Gene Information

Name : lctP1 (HPB8_1424)
Accession : YP_003729445.1
Strain : Helicobacter pylori B8
Genome accession: NC_014256
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : LctP family lactate transporter
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG1620
EC number : -
Position : 1392846 - 1394501 bp
Length : 1656 bp
Strand : -
Note : [KO:K03303] [TC:2.A.14], synonyms: L-lactate permease, TC.LCTP

DNA sequence :
GTGTCAGAATTTCATCAAGTCTATGACCCTTTGGGTAGTATTTGGCTGAGCGCTCTTGTAGCCTTATTGCCGATTTTGTT
ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTACACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCGTTATTG
CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTACGGCTTATGGCCGATC
GCTTGGATCATCATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGTGT
TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG
GGTTTGGAGGGCCTATTGCTATAACAGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCCGGATTGTGC
CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC
AGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATCGTGTTTTTAA
TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA
AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA
ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGG
TTTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTTCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT
GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC
CTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTCTCTTAATCAACACCGTAGGCACTTCCATTT
TTTTAGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGATTGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAAACTTTAAAA
GAAATGCGCTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC
TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGATTGGCTTTCACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA
CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGGTT
TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC
GGTGGGGTTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG
TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG

Protein sequence :
MSEFHQVYDPLGSIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAVIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI
AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC
LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL
SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKVYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF
EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKFLLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVIDALSVFGETLK
EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV
LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcA CAE85240.1 GlcA protein, putative glycolate permease Not tested PAI V 536 Protein 2e-100 52