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Name : CA2559_05510 (CA2559_05510) Accession : YP_003715865.1 Strain : Croceibacter atlanticus HTCC2559 Genome accession: NC_014230 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : - Position : 1245405 - 1247096 bp Length : 1692 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCAACTCTCTGAACAAGAAATCGTAAGACGCGAAAAACTAAGCCAACTGCGCGAGTTGGGCATTAATCCATATCCAGC AGATTTATATCCTGTCAAACAAACTACTGCAGATATTAAAAACAACTTTGAAGATGGTAAGAAAGTTGTAATTGCTGGGC GTTTATTACAGAAAAACATTCAGGGAAAAGCATCTTTTGGTCAATTGCAGGATAGCGCAGGTCGAATTCAAGTTTACTTT AACAGAGATGAAATTTGTGAAGGTGAAGACAAAACACTTTATAATACAGTATTTAAAAAGCTTTTAGATTTAGGAGACTT TATAGGTATTGAAGGTGAATTATTCACAACACAAGTTGGAGAAAAAACCGTAATGGTTAAGAATTTCTCCATCCTAAGTA AATCACTAAGACCTTTACCATTACCTAAAAAAGATAAAGATGGTAATGTGTATGATGAGTTTAATGATCCAGAGTTACGT TATCGCCAACGTTATGTAGACTTAGTAGTTAACCCAAAAGTAAAAGAAGTCTTTGTTAAACGTACAAAGCTTTTTAATGC TATGCGTAATTTCTTTAATGATGCTGGCTATTTTGAAGTTGAAACACCTATCCTACAACCAATTCCTGGCGGAGCTGCAG CAAAGCCATTTATATCTCACCACAATGCCTTAGACATACCTTTATATATGCGTATTGCTAATGAGCTCTATTTAAAGCGT CTTATTGTTGGTGGTTTTGATGGTGTGTATGAGTTTTCTAAAAACTTTAGAAACGAAGGTATGGACCGTACCCATAATCC AGAATTTACAGCGATGGAAATTTATGTAGCCTATAAAGACTACAATTGGATGATGGAGTTTACTGAAAATTTACTTGAAC ACTGTGCAGTAGCAGTAAACGGAAAAACAGAAGCTACTTTTGGAGAACACACCGTTAACTTTAAAGCACCTTATGCTAGA GTAACTATGACAGACTCCATAAAACACTTTACAGGTTTCGATATTTCTGGAAAAACTGAAAAAGAGCTTTACGAAGCTGC TAAAGGTATGGGTATCGATGTAGATGAAACTATGGGTAAAGGAAAGCTTATCGATGAGATTTTTGGAGAAAAATGTGAGG GCAACTATATACAACCTACATTTATTACAGATTATCCTAAAGAAATGAGTCCTTTATGTAAGGAACATAGAGACAATCCA GAATTAACTGAACGTTTTGAGTTAATGGTTTGCGGTAAAGAAATTGCAAATGCATATTCAGAACTTAATGACCCTATAGA TCAACGTGAACGTTTTGAGGCACAATTAAAACTTGCAGATCGTGGAGATGACGAGGCTATGTTTATAGATCAAGATTTCT TACGTGCTTTAGAGTATGGTATGCCACCTACTTCTGGTTTAGGTATTGGTATGGACCGTTTAATTATGTTCTTAACAAAC AACCAAAGTATACAAGAGGTTCTATTCTTTCCTCAAATGAAACCAGAAAAGACAATTTCTGTTGAACTTAATGAAGATGA AAAACTCATTTTTGAATTACTTAAAAAACAATCTCCAGCAGAGCTTGATAGTATAAAAGCAGATTCTGGTTTAAGTAACA AGAAATGGGACAAAGCTGTAAAAGGATTACGTGCTAAAGATGTGGCTACTGTTAATAAAACAGATAACGGTTTGTTCGTT GAACTTTTATAA Protein sequence : MQLSEQEIVRREKLSQLRELGINPYPADLYPVKQTTADIKNNFEDGKKVVIAGRLLQKNIQGKASFGQLQDSAGRIQVYF NRDEICEGEDKTLYNTVFKKLLDLGDFIGIEGELFTTQVGEKTVMVKNFSILSKSLRPLPLPKKDKDGNVYDEFNDPELR YRQRYVDLVVNPKVKEVFVKRTKLFNAMRNFFNDAGYFEVETPILQPIPGGAAAKPFISHHNALDIPLYMRIANELYLKR LIVGGFDGVYEFSKNFRNEGMDRTHNPEFTAMEIYVAYKDYNWMMEFTENLLEHCAVAVNGKTEATFGEHTVNFKAPYAR VTMTDSIKHFTGFDISGKTEKELYEAAKGMGIDVDETMGKGKLIDEIFGEKCEGNYIQPTFITDYPKEMSPLCKEHRDNP ELTERFELMVCGKEIANAYSELNDPIDQRERFEAQLKLADRGDDEAMFIDQDFLRALEYGMPPTSGLGIGMDRLIMFLTN NQSIQEVLFFPQMKPEKTISVELNEDEKLIFELLKKQSPAELDSIKADSGLSNKKWDKAVKGLRAKDVATVNKTDNGLFV ELL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 5e-94 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| CA2559_05510 | YP_003715865.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 3e-94 | 42 |
