Gene Information

Name : DEFDS_0082 (DEFDS_0082)
Accession : YP_003495350.1
Strain : Deferribacter desulfuricans SSM1
Genome accession: NC_013939
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter Amt family
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 92227 - 93528 bp
Length : 1302 bp
Strand : +
Note : TC 1.A.11 The Ammonia Channel Transporter (Amt) Family

DNA sequence :
ATGGAGGATTTAAGCATGAAAAGGTTTTTAATTAGTTTGTTCTTTATTTTTACTTTTAGCTGTTTTGCTTTTGCTAATGA
TAATCAAACAATAAATTGGGTAGATACTGTGTGGATGATTGTGGCTACTGCATTTGTTATGCTTATGACTCCAGCTGGAC
TTGCTTTATTTTATGGAGGGATGACAAGGACAAAAAATATTCTTAATACTATAGGGATGAGTTTTATGTCTTATGCTTTA
GCATCTGTTTTATGGGTTATTATTTTGTTTAGTTTAGCATTTGGACATGATGTTGGTGGTTTAATTGGAGGGTTAGATTA
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TTGCAGGGATAACTTTGGCACTGATTAGTGGTTCTGTTGTTGAAAGGATAAAATTTAGCTTTTGGATTGTTTTTGGTGTT
TTATGGTTAATCGTTGTGTATGCTCCTGTGGCTCATTGGGTGTGGGGAGGTGGTTTTATCGGTAAAATGGGTGCACTCGA
TTTTGCTGGCGGTACAGTTGTGCATATAAATGCAGGTATTTCTGGTTTGGTTTTAGCTTTACTTGTTGGAAAAAGGAGGG
ATTATGGTAAAACAGCTATTATTCCATCATCTTTGGTTTTGACAGTTCTTGGTGCAGGTCTTTTGTGGTTTGGATGGTTT
GGATTTAATGCTGGAAGTGAGTTGGCAGTTGATGGAGTTGCTGTAAATGCTTTCCTTGTAACAAACACATCGGCTGCTAT
GGGTGCCATTACCTGGATTGTAATTGAATGGCTTATTGCAAAACGCCCTACTATGCTTGGTGCAGTATCAGGTGCAATTG
CAGGGCTTGTAGCAATAACTCCTGCTGCTGGTTTTGTGTCGGCTTCTGCATCTTTACTTTTTGGGATATTATCTGGAATC
GTTGGTTTTTTAGGGGTTTTTGTAATTAAAAATAGATTTAAATATGATGATTCATTAGATGCTTTTGGTGTACATGGGTT
ATGTGGAATTTTGGGGGCTTTATTGACAGGTATATTTGCAAATCCAGAGATTAATAATTTAGGTAAAGGGTTTTTGTATG
GTAATCCCAGTCAACTTTGGATACAACTGGTTTCTGTAGTAATTACCATTGTATACTCTGGGATTTGTACACTGATACTT
TTTTATATTATCAAAATTTTTATTTCACCAAGGGTTGATGATGAGTCAGAATTAAAAGGGCTTGATGAAGTGGAGCATGG
CGAAAGAGGTTTTAATTTATGA

Protein sequence :
MEDLSMKRFLISLFFIFTFSCFAFANDNQTINWVDTVWMIVATAFVMLMTPAGLALFYGGMTRTKNILNTIGMSFMSYAL
ASVLWVIILFSLAFGHDVGGLIGGLDYIFFKNVGINDIQGTIPKILFAIFQMTFAGITLALISGSVVERIKFSFWIVFGV
LWLIVVYAPVAHWVWGGGFIGKMGALDFAGGTVVHINAGISGLVLALLVGKRRDYGKTAIIPSSLVLTVLGAGLLWFGWF
GFNAGSELAVDGVAVNAFLVTNTSAAMGAITWIVIEWLIAKRPTMLGAVSGAIAGLVAITPAAGFVSASASLLFGILSGI
VGFLGVFVIKNRFKYDDSLDAFGVHGLCGILGALLTGIFANPEINNLGKGFLYGNPSQLWIQLVSVVITIVYSGICTLIL
FYIIKIFISPRVDDESELKGLDEVEHGERGFNL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 2e-72 50
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 2e-72 50