Gene Information

Name : DEFDS_1415 (DEFDS_1415)
Accession : YP_003496632.1
Strain : Deferribacter desulfuricans SSM1
Genome accession: NC_013939
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter Amt family
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 1432456 - 1433712 bp
Length : 1257 bp
Strand : -
Note : TC 1.A.11 The Ammonia Channel Transporter (Amt) Family

DNA sequence :
ATGAGATTGTTTTTTATAACTTCAATACTTTTTTTAACACACAATGTTTATGCTTTTAATGGTAAAGTGAATAGTGCGGA
TACCTTATGGGTTATTATTTCTTCTATTTTGGTTTTGTTGATGATACCAGCTTTATCGATCTTTTACGGTGGTATGGTGA
GAGGTAAGAACGTTTTATCTACAATGTCTTTTAGTTTTGTTTCAATGACAGTAGTTGGAGTGTTGTGGTTCTTAATTGGA
CACACAATTGCTTTTGGACCTGGAGGTAATTCTTTCGTTGGTAGTATGAAGTATCTTTTTTTAGGTAAAGATTTGATGAC
TGATGTGCATGGAACAATCCCTGAATCAGTATTTTCTTTTTTCCAAGGAATGTTTGCAATTATTACTATTGCACTATTTA
GTGGTGCAATTGTTGAAAGGTTTAAATTTAGCAGTTATGTATTTATTATCTCTTTATGGTTGATTTTTATATATGCTCCA
TTAGCACACTTTGTTTGGGGTGAAAATGGTTTTTTGGCAAATATGGGTGTTTTAGATTTTGCAGGTGGGTTAGTAGTTCA
TCTTTCTTCTGCAGTTGCTTCTTTGGTTTTGATTTTAATGGTGGGGCCAAGGAAAGGTTATCCTCAAAAGCAATTTATTC
CACATAATCTTGTTTTGACAGGTATAGGTACTGGTTTATTATGGTTTGGTTGGTTTGGTTTTAATGCTGGTAGTGCTTTA
GCTGTAAATAATGTGGCTTATTATGCATTTATAAATACTTTTGTAGCAGGTGCTGCTGGTGGGGCTGTCTGGATGTTTTT
AGAAATGAAAAATTCAAAACCAAGTTTTTTAGGAATATGCTCAGGTATAATTGCAGGTTTAGCTTCAATTACAAATGCTG
CTGGTTATGTAATACCGCCAATTGCATTGCTGATAGGCATTATGGGTGGGTTTATTTGTTTTTATGCAATTCAACTAAAA
TTTAAACTTGGGTATGATGACTCTTTAGATGTTATTGGTGTTCATGGAGTAGGTGGTCTAATAGGAGCTTTAATGACTGG
TCTATTTGTTTCAATAAATGGAAAAGGTTTATTTTATGGAAATATAAAGCAATTTATAGTCCAAATTGTTGGAATTTTAG
TTACAATTTTATTTGTTGGAATAGGCACTTTCCTAATAGGTAAATTAGCAGATGTTATTTTTGGTTTAAGGGTTGGTGTA
GAGGAGGAAGTTGAAGGCCTTGATTTATCACAGCATGGAGAAAGTGCGTATAATTAA

Protein sequence :
MRLFFITSILFLTHNVYAFNGKVNSADTLWVIISSILVLLMIPALSIFYGGMVRGKNVLSTMSFSFVSMTVVGVLWFLIG
HTIAFGPGGNSFVGSMKYLFLGKDLMTDVHGTIPESVFSFFQGMFAIITIALFSGAIVERFKFSSYVFIISLWLIFIYAP
LAHFVWGENGFLANMGVLDFAGGLVVHLSSAVASLVLILMVGPRKGYPQKQFIPHNLVLTGIGTGLLWFGWFGFNAGSAL
AVNNVAYYAFINTFVAGAAGGAVWMFLEMKNSKPSFLGICSGIIAGLASITNAAGYVIPPIALLIGIMGGFICFYAIQLK
FKLGYDDSLDVIGVHGVGGLIGALMTGLFVSINGKGLFYGNIKQFIVQIVGILVTILFVGIGTFLIGKLADVIFGLRVGV
EEEVEGLDLSQHGESAYN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 1e-46 48
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 1e-46 48