Name : LKI_08995 (LKI_08995) Accession : YP_003622307.1 Strain : Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 Genome accession: NC_014136 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA-directed DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 1785456 - 1788143 bp Length : 2688 bp Strand : + Note : COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) DNA sequence : ATGACAAAAAAATTACTTTTAATTGATGGCAATTCATTAGCATTTCGTGCGTTCTATGCTATGTATAATCAACTGGATCG CATGATTTCACATAAGGGGTTGCACACAAATGCGCTTGTAGCTTTTAATAATTTCCTAGATCAAATTGTGGATCCAATGC AACCAGATTTGGCGGTTGTTGCTTGGGATGCGGCATCTGGTAAGGAAACTTTTCGTGGCGAATTATTTCCAGAATACAAG GATGGCCGTTCAAAAACACCATCGGAATTTCAAGAACAATTCCCATACTTACGTGAAATGGTAGCTTTGCACGGATTACG TAACTATGAGCAACCTGGTTTAGAAGCAGATGATATCATTGGCACTTTTTCAAGAATGGGAGAAAAAGCAGGGTATTCGG TCACAATTATCACAGGTGATCAGGACTTAACTCAATTAGCAACTGAAAAGGTGACCGTTAATGTTACTAAAAAAGGTGTA ACAGAAATTGAGCAATATACACCAAGCTATATTATGGATAAGTTTGGACTAAAGCCATTACAAATTATTGAGAAAAAAGC GTTGACTGGTGATACATCAGATAATTATCCAGGTGTGACCAAGGTTGGTGAAAAAACAGCTTTGAAATTACTGACTGAGT ATCACGATATTGATAATTTATACGCGCATATTGATGATATGAAGCAATCTAAATTGAAAGAAAATCTTATCAAGGATCGT GAAGCAGCCTTCTGCGCACGTCAGTTGGCAACGATTTTAACCGATGCTACCTTAGAATTGCCTTTAGAAGAAATTGAATA TCGGCATATTGATTATGATAAGTTGGTCACGTTTTACGAGGATTTAGACTTTAAGCAACAATTAGCAAAAATAAAAGCGC TTCAAAAATCTGGCCAAATTATAGGTAGTCAAACGCAAACATCTGTTGAGAAAGCGATTAATGTTGTTACATTACAGGAA GATAATTTACAAGCAGTTGCGATGCTAGGTAATAAAATAGCATTACATATAGAAATGGCTGGGTCGAATTATCATATTGA TGACATGATTGGCTTTGTAATAGGCAGTCCGGCGACAGGTTACTATGGCAGTCGCGATGTATCGTTACTACAAAGACCAG AACTTAGATCAGTGATTGAAAATGCAGCCATTATCAAAAATGTGTTCAACGTCAAAGCGCAATTTGTATTGTTTAAACGT CTTGGCATGACATTAAGAGGCGTTGAATTTGATTTCTTATTAGCTGCGTATTTACTTGATACAACTGATAATGATAACGA GTTATCGACGTTGGCACAGCGATTTGATTTTTACGTCACACCTGATGAAGATATCTATGGGAAAGGTGCCAAATATGCTG TACCCGAAGAGACATCACGAGTGCTCGTACATTTAGCGCACAAAGCAGATGTTTTGATGCAACTCGAACAGCCTGCTTTT GCTGCGTTGCAAGATCATGAACAAACACATCTATATACCGAAATAGAATTACCGCTTGCGCATGTATTGGCTGATATGGA ATATCGTGGGATTAAAATTGACCAGACACGATTACGTGAGATTGGAACTGATCTTGAGGAACGCATTGATACCATAAAAG