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Name : secA (DEFDS_0046) Accession : YP_003495314.1 Strain : Deferribacter desulfuricans SSM1 Genome accession: NC_013939 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase subunit A Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 50564 - 53140 bp Length : 2577 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTGAATTTATAACGAAAAAACTTTTTGGTTCTTATAACGATAGATATCTAAAAAAAATAAGACCTATACTTGAAAA GGTAAACGCAAAAGAGCCTGAAATACAAGCTTTATCTAATGAAGAGCTCAGTAAAAAAACGGATGAGTTTAAATCAAGGC TTCAAAACGGTGAAACTCTCGATGATATTTTAGTTGATGCTTTTGCCGTTACTAGAGAAGTTAGTAAAAGAACTTTGAAT ATGAGACATTTCGATGTTCAGATATTAGGTGGTTATGTATTACATAAAGGCAAAATTGCTGAGATGAAAACTGGTGAGGG TAAAACCCTTGTAGCAACCCTAGCATTGTATTTAAATGCTTTAACTGAAAAAGGTGCTCACTTGGTTACTGTTAATGATT ACCTTGCAAGACGTGATGCCATGTGGATGGCCCCAATTTATCTCTTTCTTGGTTTAACCGTGGGTGTTATACAGCACGAA ATATCTTATTTGGTAGAATGGGATAATAAAGAAAAGTTTACAACAAAACTTGTGGAGTGCGATAGAAAAACCGCTTATCA GGCTGATATTACTTATGGGACAAACAATGAGTTTGGTTTTGATTATTTAAGAGACAATATGAAGTATGATATAAATGATT ATGTTCAAAGAGACCTTCATTATGCAATAGTTGACGAGGTTGATAGTATATTGATTGATGAAGCAAGAACTCCATTAATT ATAAGCGGACCTACAGATGAAAGAACTGATAAATATTATGAAATAGATAGAGTGGTTCGAGTTTTAAAAAAGGATGAAGA TTATACCGTTGATGAGAAAAGCAGAACAGTTAAGTTAACAGATTCTGGTATTAACAAGATAGAAAAAGCATTAAATATAG ATAATCTTTTCGATGTAAGGCATGTTGATACTCTTCATTTTGTAAATAACGCCCTTAAAGCTCATGCTCTTTTCAAAAGG GATGTTGATTATGTGGTTCAGGATGGAAAAGTTATTATTGTTGATGAATTTACAGGTAGATTAATGCCTGGTAGAAGATT CTCAGAAGGGTTGCATCAGGCTTTGGAAGCAAAAGAAGGTGTAGAGATTGAAAGTGAAAATCAAACGTTAGCATCTATTA CATTTCAAAATTATTTTAGGATGTATGAGAAACTTGCAGGTATGACTGGTACAGCGGCTACAGAAGCGCAGGAGTTTAGA GAAATTTATGGTCTTGATGTAATTGTTATACCTACTCACAAACCGATGATAAGAAAAGACTTTCCTGATGTGATTTATAG AACTGCAAAAGAGAAGTATGATGCCATCGTGGATGAGATTGTAGAAATGCATTCTATTGGTAGACCTGTGCTTGTAGGTA CTACTTCTATAGAAAAATCTGAATATTTAAGCAAACTTCTTAGGAAAAAAGGGATACCACATGAAGTTTTAAATGCAAAA TATCATGAGCGAGAAGCCCAGATTGTTGCAAAGGCTGGTGAAAAAAAAGCAGTTACAATAGCAACAAATATGGCTGGAAG GGGTACGGATATCAAACTTGGGCCTGGTGTTGCAGAGCTTGGTGGCTTGCATATTCTTGGTACTGAACGACATGAATCAA