Name : lctP1 (HPB8_1424) Accession : YP_003729445.1 Strain : Helicobacter pylori B8 Genome accession: NC_014256 Putative virulence/resistance : Unknown Product : LctP family lactate transporter Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 1392846 - 1394501 bp Length : 1656 bp Strand : - Note : [KO:K03303] [TC:2.A.14], synonyms: L-lactate permease, TC.LCTP DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTCTATGACCCTTTGGGTAGTATTTGGCTGAGCGCTCTTGTAGCCTTATTGCCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTACACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCGTTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTACGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATCATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGTGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GGTTTGGAGGGCCTATTGCTATAACAGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCCGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATCGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGG TTTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTTCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC CTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTCTCTTAATCAACACCGTAGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGATTGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAAACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGATTGGCTTTCACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGGTT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC GGTGGGGTTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGSIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAVIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKVYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKFLLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVIDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-100 | 52 |