYVVSVALSVAVFYYISA FMAGKAEVEALSGNVSWILFPFLQSLSFAASLFIIITGVRMVLGEIVSAFVGISEKLIPNAKPALDCPVVFQYAPTATVI GFLSAYIGGLLCIPVFIALKTPVIIPVAVPYFFIGATAGVFGNATGGWKGAIAGGFITGILIAVGPALIYPIMSSIGLTG TSFPETDFVSVGLILNAILSIFN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 9e-91 | 46 |
unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 6e-91 | 46 |
vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 6e-91 | 46 |