|
Name : pdhD (LEGAS_1378) Accession : YP_003772845.1 Strain : Leuconostoc gasicomitatum LMG 18811 Genome accession: NC_014319 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoyl dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1249 EC number : - Position : 1427014 - 1428423 bp Length : 1410 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGTTGTTGGTGCACAAGCGCGTGAAATTGATACAGTAGTGATTGGTTCTGGACCTGGTGGTTATGTTGCTGCGATTCG TGCGGCTGAGTTAGGCCAAAAAGTTACTATTATTGAACGGGATGCGATTGGTGGTGTTTGCCTAAATGTTGGGTGTATAC CATCAAAGGCTTTAATTAATGTTGGTCATCATTATCGTACAGCAACAGCGACAACACCTTTTGGTTTAACGACGACTGGG GCAGAGCTTGACTGGCATCAGGTTCAAGATTGGAAACAAAATAAAGTTGTTAATACTTTAACTAGTGGCGTTGAAATGTT GCTTAAAAAACATCATGTGGAAATCATTAAAGGCGAAGCAAGATTTAATGATAATGCGACACTAAACGTATTACAAGAAG ACGGCCATGAATTATTGCAGTTTAATAATGCTATTCTGGCAACTGGTTCGCGTCCAGTAGAATTAGCTAGCATGCCATTT GGTGGTCGAATTATTGATTCAACTGGTGTTTTGAGTTTGACTGATATACCAAAAAAGTTGATTATTGTGGGTGGTGGCGT GATTGGCTCTGAGTTAGGTGGGGCTTATGCTAATTTGGGAACGCAGGTGACAATCATTGAAGGTTTAGATCACACGTTAA ACGGCTTTGATCACGAAATGACTAAGCCGGTATTAAATGATTTCACAAGCCGTGGTGGTGTAATTGTGACGTCTGCAGTT GCTAAATCAGCAGAACAAACAACAGATGATGTGACATTAACCTATGAAGCTGCTGGTAAGGAACAAACGATCACCGGAGA TTATTTATTGGTGGCGGTTGGTCGCCGTGTGAATACGGACGATGTTGGACTTAATAATACAGATATTAAATTGTCAGATC ATGGTGTGATAGAAGTTGCTGATAATATGCAGACAAGTGTTGCACATATCTATGCGATTGGTGATATTACCGCAGGTCCA CAGCTTGCACATAAAGCTAGTTTTCAAGCAAAAATTGCGGCTGGTGCAATTGCAGAAGACCCACAAGCCCATGATTTACA CTATTCACTGCCTGCCGTGGCGTACACCAATTATGAGCTAGCCACAACTGGTGAAACACCAGATTCAGTAAAAGACCAAA ATCTTAATGCCAAAATTTCAAAATTTCCATTTGCTGGCAATGGACGTGCTATTTCTATGGATGAGACAGTTGGTTTTATT CGACTCATTAGTGATAAAGAGACACATGCGTTACTTGGGGGTCAAATTGTTGGACCAAATGCGTCAGATTTGATTTCTGA ATTATCCCTTGCAATTGAGAATGGTTTAACTACAAATGATATATCATTAACAATTCATCCACACCCAACACTGGGAGAAG CAATTATGGATACTGCCGAATTAGCTGATGGCTTACCAATTCATATTTGA Protein sequence : MVVGAQAREIDTVVIGSGPGGYVAAIRAAELGQKVTIIERDAIGGVCLNVGCIPSKALINVGHHYRTATATTPFGLTTTG AELDWHQVQDWKQNKVVNTLTSGVEMLLKKHHVEIIKGEARFNDNATLNVLQEDGHELLQFNNAILATGSRPVELASMPF GGRIIDSTGVLSLTDIPKKLIIVGGGVIGSELGGAYANLGTQVTIIEGLDHTLNGFDHEMTKPVLNDFTSRGGVIVTSAV AKSAEQTTDDVTLTYEAAGKEQTITGDYLLVAVGRRVNTDDVGLNNTDIKLSDHGVIEVADNMQTSVAHIYAIGDITAGP QLAHKASFQAKIAAGAIAEDPQAHDLHYSLPAVAYTNYELATTGETPDSVKDQNLNAKISKFPFAGNGRAISMDETVGFI RLISDKETHALLGGQIVGPNASDLISELSLAIENGLTTNDISLTIHPHPTLGEAIMDTAELADGLPIHI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE0077 | NP_763632.1 | dihydrolipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase E3 | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 3e-82 | 44 |
