|
Name : BMB171_C5054 (BMB171_C5054) Accession : YP_003667582.1 Strain : Bacillus thuringiensis BMB171 Genome accession: NC_014171 Putative virulence/resistance : Virulence Product : multidrug ABC transporter Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 5295400 - 5297709 bp Length : 2310 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCAAAATTGCATATACCCCCTTTTAAGGGAATATTTAGATATAATATTTAAGTGTAATATTTTAATATTAAGAAATGA GGCTGTGATTTTGTTTAAAAAAAAGTTTTCTTATATTAAGCAACAAGATTTAAAGGATTGTGGTCCGGCATGTCTAGCAA TGATTTCTCGTTATCATGGATTTAAGATGTCTATTTCTAAAATTAGGGAAATTGCTGGCACAGATTTAGAGGGAACTAAT ATAAAGGGGCTAATAGAAGCAGGAGAAAAATTGGGATTTGAAGTTAAAGCTGCAAAGGCAACAAAACCAGATGATTTAAA AGAAATACCATTACCTGCAATTGCTCATGTAATAGTCAATGGTGGCTTACTACATTATGTAGTTATTCATAAGGTTAAGG ATAATAAGATTTATATTGCTGATCCAGAGAAGGGATTAGTTACGTATCTAATTGAGGAATTTTGTCCAATGTGGACAGGT ATTCTTGTATTAATGAATCCTACGGAAAAATTTCAAAAGGGTAAAGAATCTCAAGGAACATTTTCTCGTTTTGCCTTGTT ATTAAAGCAGCAAACAAATTTACTAGTGCCCTTATTTTTCGCCTCAATTTTCTTTAATTTGTTTGGATTATTAGGTGCGT TTTATTTTAAATTCTTAATCGATGATATTGTGACGAACCAATTATTACAGACACTTCATATAGTATCAATTGGAATTATT ATATTATATATTTTCAAAGTGATACTTTCTTATTTTCGTACGCATTTAATTTTATATTTAAGTAGACGAATAGATATTCA ATTAATGCTGGGATATTATCGACACGTTGTAGGTTTACCAATGAATTTTTTCGAAACAAGAAAAGTAGGAGAAATTATTT CGCGATTTATGGATGCAAGTAAGATTCGAGATGCTTTATCAACTGTAACGGTGACCTTAATGATAGATACATTAATGGTC ACATTAGGAGCCATTTTATTATATATACATAGTCCACTATTATTTGGTGTGACTTTATTACTAGTACCCTTTTATATTGG TATTATTTTTGCTTTTCATAAGCCTTACCAATCTATTAATCGTAAAGAAATGGAGAGTAATGCAAAATTAAATTCCTACT TAGTAGAGTCATTAAATGGTATTTCGACAGTAAAATCATATAATGCGGAAAAAGAAGTGTTTTTTCAAACAGAAAATCGA TTTATCAATTTATTAAAGCATGTGTTTAAAAGAGGGATGTTATCTAATCTCCAAGGTTCCATTAAAGTAGGACTCGAGTT AATTGGTGGTACTTTAATTCTTTGGATTGGGGCTGTACAGGTATTAAAAGGAAATATGACGATAGGAGAATTAATTACTT ATAATGCTTTGTTAGCATATTTCTTAAATCCAATTGAAAATTTGATTGGTATACAGCCCACCATGCAATCAGCACTTGTC GCTGGAGAACGATTAAATGAAATTTTTGATTTAGATCAAGAGAAAAGTGGAGAAGAGGAGAATAAAGTATGTCCTAAACA ATTATCAGGTAAGATCCAATGTTTCAATGTTACATTCCGTTATGGAACACGTAAGAATGTATTAAATAACATCAGCTTTT CGATTGAACCAGGTAGTCAAGTAGCATTTGTAGGAGAGAGTGGATCAGGTAAAACAACAATTTCAAAACTATTGATGCAT TATTATGAATCCCAACAAGGTGATATATATTATGATGATTATCATATCAAAGAAATAAATCGTACAGCATTACGTGATAG GATTGCATTTGTTTCACAAGAATCCTTCTTTTTTAGTGCTACAATTTATGAGAATTTGTGCTTTGGTTTAGAACGTCCAG TCACTTTAGAGGAAGTTATACAAGTATGTAAACAAGCTTATGTACATGACTTTATTAGTGAATTACCATTACGTTATGGA ACGCTTTTAGAAGAAAATGCTTCAAATTTATCTGGTGGGCAAAGGCAGCGTTTAGCAATTGCACGAGCGTTATTAAAAAA ACCAGATATTTTAATGTTGGATGAAGCAACTAGTAATTTAGATTCCACAACTGAAAAGTATATTACCAATATGCTAAAAG ATTTAAGTTCACAAGGAGTTACAGTAATCATGATTGCCCATCGTTTAAGTACAGTTCAACATGCAAATCAAATTTTCGTG ATGGGACAAGGAGATATCATAGAGCGGGGCTCTCATATGGAGTTATTATCAAATAAAGAAGAATATTATCGTTTGTGGAA AAATCAAACCATTCATGTAGAACATACAGAATCTCAATCTTATGCAATGCGAGGTGTTCAGGATGAGTAA Protein sequence : MQNCIYPLLREYLDIIFKCNILILRNEAVILFKKKFSYIKQQDLKDCGPACLAMISRYHGFKMSISKIREIAGTDLEGTN IKGLIEAGEKLGFEVKAAKATKPDDLKEIPLPAIAHVIVNGGLLHYVVIHKVKDNKIYIADPEKGLVTYLIEEFCPMWTG ILVLMNPTEKFQKGKESQGTFSRFALLLKQQTNLLVPLFFASIFFNLFGLLGAFYFKFLIDDIVTNQLLQTLHIVSIGII ILYIFKVILSYFRTHLILYLSRRIDIQLMLGYYRHVVGLPMNFFETRKVGEIISRFMDASKIRDALSTVTVTLMIDTLMV TLGAILLYIHSPLLFGVTLLLVPFYIGIIFAFHKPYQSINRKEMESNAKLNSYLVESLNGISTVKSYNAEKEVFFQTENR FINLLKHVFKRGMLSNLQGSIKVGLELIGGTLILWIGAVQVLKGNMTIGELITYNALLAYFLNPIENLIGIQPTMQSALV AGERLNEIFDLDQEKSGEEENKVCPKQLSGKIQCFNVTFRYGTRKNVLNNISFSIEPGSQVAFVGESGSGKTTISKLLMH YYESQQGDIYYDDYHIKEINRTALRDRIAFVSQESFFFSATIYENLCFGLERPVTLEEVIQVCKQAYVHDFISELPLRYG TLLEENASNLSGGQRQRLAIARALLKKPDILMLDEATSNLDSTTEKYITNMLKDLSSQGVTVIMIAHRLSTVQHANQIFV MGQGDIIERGSHMELLSNKEEYYRLWKNQTIHVEHTESQSYAMRGVQDE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 56 |
| CPR_0658 | YP_697985.1 | lactococcin g processing and transport ATP-binding protein | Virulence | Not named | Protein | 2e-129 | 41 |
