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Name : polA (LCRIS_01531) Accession : YP_003602003.1 Strain : Lactobacillus crispatus ST1 Genome accession: NC_014106 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase i Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 1540617 - 1543280 bp Length : 2664 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGCTGATAAAAAATTACTTCTAATCGATGGTAACTCCGTAGCTTTTAGAGCCTTCTATGCACTTTACCGCCAACTAGA ATCATTCAAGAGCCCAGATGGTTTGCATACTAATGCCATTTATGCTTTTAAAAATATGCTCGATGTACTCTTAAAAGATG TTGATCCGACTCATGTGTTGGTGGCTTTTGATGCGGGCAAAGTAACTTTTAGAACTAAAATGTACGGTGACTACAAGGGT GGTCGGGCTAAGACGCCAGAAGAGTTGTTAGAACAAATGCCGTATATTCAAGAGATGCTACATGATCTTGGTATTAAGAC TTATGAATTAAAAGATTATGAAGCCGATGATATTATTGGTACTTTTGCTACTAAGGGTGAAGAAAATGGCTTTACTACGA CAATTGTAACTGGAGACCGTGACTTAACCCAACTTGCTTCAGACAAAACGACTGTTGAAGTAACTAAGTCTGGTGTGTCA CAGCTTGAGGCTTATACTCCTGAACATATGAAGGAAGTAAATGGTGTAACGCCAACTGAATTCATTGATATGAAGGCTTT AATGGGAGATTCATCGGATAATTATCCAGGCGTTGAGGGGATTGGTCCTAAGACAGCTTCTAATCTAATCCAAAAATATC ATACTGTTGAGAATCTTTATGATCATATTGATGATTTGAAAGCTTCAAAACGAAAAGAACGTTTGATTCGCGATAAACAC AATGCTATTTTAGGCAAAAAACTGGCTACAATTGATCGTCATTCTCCAGTGACAATTGATATTGATGACGTTAAGCGTCA ACCAATTGATTATGAAAAATTACGCCAATTCTATGAAAAGATGAATTTCCGTAAGTTCTTGGCAGAACTGAATGCTAGCG GTCAAGGCCAAGATGCAACTGAAGTAGAAAAAGTTGAATACACAGTTCTTGATGACCAAAATGTCAAGGAAATCAAAGCT AATGCAGATGACCAAATTGAATTTTATCTTGCTATGCTAGGTGCTAACTATCACCTTGCTCCATTTGTCGGTTTTGCTTT AAAAATCAATGATCAAATTTACGTTTCACGAGATGTTGAACTTTTACAAGAGACTAATTTGCGACATTTATTAGAAGATG AGCAAATTAAGAAAAATGTCTTTGATTTAAAGCGGACAATGGTTGGCTTACATCGATTAGGTATCCATGTTCACGGTCAA GATTATGATATGTTGTTAGCTTCATATTTGATCAATAATGAAAATAATTCCAATGATCTAGGTGAAATTGCTCACTTGTA TGGTGATTATTCAGTTAAAACCGATATAGAAATCTATGGAAAAGGCAAAAGTGAGCATGTTCCTGATGACGATGAAGAAC TATTTAATCATTTGGCTTCAAAGGTTAATGCTATCGAAAACTTGAAGCAGCCACTACTTGAGAAGCTTAAGGAACACGAA CAAGATGACTTGTTTGATACAATCGAAATTCCGACTGCTCGTGTATTAGCCCGGATGGAAATCAACGGAATGAAAGTGGA GGCAAGTACTCTGCTCGAACTGCAAAATGAATTTGCTGTTCGGTTAAAAGAGCTGGAGGATAAGATCTATCAACAAGCAG GCGAGCGCTTTAACTTGAATTCACCTAAGCAATTAGGCCATATTTTGTTTGAAAAGCTTAACTTGCCAGTAATTAAGAAG