Gene Information

Name : recG (LCRIS_01318)
Accession : YP_003601790.1
Strain : Lactobacillus crispatus ST1
Genome accession: NC_014106
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ATP-dependent DNA helicase recg
Function : -
COG functional category : L : Replication, recombination and repair
COG ID : COG1200
EC number : -
Position : 1327419 - 1329455 bp
Length : 2037 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGATTGATAATGCATTATTTGCTCCTGTCACAGACTTAAAGGGTGTAGGGACAAAGACTACAGCTGCATTAGGAAGCTT
AGGCATCTATAGTATTTATGATTTGCTTTTTTACTTTCCTTTTCGTTATGACGAATTACAAACATTACCGTTAGATCAAA
TCATGGATGGTCAAAAAGTAATGCTGAAGGGAATAGTAGCCACTGAAGCGTTTGTTAGTCGTTTTGGCTATAAGAAAACG
CGCTTAAGTTTCAAGATGAGAATTGACCATGATGTGATCATGGTCAATTTTTTTAATCAGCCGTGGTTAAAAAATAAAAT
TGAGATCGGACAAGAAGTAGCTATTTATGGTAAATACAATGTTGCCCGGCAAAGTTTAACGGCCTTTAAATTCGTAGCAG
CCAAAGAAAATGATAGTGGTATGGCGCCGATTTATCCGGTTAATCGACATGTTAAGCAAAAAAAATTAGTAGATCTAATT
AATGTGGCTATTGACGATTTTATTGATCAAGTGCAGGATATTGTTCCGGAAAAGTTGCGGCAAGAATATCGTCTTTTAAA
AGACCAAGTAATTATTGAAAAAATGCACCACCCTAAGAATAGTCATGAGGCTGAACTAGCTAAGAGAAGTGCAATTTTTC
GTGAGTTTTTTATTTTTGAATTACAATTAGCTTTATTGACCCGTAATGATGGTAAACAAATGGGTTATGCAAAGAAATAC
GATCTGACAGAAATTGCTCAATTAACTAAATCTCTGCCATTTGAATTATCAGATGATCAAAAGCATGTGGTTAATGAAAT
CTTTGCTGATATGCATTCTGATGGTCAAATGCGGCGACTTTTGCAGGGTGATGTTGGTTCTGGAAAAACTGTTGTAGCCG
TTTATGCGATTTTTGCAGCCATTACAGCTGGCTATCAGGCGGCTTTGATGGTGCCAACAGAAATTCTGGCAACTCAGCAT
TTCAAAAAAATCGATGAATTGTTGCGTCCTTTAGGTGTGCGAGTAGCTCTTTTAACAGGCAATACAAAAACACTGGAGCG
GCGTGAGATCTACTGTGAATTAACTGATGGCACGATTAATGTGGTAATTGGCACTCATGCTTTAATTCAAGATAGTGTTA
TCTTTAAAAAATTAGGTCTAGTCATTATTGATGAGCAGCACCGTTTTGGTGTAGGACAACGACAAGCTTTGATTAATAAA
GGCGATCAACCGGATATTTTGGCAATGACTGCTACGCCAATCCCGCGGACGCTGGCTTTGACAGTTTATGGTGATATGAC
AGTCTCTGAAATACATCATTTACCAGCCGGAAGAAAGCCAATTATTTCCACATGGAAAACAAGTAGTCAAATGAAGGAAG
TCTATCGACAAATGCAAGAGCAGCTAAATCAAGGCTTTCAGATTTACGCTGTGACACCATTGATTACTGAGTCAGAGACG
TTAGACTTAAAAAATGCAGAAGAATTGCATGAAAAATTGAGTCACGATTTTCCTGATCAAAAGGTAGTCCTACTTCATGG
GCAAATGCCAGGTGCACAAAAAGATGAAATAATGGCTGCATTTGCAGCTGGTGAGATTAATATTTTAGTGACTACTAGTG
TGATTGAAGTTGGGGTCGATGTAGCCAATGCGAATATGATGGTAATTTACAATGCTGATCGCTTTGGTTTGAGCCAATTG
CACCAATTGCGTGGTCGAATTGGTCGAGGACGAACACAAAGTTATTGTGTCTTTCTAGCTGATCCTAAGACCGATTCAGG
TAAAGCAAGAATGAAAATTATTGCGTCGACCAATGACGGCTTCAAATTAGCTGAAGAAGATTTAAAGATGCGCGGTGAAG
GTGATTTGTTTGGTAAGGCTCAGTCAGGATTGCCAGAATTTCGTGTGGGTGATGTAGTAAATAACTACAATACATTGGTC
GTTGCGCAAAAAGAAGCACGAGCTTTGGTTGCGGCTGATCCTGATTTATCAGATCCAGGACATAAGGCACTTAAGCAAGT
GCTAGAATATAAGCAATTAGAGCAAAACAGAATTTAG

Protein sequence :
MIDNALFAPVTDLKGVGTKTTAALGSLGIYSIYDLLFYFPFRYDELQTLPLDQIMDGQKVMLKGIVATEAFVSRFGYKKT
RLSFKMRIDHDVIMVNFFNQPWLKNKIEIGQEVAIYGKYNVARQSLTAFKFVAAKENDSGMAPIYPVNRHVKQKKLVDLI
NVAIDDFIDQVQDIVPEKLRQEYRLLKDQVIIEKMHHPKNSHEAELAKRSAIFREFFIFELQLALLTRNDGKQMGYAKKY
DLTEIAQLTKSLPFELSDDQKHVVNEIFADMHSDGQMRRLLQGDVGSGKTVVAVYAIFAAITAGYQAALMVPTEILATQH
FKKIDELLRPLGVRVALLTGNTKTLERREIYCELTDGTINVVIGTHALIQDSVIFKKLGLVIIDEQHRFGVGQRQALINK
GDQPDILAMTATPIPRTLALTVYGDMTVSEIHHLPAGRKPIISTWKTSSQMKEVYRQMQEQLNQGFQIYAVTPLITESET
LDLKNAEELHEKLSHDFPDQKVVLLHGQMPGAQKDEIMAAFAAGEINILVTTSVIEVGVDVANANMMVIYNADRFGLSQL
HQLRGRIGRGRTQSYCVFLADPKTDSGKARMKIIASTNDGFKLAEEDLKMRGEGDLFGKAQSGLPEFRVGDVVNNYNTLV
VAQKEARALVAADPDLSDPGHKALKQVLEYKQLEQNRI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
recG CAJ77039.1 ATP-dependent DNA helicase Not tested AbaR1 Protein 3e-95 46