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Name : CLJU_c18280 (CLJU_c18280) Accession : YP_003779992.1 Strain : Clostridium ljungdahlii ATCC 49587 Genome accession: NC_014328 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sugar transporter Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG2814 EC number : - Position : 1979968 - 1981335 bp Length : 1368 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATGTAAAAATTAATAGTGCGATGGTATATGTTTTTGGTGCACTTGGCGGTCTTTTATTTGGTTATGATACTGGAGT TATTTCAGGAGCAATCTTATTTATCCAAAAACAAATGAGTCTTGATTCATGGCAGCAAGGGTGGGTTGTTAGTGCTGTAT TAGTAGGAGCCGTTCTTGGAGCTGCAATTATTGGACCAATGTCAGATAGGTATGGACGTAGAAAGTTGATTTTGTTATCA GCAGTTATTTTCTTTATTGGAGCAATTGGGTCAGCATTTTCAACAGGATTTAGTACACTTATTATATCACGTATTATTCT TGGAATGGCAGTTGGTTCTGCATCAGCATTAATTCCAACATACTTAGCAGAATTATCACCTGCTGAAAAACGTGGATCTA TGTCAAGTTTATTTCAATTAATGGTTATGAGTGGAATATTATTAGCTTATATTACTAACTACAGTTTCTCAGGTTTATAT ACTGGTTGGCGTTGGATGCTTGGTTTTGCCGCTATTCCATCTGCAATACTTTTCTTAGGTGCTCTTGTATTACCAGAAAG TCCACGTTATTTAGTTAAAGATGGAAAGCTTGATAAAGCTAAAGAAGTTTTGGATCAGATGAATGAACATAATCAAAAAG CTGTTGATGATGAACTTGTTGAGATTAAGAAACAAGCTGAAATTAAAAGTGGTGGACTTAGCGAGTTATTCAGTAAATTT GTTCATCCAGCATTGGTTATTGCTGTTGGCTTAGCTATTTTTCAACAAGTTATGGGTTGTAATACAGTTCTCTATTATGC ACCAACTATTTTTACTGCTGTTGGTTTTGGTGTTCAAGCAGCTTTACTTGCTCACATCGGAATTGGAATTTTTAATGTTA TCGTTACAGCTGTAGCTGTTGCTATTATGGATAAAATTGATCGTAAAAAGATGTTGATTTACGGTGGCCTTGGAATGGGT GTCTCTTTATTAATTATGAGCTTCTCAATGAAATTGTCTAATGGCTCATTTATTGGTTCAATTATTTGTGTTATTGCATT AACCGTTTACATTGCTTTCTTCTCAGCTACCTGGGGACCTGTAATGTGGGTTATGATTGGTGAAGTATTCCCATTAAACA TTCGTGGATTAGGTAATTCATTTGGCAGTGTAGTTAACTGGGCTTCTAATGCTGTAGTGTCATTAACATTTCCAACATTA TTAAGTTTCTTTGGCACTGGTAATTTGTTCATAGGTTATGGTGTTATTTGTTTTGCGGCAATTTGGTTTGTTCATTACAA AGTGTTTGAAACACGTAATCGATCACTTGAAGAAATTGAAACTACTCTTAGAGTACGTGCTGGTGAACAAGGAAAGAAAG TTAGTTAA Protein sequence : MNVKINSAMVYVFGALGGLLFGYDTGVISGAILFIQKQMSLDSWQQGWVVSAVLVGAVLGAAIIGPMSDRYGRRKLILLS AVIFFIGAIGSAFSTGFSTLIISRIILGMAVGSASALIPTYLAELSPAEKRGSMSSLFQLMVMSGILLAYITNYSFSGLY TGWRWMLGFAAIPSAILFLGALVLPESPRYLVKDGKLDKAKEVLDQMNEHNQKAVDDELVEIKKQAEIKSGGLSELFSKF VHPALVIAVGLAIFQQVMGCNTVLYYAPTIFTAVGFGVQAALLAHIGIGIFNVIVTAVAVAIMDKIDRKKMLIYGGLGMG VSLLIMSFSMKLSNGSFIGSIICVIALTVYIAFFSATWGPVMWVMIGEVFPLNIRGLGNSFGSVVNWASNAVVSLTFPTL LSFFGTGNLFIGYGVICFAAIWFVHYKVFETRNRSLEEIETTLRVRAGEQGKKVS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0071 | YP_251986.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-65 | 42 |
