Name : recG (LCRIS_01318) Accession : YP_003601790.1 Strain : Lactobacillus crispatus ST1 Genome accession: NC_014106 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase recg Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : - Position : 1327419 - 1329455 bp Length : 2037 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGATAATGCATTATTTGCTCCTGTCACAGACTTAAAGGGTGTAGGGACAAAGACTACAGCTGCATTAGGAAGCTT AGGCATCTATAGTATTTATGATTTGCTTTTTTACTTTCCTTTTCGTTATGACGAATTACAAACATTACCGTTAGATCAAA TCATGGATGGTCAAAAAGTAATGCTGAAGGGAATAGTAGCCACTGAAGCGTTTGTTAGTCGTTTTGGCTATAAGAAAACG CGCTTAAGTTTCAAGATGAGAATTGACCATGATGTGATCATGGTCAATTTTTTTAATCAGCCGTGGTTAAAAAATAAAAT TGAGATCGGACAAGAAGTAGCTATTTATGGTAAATACAATGTTGCCCGGCAAAGTTTAACGGCCTTTAAATTCGTAGCAG CCAAAGAAAATGATAGTGGTATGGCGCCGATTTATCCGGTTAATCGACATGTTAAGCAAAAAAAATTAGTAGATCTAATT AATGTGGCTATTGACGATTTTATTGATCAAGTGCAGGATATTGTTCCGGAAAAGTTGCGGCAAGAATATCGTCTTTTAAA AGACCAAGTAATTATTGAAAAAATGCACCACCCTAAGAATAGTCATGAGGCTGAACTAGCTAAGAGAAGTGCAATTTTTC GTGAGTTTTTTATTTTTGAATTACAATTAGCTTTATTGACCCGTAATGATGGTAAACAAATGGGTTATGCAAAGAAATAC GATCTGACAGAAATTGCTCAATTAACTAAATCTCTGCCATTTGAATTATCAGATGATCAAAAGCATGTGGTTAATGAAAT CTTTGCTGATATGCATTCTGATGGTCAAATGCGGCGACTTTTGCAGGGTGATGTTGGTTCTGGAAAAACTGTTGTAGCCG TTTATGCGATTTTTGCAGCCATTACAGCTGGCTATCAGGCGGCTTTGATGGTGCCAACAGAAATTCTGGCAACTCAGCAT TTCAAAAAAATCGATGAATTGTTGCGTCCTTTAGGTGTGCGAGTAGCTCTTTTAACAGGCAATACAAAAACACTGGAGCG GCGTGAGATCTACTGTGAATTAACTGATGGCACGATTAATGTGGTAATTGGCACTCATGCTTTAATTCAAGATAGTGTTA TCTTTAAAAAATTAGGTCTAGTCATTATTGATGAGCAGCACCGTTTTGGTGTAGGACAACGACAAGCTTTGATTAATAAA GGCGATCAACCGGATATTTTGGCAATGACTGCTACGCCAATCCCGCGGACGCTGGCTTTGACAGTTTATGGTGATATGAC AGTCTCTGAAATACATCATTTACCAGCCGGAAGAAAGCCAATTATTTCCACATGGAAAACAAGTAGTCAAATGAAGGAAG TCTATCGACAAATGCAAGAGCAGCTAAATCAAGGCTTTCAGATTTACGCTGTGACACCATTGATTACTGAGTCAGAGACG TTAGACTTAAAAAATGCAGAAGAATTGCATGAAAAATTGAGTCACGATTTTCCTGATCAAAAGGTAGTCCTACTTCATGG GCAAATGCCAGGTGCACAAAAAGATGAAATAATGGCTGCATTTGCAGCTGGTGAGATTAATATTTTAGTGACTACTAGTG TGATTGAAGTTGGGGTCGATGTAGCCAATGCGAATATGATGGTAATTTACAATGCTGATCGCTTTGGTTTGAGCCAATTG CACCAATTGCGTGGTCGAATTGGTCGAGGACGAACACAAAGTTATTGTGTCTTTCTAGCTGATCCTAAGACCGATTCAGG TAAAGCAAGAATGAAAATTATTGCGTCGACCAATGACGGCTTCAAATTAGCTGAAGAAGATTTAAAGATGCGCGGTGAAG GTGATTTGTTTGGTAAGGCTCAGTCAGGATTGCCAGAATTTCGTGTGGGTGATGTAGTAAATAACTACAATACATTGGTC GTTGCGCAAAAAGAAGCACGAGCTTTGGTTGCGGCTGATCCTGATTTATCAGATCCAGGACATAAGGCACTTAAGCAAGT GCTAGAATATAAGCAATTAGAGCAAAACAGAATTTAG Protein sequence : MIDNALFAPVTDLKGVGTKTTAALGSLGIYSIYDLLFYFPFRYDELQTLPLDQIMDGQKVMLKGIVATEAFVSRFGYKKT RLSFKMRIDHDVIMVNFFNQPWLKNKIEIGQEVAIYGKYNVARQSLTAFKFVAAKENDSGMAPIYPVNRHVKQKKLVDLI NVAIDDFIDQVQDIVPEKLRQEYRLLKDQVIIEKMHHPKNSHEAELAKRSAIFREFFIFELQLALLTRNDGKQMGYAKKY DLTEIAQLTKSLPFELSDDQKHVVNEIFADMHSDGQMRRLLQGDVGSGKTVVAVYAIFAAITAGYQAALMVPTEILATQH FKKIDELLRPLGVRVALLTGNTKTLERREIYCELTDGTINVVIGTHALIQDSVIFKKLGLVIIDEQHRFGVGQRQALINK GDQPDILAMTATPIPRTLALTVYGDMTVSEIHHLPAGRKPIISTWKTSSQMKEVYRQMQEQLNQGFQIYAVTPLITESET LDLKNAEELHEKLSHDFPDQKVVLLHGQMPGAQKDEIMAAFAAGEINILVTTSVIEVGVDVANANMMVIYNADRFGLSQL HQLRGRIGRGRTQSYCVFLADPKTDSGKARMKIIASTNDGFKLAEEDLKMRGEGDLFGKAQSGLPEFRVGDVVNNYNTLV VAQKEARALVAADPDLSDPGHKALKQVLEYKQLEQNRI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 3e-95 | 46 |