Gene Information

Name : sgaT (BP951000_1083)
Accession : YP_003785574.1
Strain : Brachyspira pilosicoli 95/1000
Genome accession: NC_014330
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG3037
EC number : -
Position : 1188619 - 1189887 bp
Length : 1269 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGTATTAAAATTTTTAGTTGACTTACTTAGCCAAGCTTCAATACTTGTAGCTTTATTTACTATGGTAGGTCTTATTCT
ATTAAAAAAGCCTATTAATGAAATAATAGCAGGTTCTATGAAATCTTTAATAGGTTTTATTTTGCTTGGTGCTGGTGCTA
CAGTTATTACAACTTCATTAGCTCCTTTTGGAAATATGGTAGAGGTTGCTTTTAATGTTCAAGGTGTTGTGCCAAATAAT
GAGGCTATAGTATCTTTAGCATTAACAAAGTATGGTACTCAAGTTTCTATGGTTATGATACTTTCTATGATATTCCATAT
AATCATAGCTAAATTCTCACCATTGAAATTTATATTCTTAACAGGTCACCATATATTCTACATGGGTGTAATGATTACAG
TTATATTAGCAGTAGCAGGTTTAAGCGGTGTTACTCTTATAATAGCTGCTTCTTTAATAAATGCTCTTGCTATGAGTATT
TCTCCTTTATTAAGCTATTGGGCTATGCCTAAAGTTATAGGAGACAGCACTAGTCAGGTTGCTTTAGGTCACTTCTCTAA
CGTTACTTATAGTATTTCTGCTCTTATTGGTAAAATAGTGGGCGGAAATTCTCCTTCTGTTGAGGATTTAAAATTACCTA
AAGGTTTAAGCTTCATGAGAGATAATATACTTGCTATAGCTTTAACTATGTCTATTATTTATATTATAGTTGCTATTGCT
GCAGGAAGTGCTTATATAGAAAAAGAATTATCTAATGGTCAGAATTATTTAGTATTTGCTCTTATACAGGGTGTTACTTT
TGCTGCTGGTGTTTCTGTTGTATTATCTGGTGTTAGAATGATATTAGGTGAAATTATTCCTGCTTTCAAAGGTATATCTG
AAAAGATTGTTCCTAATGCTATACCTGCTTTGGATTGTCCTGTAGTATTCCCTTATGCTCCTAATGCTGTTTTAATAGGA
TTTATTACAAGCTTTATAGGCGGATTAGTTGGTTTGGCTATACTTGGTGCTGTAGGCGGCGTTTTAATTATACCTGGTGT
TGTACCGCATTTCTTTGTTGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACTGGCGGAAGAAGAGGCTGTATTATAGGTT
CTTTCATTAATGGTCTTCTTCTTGCTTTCCTTCCTATTATATTACTTCCTATACTTGGAGATTTAGGTTTCCAAAATACT
ACTTTCAGCGATGCTGACTTTGTAGCTGTGGGCGGTATTATAGGATTTATCACTAGCTTGATAAAATAA

Protein sequence :
MVLKFLVDLLSQASILVALFTMVGLILLKKPINEIIAGSMKSLIGFILLGAGATVITTSLAPFGNMVEVAFNVQGVVPNN
EAIVSLALTKYGTQVSMVMILSMIFHIIIAKFSPLKFIFLTGHHIFYMGVMITVILAVAGLSGVTLIIAASLINALAMSI
SPLLSYWAMPKVIGDSTSQVALGHFSNVTYSISALIGKIVGGNSPSVEDLKLPKGLSFMRDNILAIALTMSIIYIIVAIA
AGSAYIEKELSNGQNYLVFALIQGVTFAAGVSVVLSGVRMILGEIIPAFKGISEKIVPNAIPALDCPVVFPYAPNAVLIG
FITSFIGGLVGLAILGAVGGVLIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGCIIGSFINGLLLAFLPIILLPILGDLGFQNT
TFSDADFVAVGGIIGFITSLIK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 1e-84 54
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 8e-85 54
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 8e-85 54