GAAGAATTGATAATCAGTTAAGAGGTAGAGCCGGTAGGCAGGGTGATCCAGGGTCTTCACGTTTCTTTCTAAGTTTAGAA GATGATTTACTCAGGATTTTTGGCTCTGATAAAATTTCTGCGATAATGAACAAATTGGGTATGAAGGAGGGCGAGCCAAT AGAACATCCTCTAATTTCTCGGGCGATTGAGAATGCTCAGAAAAAAGTAGAGGCGATGCACTTTGAAATAAGAAAGCATT TATTAGAATATGACAATGTTATGAATCAACAAAGACAGGTCGTTTACACTTTGAGACGGACAATTTTAGAAGGGAAAGAT CTTGATGACATTGTCAACGAACATATTGAAAATGTCCTTGATGGTTTAATAAAAGAGTTTATTGATGCTCCGGATGATCC TGATTTTGAAAGTTTTGCAAAGAGTATTGAGAAGATTTTTGATATCAAAATAGATTTAACGGATAGGCAATCTAAAAAGG ATATTGATGAGGATAAAAAGGTTATTTTGCAAAAAATAAATGAAAAAATTGAGATGAAGAAAAATGAAATTGGTGAGCAT TATTATGGGTTTGTAAGATTTTTGCTTATTAACATTCTTGATAATAGATGGAAGGAACATTTATTGAATATGGACTATCT AAGAGATTCTGTTGGGTTAAGAGGATACGGTCAAAAAGATCCACTTATCGAATACAAAAGGGAATCTTATAACCTATTTA TGGATATGATGAATAGGATATCTTTTGAATTTGTTGAATTTTTGTCTCATGTTCAAGTTGAAAGGGATGAAGAACTTGAA TTGAAACAGGAAGAGAAAAATATTAAGGAAGAGAGAAGGGATATTTTTAGTGATGAGCAACCTAAAGAGGAGAAGAAGAA ACCTATAAAACGTGCCACTCCTAAGGTTGGTAGAAATGATCCATGCCCTTGTGGAAGTGGGAAAAAATATAAAAAGTGTT GTGGTGCTAATCAGTAA Protein sequence : MIEFITKKLFGSYNDRYLKKIRPILEKVNAKEPEIQALSNEELSKKTDEFKSRLQNGETLDDILVDAFAVTREVSKRTLN MRHFDVQILGGYVLHKGKIAEMKTGEGKTLVATLALYLNALTEKGAHLVTVNDYLARRDAMWMAPIYLFLGLTVGVIQHE ISYLVEWDNKEKFTTKLVECDRKTAYQADITYGTNNEFGFDYLRDNMKYDINDYVQRDLHYAIVDEVDSILIDEARTPLI ISGPTDERTDKYYEIDRVVRVLKKDEDYTVDEKSRTVKLTDSGINKIEKALNIDNLFDVRHVDTLHFVNNALKAHALFKR DVDYVVQDGKVIIVDEFTGRLMPGRRFSEGLHQALEAKEGVEIESENQTLASITFQNYFRMYEKLAGMTGTAATEAQEFR EIYGLDVIVIPTHKPMIRKDFPDVIYRTAKEKYDAIVDEIVEMHSIGRPVLVGTTSIEKSEYLSKLLRKKGIPHEVLNAK YHEREAQIVAKAGEKKAVTIATNMAGRGTDIKLGPGVAELGGLHILGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGSSRFFLSLE DDLLRIFGSDKISAIMNKLGMKEGEPIEHPLISRAIENAQKKVEAMHFEIRKHLLEYDNVMNQQRQVVYTLRRTILEGKD LDDIVNEHIENVLDGLIKEFIDAPDDPDFESFAKSIEKIFDIKIDLTDRQSKKDIDEDKKVILQKINEKIEMKKNEIGEH YYGFVRFLLINILDNRWKEHLLNMDYLRDSVGLRGYGQKDPLIEYKRESYNLFMDMMNRISFEFVEFLSHVQVERDEELE LKQEEKNIKEERRDIFSDEQPKEEKKKPIKRATPKVGRNDPCPCGSGKKYKKCCGANQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 4e-124 | 41 |
