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Name : DEFDS_0638 (DEFDS_0638) Accession : YP_003495875.1 Strain : Deferribacter desulfuricans SSM1 Genome accession: NC_013939 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transcription accessory protein Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 607573 - 609696 bp Length : 2124 bp Strand : + Note : S1 RNA binding domain protein DNA sequence : GTGATAGAAACTATATATTCTGAATATAATTATGCGAAAAAACATATAGATAACCTTATTGCCCTTTATAAAGAAGGTAA TACGGTCCCTTTTATTGCAAGATACCGCAAAGAGAAAACGGGCGGAATGGATGAAAATGTTATAAGAGAGATTATCGAAA GATATGAATACTTAGTTAAATTAGAAGAGAGAAAGTCTGAAGTTATAAAGCTTATTGCAGAAAAAAATAAATTAACAGAT GTACTTAAACAGAAAATTTTAAATTCAACTACATTAAAAGAGGTAGAGGATCTTTATGCACCATATAAATCTAAAAGAAA AACAAAGGCAGATATTGCAAAAGAGTTAGGATTAGAACCTTTAGCAATCTATATAAAAAAGGAATCTGATGAAACTAAAA TTGTTGAAAAAGCTAAAGATTTTCTAAGTGAGCAAGTTAAAACGGTTGATGAAGCTTTAGAGAAGGCCTTAGATATAATT ATCGAAGAGTTTGGTCACGATGTAACGATAAAGAGCAGATTACGAGATTATTTGTGGGATAATGCAAAGATTCTTAGCGA AGTAAAAAAAGAATACAGGGATGAGCGAACAAATTATGAAGATTATTACAATTATTCTGAAGCTATAAAATCGATACCGC CTCACAGAATTTTTGCCATATTTAGAGGAGAAAAAGAGGGGGTTTTAAAGGTTAAGCTTGATGCTGACTTTGAATTTTGT GAATCGATTATAAAGAACGAGCTTATTAATATTGGTATAGTTCAGAACAGTTATGTAAATGAAGCTATTAAAAAAGCGTT AAAAAGAGTTTTGTTTCCATCTTTAGAGTTAGAAATTAGAAAAGATTTGAAAGAGAAAGCGGAAGAGCAGGCTATAAAAG TTTTTGCTGAAAATTTAAGAAAACTTCTTTTGACACCTCCTGTAAAAGGGAAAAGGATTATGGGGATTGATCCAGCATTT AGAACAGGTTGTAAATATGCCTGTGTTGATGAAACGGGTAAGCTTTTAAGCTATGGAGTTATATATCCTGTGGAGCCTCA AAATGATTATGAAAATAGCAAAAAAGTAGTTTTAGATGAGATTTCAAAAAATAACATTGATATTATTGCAATAGGTAATG GTACAGCAAGTAGAGAAACGGAGGAGTTTGTATCAAAAGTTATTGAAGATGAGAAGTTAGATATTGTTTACACTATTGTA AACGAAGCTGGAGCAAGTGTTTATTCTGCAAGTAAAGTAGCAAATCAAGAGTTTCCTGAGTTAGATTTGACGATTCGTGG AGCTATTTCTATTGCTAGAAGAGTTTTAGACCCTTTATCAGAGCTCGTTAAAATTGATCCGAAATCAATAGGTGTTGGGA TGTATCAGCACGATGTTAATGAAAAACGTTTATCTGAAAAGCTTTATGATGTTGTGGAGGATGTGGTTAATAATGTGGGT GTAAATCTTAATACTGCTAGTGTGTCTTTGCTAAAATATGTGTCTGGGATAAATGAGAAAATTGCTGAAAATATTGTTAG TTATAGGGATGTAAACGGTAAGTTTAAAGAAAGAAAAGAACTATTAAATGTTGATGGAATTGGGGAGAAAGTGTTTGAGC AATGTGCTGGATTTCTTAAGATTTATGATGGCAAAGAACCTTTAGATGCTTTATTTATTCACCCTGAAAATTATGAGAAA GTATATAACCTGCTAAATGAGTTGAATATTTCTTTAGACAATAGACATTTGATAAAGCTTGCTCTTAAAGGGAAAGATTT GGATGAGTTGAGTAAAAAATGTAGTATAGGTTTACTCACTTTACAGGATATAATTGATAATTTTGAAAAGCCGGACAGAG ATATTAGAGATGATGTGGATCCTCTTATATTTAAACAATCAGCTTTAAATATTGAAAATTTGAAAGAGGGGATGAAGGTT AGAGGTAAAGTGACAAATGTAACAGATTTTGGTGCTTTTGTTGATATAGGGCTTAAAAATGATGCACTTGTACATATTTC TGAGTTAGCAGATAAGTTTGTTAAGCATCCGTTAGATGTTGTAAGTGTGGGTGATAATGTTTTGGCAACAGTAATAAAAG TGGATAAGGATAGAAACAGAGTATCGTTGTCGCTTAGAAGATAA Protein sequence : MIETIYSEYNYAKKHIDNLIALYKEGNTVPFIARYRKEKTGGMDENVIREIIERYEYLVKLEERKSEVIKLIAEKNKLTD VLKQKILNSTTLKEVEDLYAPYKSKRKTKADIAKELGLEPLAIYIKKESDETKIVEKAKDFLSEQVKTVDEALEKALDII IEEFGHDVTIKSRLRDYLWDNAKILSEVKKEYRDERTNYEDYYNYSEAIKSIPPHRIFAIFRGEKEGVLKVKLDADFEFC ESIIKNELINIGIVQNSYVNEAIKKALKRVLFPSLELEIRKDLKEKAEEQAIKVFAENLRKLLLTPPVKGKRIMGIDPAF RTGCKYACVDETGKLLSYGVIYPVEPQNDYENSKKVVLDEISKNNIDIIAIGNGTASRETEEFVSKVIEDEKLDIVYTIV NEAGASVYSASKVANQEFPELDLTIRGAISIARRVLDPLSELVKIDPKSIGVGMYQHDVNEKRLSEKLYDVVEDVVNNVG VNLNTASVSLLKYVSGINEKIAENIVSYRDVNGKFKERKELLNVDGIGEKVFEQCAGFLKIYDGKEPLDALFIHPENYEK VYNLLNELNISLDNRHLIKLALKGKDLDELSKKCSIGLLTLQDIIDNFEKPDRDIRDDVDPLIFKQSALNIENLKEGMKV RGKVTNVTDFGAFVDIGLKNDALVHISELADKFVKHPLDVVSVGDNVLATVIKVDKDRNRVSLSLRR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 5e-131 | 43 |
