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Name : LKI_07950 (LKI_07950) Accession : YP_003622098.1 Strain : Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 Genome accession: NC_014136 Putative virulence/resistance : Unknown Product : betaine ABC transporter permease and substrate binding protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 1559633 - 1561339 bp Length : 1707 bp Strand : + Note : COG4176 ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component DNA sequence : ATGCCTAATTTACCTAAGATACCGTTAGAAAATTGGATTAGTGATATTGTCAGTTGGTTAACAACGCATTTATCAGGGTT ATTCAATTTGATGCAAAAGGGTGGACAAAATGTTATGGACGGCATAACAAACGGTTTAACAGCTGTTCCGATGCCGTTGA TGATAATTGGTTTAACGCTTATAGCTGTATTAACAACACGAAAAAAATACGGTTTCCCAATATTTACCTTTATTGGATTA GCATTGATTGCTAATCAAAATTTGTGGTCTGACCTAATGAGTACAGTGACATTGGTGATCATGGCGTCCGTCATATCGCT TGTTATTGGTATTCCGTTAGGAATTTTAACTGCTAAGTCTCCTAAAACAGCAGCGATAGTGAAGCCAATTCTAGACTTTA TGCAGACAATGCCTGGCTTCGTCTATCTGATACCAGCTGTTGCATTCTTTGGTATTGGTGTTGTACCCGGCGTGTTTGCT TCGATTATTTTCGCCTTACCACCAATGGTTCGAATGACTGATTTAGGTATTCGTCAAGTACCAATTGCTTTAGTTGAGGC TGCTGATTCGTTTGGATCAACAACATGGCAAAAATTGATTAAGCTCGAATTACCTAATGCACGTAATACCATTTTAGCTG GTGCTAACCAAACAATCATGTTAGCATTGTCGATGGTTGTTACAGCTTCTATGATTGGGGCCCCTGGTCTTGGACGTGGT GTCTTGTCTGCTGTACAACGTGCTGATGTGGGTTCTGGATTTGTTAACGGATTAGGGTTAGTTATTTTAGCTATTATTAT TGATCGTTTTACTCAAAAGTTAAATACAACACCTGGTCAGAAATCAATTAGTAAACCTTGGCGTCGATGGGCCGTACTAG CTACGGTAGTTGTGATGATTGGTGGCGGCGTTGTGAATGCCATGACATCACATAAAACGACAGGCCAAAAAGTGACATTA GGGTATGTTGCATGGGACTCTGAGGTTGCTTCAACAAATGTGCTTGCGCAATCGTTACGTCAACATGGCTATGACGTTAC CATGACGCCCCTGGATAATGCTGTTTTATGGCAGTCAGTAGCTAATGGTCAAGTTGATGCATCTGTGAGTGCTTGGCTAC CATACACGCATAAAGCATTGTATGACAAGTATAAGAATGATATATCATTACTTGGACCTAATCTTCATGGTGCCAAAACA GGGTTCGTCGTACCTGATTATATGAAAGTAAATTCAATTGCTGACTTGAAAAATGAAGCTAATAAAACAGTAACTGGGAT TGAGCCCGGAGCAGGTGCTATGATAACCGCACAAAAGACGGTTGATAGTTATCCTAATCTTAAAGGATGGCAACTGTCGT CGTCATCTTCAGGCGCCATGACTACTGCGCTTGATAAAGCATATAAGGCAAAACAAGATATTATTGTGACGGGTTGGTCA CCTCATTGGATGTTTAGTAAGTATAAGTTAAAGTATTTAGAAGATCCAAAAGGTACAATGGGTAAGAATGAAACAATTAA TACCATTGTGCGTAAGGATTTGAAGCATGATAATCCTAAATTTGAAAAAGTGATGAATAAATTCAATTGGACGAAAGACG ACATGGAAAGTGTCATGCTTGACATACAAAATGGTCAATCACCAGAACAAGCTGCAAATAAATGGTTGAAATCACATGCC AAATTGGCCGATAGTTGGTACAAGTAA Protein sequence : MPNLPKIPLENWISDIVSWLTTHLSGLFNLMQKGGQNVMDGITNGLTAVPMPLMIIGLTLIAVLTTRKKYGFPIFTFIGL ALIANQNLWSDLMSTVTLVIMASVISLVIGIPLGILTAKSPKTAAIVKPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGVFA SIIFALPPMVRMTDLGIRQVPIALVEAADSFGSTTWQKLIKLELPNARNTILAGANQTIMLALSMVVTASMIGAPGLGRG VLSAVQRADVGSGFVNGLGLVILAIIIDRFTQKLNTTPGQKSISKPWRRWAVLATVVVMIGGGVVNAMTSHKTTGQKVTL GYVAWDSEVASTNVLAQSLRQHGYDVTMTPLDNAVLWQSVANGQVDASVSAWLPYTHKALYDKYKNDISLLGPNLHGAKT GFVVPDYMKVNSIADLKNEANKTVTGIEPGAGAMITAQKTVDSYPNLKGWQLSSSSSGAMTTALDKAYKAKQDIIVTGWS PHWMFSKYKLKYLEDPKGTMGKNETINTIVRKDLKHDNPKFEKVMNKFNWTKDDMESVMLDIQNGQSPEQAANKWLKSHA KLADSWYK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 5e-151 | 57 |