AAGCGATATTCATTGAAGCAGGTGAAGTTTTTAATATTAATTCTCCAAAACAGCTTGGTATTCTCCTGTTTGAGAAAATG GGCTTGCCAGTAATTAAGAAAACAAAAACTGGCTATTCAACCGCTGTAGATGTATTAGAAAAACTGGCGCCACAGGCACC CATTGTTGATCACATCTTACAGTATCGGCAACTAGCTAAATTGAAATCTACTTATGTTGATGGCTTATTATCAGTTGTAC ATGAAAAAGACAGTAAAATTCATACACGATTTTTGCAAACATTAACACAAACTGGGCGGCTGTCATCAATTGACCCTAAT TTGCAAAATATTCCGATGCGAACAGAGGCAGGTCGAAAAATTAGAACAGCATTTGTTCCTAGTCAACCAGACTGGCAAAT TTTTGGCGCAGATTATTCACAAATCGAATTGCGTGTTTTAGCACATATGACTGGCGATAAAAATATGCAGCAGGCCTTTT TAAATGGTGAAGATATCCACGCAGAAACAGCTCGTGCAGTGTTCGGTCTAGATGATAACGTGCCAGTAGACCCATTGATG CGGCGGACGGCAAAAGCAGTTAATTTTGGTATTGTTTATGGCATATCTGATTTTGGGTTAGCTAACAATTTAGGTATTTC ACGTGCTGAAGCGAAACGTTTTATCGAGACTTATTTTCAGGAGTTCCCTAAAATTCACGAGTGGATGACTCAAATTAAAG CAAAGGCCCATGAACAAGGGTTCATAGAAACAATTGCTAAACGTCGACGATATTTACCAGAAATTGGTTCAAAAAATTTC AATTTGCGAAGTTTTGCAGAACGTACGGCTATGAATTCACCCATACAAGGATCTGCAGCAGATATTATTAAAATTGCAAT GATTAAAGTGGCTGATGCACTACAAGAAAATGGCATGCAAGCACGTATGCTATTACAGGTGCACGATGAACTTATTTTTG AAGCACCTAGCGATGAGATAGCGGAATTATCTGAATTGGTTACGCGTGTGATGGATTCTGCCGTGGTGTTGGATGTACCC ATGCTCGTCGAAAGTCATTCTGGCAACACATGGTATGAAGCAAAATAG Protein sequence : MTKKLLLIDGNSLAFRAFYAMYNQLDRMISHKGLHTNALVAFNNFLDQIVDPMQPDLAVVAWDAASGKETFRGELFPEYK DGRSKTPSEFQEQFPYLREMVALHGLRNYEQPGLEADDIIGTFSRMGEKAGYSVTIITGDQDLTQLATEKVTVNVTKKGV TEIEQYTPSYIMDKFGLKPLQIIEKKALTGDTSDNYPGVTKVGEKTALKLLTEYHDIDNLYAHIDDMKQSKLKENLIKDR EAAFCARQLATILTDATLELPLEEIEYRHIDYDKLVTFYEDLDFKQQLAKIKALQKSGQIIGSQTQTSVEKAINVVTLQE DNLQAVAMLGNKIALHIEMAGSNYHIDDMIGFVIGSPATGYYGSRDVSLLQRPELRSVIENAAIIKNVFNVKAQFVLFKR LGMTLRGVEFDFLLAAYLLDTTDNDNELSTLAQRFDFYVTPDEDIYGKGAKYAVPEETSRVLVHLAHKADVLMQLEQPAF AALQDHEQTHLYTEIELPLAHVLADMEYRGIKIDQTRLREIGTDLEERIDTIKEAIFIEAGEVFNINSPKQLGILLFEKM GLPVIKKTKTGYSTAVDVLEKLAPQAPIVDHILQYRQLAKLKSTYVDGLLSVVHEKDSKIHTRFLQTLTQTGRLSSIDPN LQNIPMRTEAGRKIRTAFVPSQPDWQIFGADYSQIELRVLAHMTGDKNMQQAFLNGEDIHAETARAVFGLDDNVPVDPLM RRTAKAVNFGIVYGISDFGLANNLGISRAEAKRFIETYFQEFPKIHEWMTQIKAKAHEQGFIETIAKRRRYLPEIGSKNF NLRSFAERTAMNSPIQGSAADIIKIAMIKVADALQENGMQARMLLQVHDELIFEAPSDEIAELSELVTRVMDSAVVLDVP MLVESHSGNTWYEAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 50 |