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Name : SVI_1494 (SVI_1494) Accession : YP_003556243.1 Strain : Shewanella violacea DSS12 Genome accession: NC_014012 Putative virulence/resistance : Virulence Product : nucleotide sugar epimerase Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG0451 EC number : - Position : 1708041 - 1709045 bp Length : 1005 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAGTATCTTGTAACAGGTGTAGCCGGTTTTATTGGATCATGTGTTGTGGAACGACTGACAGAGCAAGGACATAAAGT CATTGGGATCGATAATGTTAATGATTATTATGATACTAATTTAAAAAATTCTCGTTTAAAACGTGCTGAGCATAAAAACT TTAAATTTATAAAAAATGATTTAGCAGATAGAGCAGCTATGGCCACTTTATTTACTGAGCATCAGTTTGATCGTGTTATC CATCTAGCTGCACAAGCTGGTGTTCGCTACTCGATAGAGAACCCTATGGCTTATGCTGATTCTAATTTAATCGGTCACCT CAATATTTTAGAAGGTTGTCGAAATACTAAAGTTAAGCACTTGGTTTACGCCTCTTCAAGTTCGGTTTATGGCCTTAATA GTAAAGTGCCATTCTCAACATCTGATACAGTAGATCACCCTATATCGCTATATGCGGCCACTAAAAAGTCTAATGAGTTG ATGGCTCACTCTTATTCTCATTTGTATGATATTCCAACGACTGGCTTGCGATTCTTTACTGTATATGGCCCATGGGGGCG TCCGGATATGGCTCCTTATATCTTTACTAAAAAGATATTATCAGGTGAAACTATCGATATTAATAATAATGGTGATATGT GGCGCGACTTTACTTACATCGATGATATTGTTGAAGGTGTAATTCGCATTGTTGATGTAATACCTACTCGAGATGATACT TGGAAAGTTGAAGATGGTTCACCTGCCTCAAGTTCCGCTCCATATAGTATTTATAATATTGGTCATGGTAGCCCAATCAA TTTAATGAAATTTATTGAAGCGATTGAAACTGAGTTGGGTATTGAGGCTAAAAAGAATTTCCGTGGTATGCAAGCTGGTG ATGTTTATCAAACTTATGCTGACACGCAAGATTTATTTGAAGTAACAGGTTATAAACCAAAAGTTGGTGTGGCTGAAGGC GTTGCTAAGTTAGTGAGTTGGTATAAAGATTTTTATAAGGTATAG Protein sequence : MKYLVTGVAGFIGSCVVERLTEQGHKVIGIDNVNDYYDTNLKNSRLKRAEHKNFKFIKNDLADRAAMATLFTEHQFDRVI HLAAQAGVRYSIENPMAYADSNLIGHLNILEGCRNTKVKHLVYASSSSVYGLNSKVPFSTSDTVDHPISLYAATKKSNEL MAHSYSHLYDIPTTGLRFFTVYGPWGRPDMAPYIFTKKILSGETIDINNNGDMWRDFTYIDDIVEGVIRIVDVIPTRDDT WKVEDGSPASSSAPYSIYNIGHGSPINLMKFIEAIETELGIEAKKNFRGMQAGDVYQTYADTQDLFEVTGYKPKVGVAEG VAKLVSWYKDFYKV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cap1I | AAA64648.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 5e-89 | 57 |
