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Name : Arnit_2527 (Arnit_2527) Accession : YP_003656683.1 Strain : Arcobacter nitrofigilis DSM 7299 Genome accession: NC_014166 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : 2.2.1.3 Position : 2519160 - 2521073 bp Length : 1914 bp Strand : - Note : COGs: COG0021 Transketolase; InterProIPR015941:IPR009014:IPR020826:IPR005478:IPR 005474:IPR005475:IPR005476; KEGG: abu:Abu_0182 transketolase; PFAM: Transketolase domain protein; Transketolase central region; PRIAM: Formaldehyde transketolase; SPTR: A8ER8 DNA sequence : ATGTCAAATAATTTACTTCAAAAACAAGCGGATACAATCAGATTCTTGGCTTCAGATATGGTTCAAAAAGCAAACTCAGG ACACCCAGGTGCACCTATGGGACTGGCTGACATTGCAACAGTATTGAGCAAACATTTAAATGTAAACCCAGCAAACTCAA AGTGGCTAAATAGAGATAGATTAGTTTTTTCAGGTGGTCATGCAACTGGATTAGTTTATTCATTATTACACCTTTGGGGA TTTGATGTAAGTATTGAAGATATCAAAAACTTCAGACAAACAAATTCAAGAACTCCAGGACATCCAGAATATGGACATAC TCACGGTATAGAAATCACAACTGGACCATTAGGACAAGGTATTGCAAATGCAGTTGGTTTTGCAATGGCAAGTAAATATG CAAAAAATCTTTTAAGTGAAGAAGTAATCAATCACAAAGTTTTTTGTTTATGTGGAGATGGAGATTTACAAGAAGGTCTT TCATATGAAGCAACTGCAACAGCAGGGCATTTAGGACTTGATAATTTAGTTATTATTTATGATTCAAACTCTATTACAAT CGAAGGTGATACTTCTATTGCTTGGAGTGAAGATGTTAAAAAAAGATTTGAAGCTATTGATTTTGAAGTATTAGAAATAG ATGGACATAATTTTACACAAATTGATGATGCTATTACAAAAGCAAAAACTGCAACTAAGCCAGTACTTATCATAGCAAAA ACTGCTATTGGAAAAGGTGCTGCTACTATGGAAGGAAGTCACCATACACATGGTGCTCCTTTAGGTGCTGATGAAATTGC TGCTTCTAAAGTAAAAGCTGGATTTGATCCAGAAGAGTCATTTTATGTATCTGATGAAGTAAAAGCTGCATTTGATAAAA CTACAACTGGGTCATTGATTGAAAAAGCTTGGGATGATTCTTTAAGTGTCCAATCAAAAGAGAAAATAGAGATGCTACAA AACCCTGATTTTGATTCTATTGATTATCCTGAATTTGAAGCTGATACAAGTGTAGCTACAAGGGATTCAAATCACAAAAT TCTAAATGCTATTTCTCAAGCTCTTCCTGGTTTTATGGGTGGAAGTGCAGATTTAGCACCTTCAAATAAAACAGAATTAA AAGGTGCTGGTGATTTTCCAGTTGGTAAAAATATTCACTTTGGTATCAAAGAACATGCTATGGCATCTATTTGTAATGCT ATGAATTTATATGGATTATTTAGAGTATTCTCTGCGACATTCTTTGTATTTAGTGATTATTTAAAACCAGCGGCTAGAAT AGCAGCACTGGCTTCCATTCCTCAACATTTTGTTTGGACTCATGATTCTATTGGTGTTGGAGAAGATGGACCAACTCACC AACCAATTGAGCACTTAACTCAATTTAGAGCATTGCCAAACTTTTATGTTTTTAGACCAGCAGATGCTACTGAGAATGTT GCTTCATGGAAAGTGGCATTAAAATTAAATGCTCCTTCTGCTTTTGTTTGTTCAAGACAAGGATTAAAAGTACTAAAAGA TGATAGAGCTTTTGGTGAAGTTGCAAATGGTGGGTACTTAGTTAAGAAGAGAGAAAATGCAACTGTTACAATTATGGCAT CAGGAAGTGAGTTAATGCTTGCTCTTCAAACTGCTTGTTCTTTAGAAGAAGAGGGTGTAATTGCAAATGTTGTTTCTGTT CCTTGTTATGATTTATTAGTTGAGCAAGAAAAAACATATATTGATACAATTATTGATCCAAATACTAAAGTTTTTGCTGT AGAGGCGGCAAGAGGTTTAGAGTATTATAAATTTGCTGATGTAGTTTATGGTATGGATACTTTTGGAGCTTCTGGTCCTG CAAATGATTTATTTGAACAATTTGGATTTACAATTCCAAAACTAAAAGCTAAAATTTTAGCTGACTTAAAATAA Protein sequence : MSNNLLQKQADTIRFLASDMVQKANSGHPGAPMGLADIATVLSKHLNVNPANSKWLNRDRLVFSGGHATGLVYSLLHLWG FDVSIEDIKNFRQTNSRTPGHPEYGHTHGIEITTGPLGQGIANAVGFAMASKYAKNLLSEEVINHKVFCLCGDGDLQEGL SYEATATAGHLGLDNLVIIYDSNSITIEGDTSIAWSEDVKKRFEAIDFEVLEIDGHNFTQIDDAITKAKTATKPVLIIAK TAIGKGAATMEGSHHTHGAPLGADEIAASKVKAGFDPEESFYVSDEVKAAFDKTTTGSLIEKAWDDSLSVQSKEKIEMLQ NPDFDSIDYPEFEADTSVATRDSNHKILNAISQALPGFMGGSADLAPSNKTELKGAGDFPVGKNIHFGIKEHAMASICNA MNLYGLFRVFSATFFVFSDYLKPAARIAALASIPQHFVWTHDSIGVGEDGPTHQPIEHLTQFRALPNFYVFRPADATENV ASWKVALKLNAPSAFVCSRQGLKVLKDDRAFGEVANGGYLVKKRENATVTIMASGSELMLALQTACSLEEEGVIANVVSV PCYDLLVEQEKTYIDTIIDPNTKVFAVEAARGLEYYKFADVVYGMDTFGASGPANDLFEQFGFTIPKLKAKILADLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-104 | 42 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 5e-95 | 41 |
