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Name : Bmur_0078 (Bmur_0078) Accession : YP_003632387.1 Strain : Brachyspira murdochii DSM 12563 Genome accession: NC_014150 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 97208 - 98878 bp Length : 1671 bp Strand : + Note : TIGRFAM: alpha,alpha-phosphotrehalase; PFAM: alpha amylase catalytic region; KEGG: bhy:BHWA1_00502 trehalose-6-phosphate hydrolase; SMART: alpha amylase catalytic sub domain DNA sequence : ATGAATTTTAAAAATAAAGTTGTTTATCAAATATATCCAAAATCATTTATGGACAGCAATAATGACGGACTTGGAGATAT AAGAGGTATAATATCAAAATTGGATTATTTGTCTGATTTAGGAATAGATATAATATGGACAACACCTTTTTTTGTTTCTC CTCAGAAAGATAATGGGTATGATGTTGCTGATTATTATAATGTTGATCCTTCTTATGGAACTATGGAAGATGCAGAGGAA CTTATAAGAGAAGCAAAGAAAAGAAATATAGATATAATGTTTGATATGGTATTTAATCATACTTCTACTGAGCATGAGTG GTTTAAAAAGGCTATAAATGGAATAGAAAAATATAAAAACTATTATATATTTAAAAAAGGCAGAATAATTAATGGGAAAA AAGAACCTCCTACTAACTGGATATCCAAATTTGGAGGCAGTGCTTGGCAGTATATAGAAAAATTTGATGAGTATTATTTG CATTTATTTGATGTTAGTCAGGCTGATTTAAATTGGGATAATGAAGAGGTTAGAAAAGAAATATTTGACATAGTAAATTT TTGGATAAGTAAAGGTGTTTATGGATTTAGATTTGATGTTATCAATTTAATATCTAAACCTAAAGTTTTTGAGGATGATT TTGAAAGTGACGGAAGACGCTTTTACACAGACGGAATAAATATACATAAATATCTAAAAGAATTAAATAAAAATACATTT GGTAAATATGATAATGCTGTAACAGTTGGAGAAATGTCATCAACAACCATAGAAAACTGCATTAAATATTCAGGTGAAAA AGAAAATGAACTTAGCATGGTATTTAGCTTTCATCATCTTAAAGTTGATTATAAAAATAAAGATAAATGGCAGTTAATGG ATTTTGATTTTCAGGAGTTAAAGAATATTTTATTTTCTTGGCAGGAAGGAATGCAAAGTAATAATGCCTGGTCTGCTTTA TTTTGGTGCAATCATGATCAGCCAAGAATAGTATCAAGATTCGGCGATGACCGAAAATATTATAAAGAATCAGCCAAAAT GCTTGCCTCTGTTATGCATTGTTTAAGAGGTACTCCTTATATTTATCAAGGTGAAGAAATAGGTATGACTAATGCTTATT TTGATAATATTAATCAATACAAAGATGTAGAGTCATTGAACTATTTTAATATACTTAAAAATAATGGAGTAGAAGAGAAA GAAATATATAAAATACTTCAAAGCAGATCAAGAGATAATGCTAGAACTCCTATGCAGTGGAATGATAAAAAGAATGCAGG ATTTTCAAATGCGGATACTTGGATAGAAATTATATATAATTATAAAGAAATAAATGCTGAAAATAATCTTAAAGATGAAG ACTCTATTCTTAATTATTATAAAAAATTAATAAGATTAAGAAAAGATTATAAAGTTATTTCAGAAGGCAAAACTATACCA ATATTAAAAGAAGATAAAAATGTACTCTCTTTTATAAGAGAATATAACAATGAGAAAATTTTGGTTATCAATAATTTTTA CGGAAATGAATGCACGGCAGATTTAAACGGCATTAATTTTAATATAAAAACTTCAAAGATTCTTATTTCAAATTATAATG ATGACTTAATACTTGATAATATTTTAAAGTTGAAGCCTTATGAATCAGTTTTATTATACAGTAAAAATTAG Protein sequence : MNFKNKVVYQIYPKSFMDSNNDGLGDIRGIISKLDYLSDLGIDIIWTTPFFVSPQKDNGYDVADYYNVDPSYGTMEDAEE LIREAKKRNIDIMFDMVFNHTSTEHEWFKKAINGIEKYKNYYIFKKGRIINGKKEPPTNWISKFGGSAWQYIEKFDEYYL HLFDVSQADLNWDNEEVRKEIFDIVNFWISKGVYGFRFDVINLISKPKVFEDDFESDGRRFYTDGINIHKYLKELNKNTF GKYDNAVTVGEMSSTTIENCIKYSGEKENELSMVFSFHHLKVDYKNKDKWQLMDFDFQELKNILFSWQEGMQSNNAWSAL FWCNHDQPRIVSRFGDDRKYYKESAKMLASVMHCLRGTPYIYQGEEIGMTNAYFDNINQYKDVESLNYFNILKNNGVEEK EIYKILQSRSRDNARTPMQWNDKKNAGFSNADTWIEIIYNYKEINAENNLKDEDSILNYYKKLIRLRKDYKVISEGKTIP ILKEDKNVLSFIREYNNEKILVINNFYGNECTADLNGINFNIKTSKILISNYNDDLILDNILKLKPYESVLLYSKN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-116 | 48 |
