Name : DEFDS_0082 (DEFDS_0082) Accession : YP_003495350.1 Strain : Deferribacter desulfuricans SSM1 Genome accession: NC_013939 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ammonium transporter Amt family Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0004 EC number : - Position : 92227 - 93528 bp Length : 1302 bp Strand : + Note : TC 1.A.11 The Ammonia Channel Transporter (Amt) Family DNA sequence : ATGGAGGATTTAAGCATGAAAAGGTTTTTAATTAGTTTGTTCTTTATTTTTACTTTTAGCTGTTTTGCTTTTGCTAATGA TAATCAAACAATAAATTGGGTAGATACTGTGTGGATGATTGTGGCTACTGCATTTGTTATGCTTATGACTCCAGCTGGAC TTGCTTTATTTTATGGAGGGATGACAAGGACAAAAAATATTCTTAATACTATAGGGATGAGTTTTATGTCTTATGCTTTA GCATCTGTTTTATGGGTTATTATTTTGTTTAGTTTAGCATTTGGACATGATGTTGGTGGTTTAATTGGAGGGTTAGATTA TATATTTTTTAAAAATGTAGGAATTAATGATATACAGGGGACAATACCAAAAATTTTGTTTGCAATATTTCAAATGACTT TTGCAGGGATAACTTTGGCACTGATTAGTGGTTCTGTTGTTGAAAGGATAAAATTTAGCTTTTGGATTGTTTTTGGTGTT TTATGGTTAATCGTTGTGTATGCTCCTGTGGCTCATTGGGTGTGGGGAGGTGGTTTTATCGGTAAAATGGGTGCACTCGA TTTTGCTGGCGGTACAGTTGTGCATATAAATGCAGGTATTTCTGGTTTGGTTTTAGCTTTACTTGTTGGAAAAAGGAGGG ATTATGGTAAAACAGCTATTATTCCATCATCTTTGGTTTTGACAGTTCTTGGTGCAGGTCTTTTGTGGTTTGGATGGTTT GGATTTAATGCTGGAAGTGAGTTGGCAGTTGATGGAGTTGCTGTAAATGCTTTCCTTGTAACAAACACATCGGCTGCTAT GGGTGCCATTACCTGGATTGTAATTGAATGGCTTATTGCAAAACGCCCTACTATGCTTGGTGCAGTATCAGGTGCAATTG CAGGGCTTGTAGCAATAACTCCTGCTGCTGGTTTTGTGTCGGCTTCTGCATCTTTACTTTTTGGGATATTATCTGGAATC GTTGGTTTTTTAGGGGTTTTTGTAATTAAAAATAGATTTAAATATGATGATTCATTAGATGCTTTTGGTGTACATGGGTT ATGTGGAATTTTGGGGGCTTTATTGACAGGTATATTTGCAAATCCAGAGATTAATAATTTAGGTAAAGGGTTTTTGTATG GTAATCCCAGTCAACTTTGGATACAACTGGTTTCTGTAGTAATTACCATTGTATACTCTGGGATTTGTACACTGATACTT TTTTATATTATCAAAATTTTTATTTCACCAAGGGTTGATGATGAGTCAGAATTAAAAGGGCTTGATGAAGTGGAGCATGG CGAAAGAGGTTTTAATTTATGA Protein sequence : MEDLSMKRFLISLFFIFTFSCFAFANDNQTINWVDTVWMIVATAFVMLMTPAGLALFYGGMTRTKNILNTIGMSFMSYAL ASVLWVIILFSLAFGHDVGGLIGGLDYIFFKNVGINDIQGTIPKILFAIFQMTFAGITLALISGSVVERIKFSFWIVFGV LWLIVVYAPVAHWVWGGGFIGKMGALDFAGGTVVHINAGISGLVLALLVGKRRDYGKTAIIPSSLVLTVLGAGLLWFGWF GFNAGSELAVDGVAVNAFLVTNTSAAMGAITWIVIEWLIAKRPTMLGAVSGAIAGLVAITPAAGFVSASASLLFGILSGI VGFLGVFVIKNRFKYDDSLDAFGVHGLCGILGALLTGIFANPEINNLGKGFLYGNPSQLWIQLVSVVITIVYSGICTLIL FYIIKIFISPRVDDESELKGLDEVEHGERGFNL |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 2e-72 | 50 |
BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 2e-72 | 50 |