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Name : cyoB (RIEPE_0167) Accession : YP_003603045.1 Strain : Candidatus Riesia pediculicola USDA Genome accession: NC_014109 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.10.3.- Position : 167008 - 169023 bp Length : 2016 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00115; match to protein family HMM TIGR02843 DNA sequence : ATGTTTGGCAAGCTCACTCTAAAATCGATTCCAACACATGAACCAATTATAATGGTTACGATGGCAATTGTATCTTTGAT TATTTTTTTTGTTCTATTTTTAATTACTTACACGAAGAGATGGAATTGGTTGTGGAGCGAATGGTTAACAAGCTTAGATC ATAAAAAAATTGGAGTTATGTATATTATTGTTTCTATAGTAATGTTATTTCGTGGATTTACAGATGCAATATTAATGAGA ACACAACAAACTATAGCTTCAACCAATTTTTTGGGAGGGAACGGATTCCTTTCATCAGATCATTATAATCAAATTTTTAC AGCTCATGGAGTGATAATGATATTTTTTATGGCTATGCCTTTAGTCATTGGATTAATGAATATTATTGTTCCTTTGCAAA TCGGATCTAGAGATGTTGCGTTTCCTCGTCTAAATTCTATTAGTTTTTGGATTTTTTTATCTAGTGTAATTTTAATGAAC TTATCTTTTTTTATCGGAGAATTCGCTAAAACTGGATGGCTAGCCTATCCTCCATTATCTGAAAAAAATTACAGTCCAGA TGTTGGAGTAGACTACTGGATATGGAGTTTGCAAATAGCTGGAGTTAGTACGACTTTGAATGGAATTAATCTAATTACTA CAATTTTAAAGATGAGAGCGGAAGGAATGTCTATGATGAAAATTCCAGTTTTTACATGGACTGTTCTTTGTTCGAACATA TTAATTGTCGCTTCTTTTCCCATATTAACCTCTACAATCGCATTGTTATCTATGGATAGATATTTAGGAGCACATTTTTT TACTAACGATGGAGGAGGAAATATGATGTTATACATAAATTTAATATGGGCTTGGGGGCATCCTGAAGTATATATATTGA TATTGCCTGCGTTTGGAATTTTTTCAGAAGTTACTTCTACCTTTTGCAGAAAAAGTATATTTGGATATCAATCCTTAGTT TTAGCCACCGTTGCAATTACTGTAATGTCTTTTATGGTTTGGTTACATCATTTCTTTACAATGGGATCTGGTGCAAAAGT TAATTCAATTTTTGGAATTGCAACAATGATTATTGCGATTCCAACTGGAGTGAAGATGTTTAATTGGTTATTTACCATGT TTAAGGGAAATATATCTTTTCGAAGTCCTATGTTATGGACGTTGGGATTCATAATAACATTCACAGTAGGAGGTGCTGCT GGAGTTCTTTTATCTATTCCATCAGCAAACTTTTTTTTACACAATAGTTTATTTTTAGTTGCTCATTTCCATAACGTGAT TATAGGAGGAGTGGTATTTGGATGTTTTTCTGGTATTACATATTGGTTTCCGAAAGTTTTTGGATTTTTACTAAATGAAA AAATTGGAATTTTATCTTTTTCTTTATGGATAATAGGATTTTTATTAGCTTTTGTTCCACTATATTTTTTAGGACTGGAT GGGATGACTAGAAGATTGAGTCAACATATAAATCCTAGATATCATCTTTTATTATCCGTAGCATGTTTCGGAACCATTAT TATAGCGATTGGAATTTTATGTCAAATAATTCAAGTGATATACAGTTGTTTAAACAAAAATATGGATGTTACTGGAGATC CTTGGAATGGAAGAACATTAGAATGGTCAATTCGTTCTCCTGCTCCAGTTTATAACTTTGCTTTTCTTCCGAAAGTAAAG AGTCGTGATGATTGGTGGGAAATAAAAAAATCAAGAAAAAGAATGCAAGAGATGAAAAAAAGAAGATCCAAAGGTTATCG TTCTATATGTCTTCCAAATAGATCTTTTTCTGGAATATTGATCGGATTTTCTTGTCTTATTTTTGGGTTTTCAATGGTAT GGTATATATGGTGGATGGCGATATTTGGAATGAGTCTTATTTTAGTTTTTTCCATTCATTCTTTTTTGACAAAAGAAAAG ATGGTTTATATTGATTCCAAAGATGTTCAAAGAATAGAAGAACCTCTTAAAAATGTAAAGAATGTGTATGACATTAGGAG GACTGATGCTTTTTGA Protein sequence : MFGKLTLKSIPTHEPIIMVTMAIVSLIIFFVLFLITYTKRWNWLWSEWLTSLDHKKIGVMYIIVSIVMLFRGFTDAILMR TQQTIASTNFLGGNGFLSSDHYNQIFTAHGVIMIFFMAMPLVIGLMNIIVPLQIGSRDVAFPRLNSISFWIFLSSVILMN LSFFIGEFAKTGWLAYPPLSEKNYSPDVGVDYWIWSLQIAGVSTTLNGINLITTILKMRAEGMSMMKIPVFTWTVLCSNI LIVASFPILTSTIALLSMDRYLGAHFFTNDGGGNMMLYINLIWAWGHPEVYILILPAFGIFSEVTSTFCRKSIFGYQSLV LATVAITVMSFMVWLHHFFTMGSGAKVNSIFGIATMIIAIPTGVKMFNWLFTMFKGNISFRSPMLWTLGFIITFTVGGAA GVLLSIPSANFFLHNSLFLVAHFHNVIIGGVVFGCFSGITYWFPKVFGFLLNEKIGILSFSLWIIGFLLAFVPLYFLGLD GMTRRLSQHINPRYHLLLSVACFGTIIIAIGILCQIIQVIYSCLNKNMDVTGDPWNGRTLEWSIRSPAPVYNFAFLPKVK SRDDWWEIKKSRKRMQEMKKRRSKGYRSICLPNRSFSGILIGFSCLIFGFSMVWYIWWMAIFGMSLILVFSIHSFLTKEK MVYIDSKDVQRIEEPLKNVKNVYDIRRTDAF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-74 | 41 |