ACTAAAACAGGTTATTCAACTTCTGTTGAAGTGCTGGATCAGTTAAAGACACAAAGTCCAATTGTTAGTGAAATTTTGGA TTACCGTCAAATTGCTAAGATTCAATCAACCTATGTTAAAGGCTTGCTTGATGTAATTCAGCCGGATGGACGAGTACATA CGCGTTATTTGCAAACCTTAACAGCAACTGGACGTTTGTCTAGTGTGGATCCTAATTTGCAAAATATTCCTACTCGAACT GAGGAAGGAAAGCAAATCAGGAAGGCCTTTGTGCCAACAGAGCCGGATGGCTATATCTTTTCTTGCGATTATTCGCAGGT TGAGTTGCGGGTATTAGCACATGTTTCCGGTGATCAGAATATGCAAGAAGCCTTTAAGACAGGCTATGATATTCACTCAC ATACAGCAATGAGAATTTTTCATTTAGATTCACCGGATGAAGTAACGCCATTGATGAGGCGTCATGCTAAAGCCGTTAAC TTCGGTATTGTTTATGGTATTTCTGATTATGGTTTATCAAAGAATTTAGGTATTTCTAGAAAACGTGCTCAAGAGTTTAT TGACAATTACTTTGAACAATATCCACAAATTCGTGAATATATGGATAAGGCTGTGCAAACGGCTCGTGAAAAGGGCTATG CAGAAACAATTATGCACAGAAGACGCTACTTGCCTGATATTCATGCTAAGAAATTTACAGTTCGTTCTTTTGCTGAAAGA ACTGCGATTAACTCGCCTATTCAAGGATCAGCGGCCGATATTATCAAGATTGCTATGATCAATATGCAAAAGAAGCTAGA TGAACTACATTTGAAGACCAAGATGGTCGTTCAAGTACATGACGAATTGATTTTTGATGTGCCAAAAGATGAATTAGAAA CGATTAAGAAGATAGTTCCAGAAGTTATGCAATCGGCAGTGAAGCTTGATGTGCCATTGATTGCAGATTCTGGTTGGGGT CATAATTGGTATGATGCAAAGTAG Protein sequence : MADKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLESFKSPDGLHTNAIYAFKNMLDVLLKDVDPTHVLVAFDAGKVTFRTKMYGDYKG GRAKTPEELLEQMPYIQEMLHDLGIKTYELKDYEADDIIGTFATKGEENGFTTTIVTGDRDLTQLASDKTTVEVTKSGVS QLEAYTPEHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDSSDNYPGVEGIGPKTASNLIQKYHTVENLYDHIDDLKASKRKERLIRDKH NAILGKKLATIDRHSPVTIDIDDVKRQPIDYEKLRQFYEKMNFRKFLAELNASGQGQDATEVEKVEYTVLDDQNVKEIKA NADDQIEFYLAMLGANYHLAPFVGFALKINDQIYVSRDVELLQETNLRHLLEDEQIKKNVFDLKRTMVGLHRLGIHVHGQ DYDMLLASYLINNENNSNDLGEIAHLYGDYSVKTDIEIYGKGKSEHVPDDDEELFNHLASKVNAIENLKQPLLEKLKEHE QDDLFDTIEIPTARVLARMEINGMKVEASTLLELQNEFAVRLKELEDKIYQQAGERFNLNSPKQLGHILFEKLNLPVIKK TKTGYSTSVEVLDQLKTQSPIVSEILDYRQIAKIQSTYVKGLLDVIQPDGRVHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRT EEGKQIRKAFVPTEPDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDQNMQEAFKTGYDIHSHTAMRIFHLDSPDEVTPLMRRHAKAVN FGIVYGISDYGLSKNLGISRKRAQEFIDNYFEQYPQIREYMDKAVQTAREKGYAETIMHRRRYLPDIHAKKFTVRSFAER TAINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVVQVHDELIFDVPKDELETIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSGWG HNWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 54 |
