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Name : SLGD_00655 (SLGD_00655) Accession : YP_003470930.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 Genome accession: NC_013893 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type I restriction-modification system, restriction subunit R Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0610 EC number : 3.1.21.3 Position : 718182 - 720968 bp Length : 2787 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGTTATCAAGGAGAATTAGCATTAGAAAATGATGTTATCAAGCAGTTGGAGTCTCAAGGCTATGAAAGAATTATATT AAGAAATCATGAGCAGCTTGTAGAGAATTTCCGCCAAATCTTAAATGAACGTAATAAAGAAAACTTAAAAAATAGACCAC TTTCTGATACCGAGTTTGCACGCTTAATGACAGATATTAGCGATAAAAGTGTCTTTGATAGTGCGATGCAGTTACGTGAC AGTTACACATTAGAACGCGATGATGAATCTAAAGTTTATCTATACTTCTTAGATACAGAACACTGGTGTCAGAATAAATT CCAAGTAACGAACCAAGTGACTGTGGACGATAAATATAAAGCACGTTATGACGTAACGCTATTAATCAATGGGTTGCCTT TAGTTCAAATTGAATTGAAACGTAGTGGTATCGCAATTAGTCAAGCATTTAATCAAATTGAACGTTATCGCAAACATAAT TATCGTGGCTTGTTCCGCTTCATACAGCTCTTTGTAGTAAGTAATAAAAAAGAAACACGTTATTATGCCAATAGTGATAA AGAGATATTCAAGAGTTTAATGTTCTATTGGAGTGACAAAGATAACCGCCGTATTAATAATTTGAAAGAATTTATTCAAG AATTTCTTGATCGTTGTCGCATTGCTAAGATGATTAGTCGCTATATGATAACGAATGAAACAGATAAATTGCTTATGGCA TTGCGTCCTTATCAAGTCTATGCAGTTGAATCATTACTTAATCGTGCCACTGAAACCAATAATAATGGTTATATTTGGCA TACAACTGGTAGTGGTAAAACACTGACTTCCTTTAAAACAAGCCAAATACTGTCCAAAGATCCAAGTATTAAAAAAGTTA TTTTCCTAGTCGACCGTAAAGATTTGGATAGTCAAACACTTGCAGAATTTAATAAATTTCAAATGGATTCTGTTGATTTA ACAGATAATACACATAAATTGCTGAAACAACTCGATGACCCATTCCAAAAGCTTATTGTTACAACTATTCAAAAGATGGC GAATGCTGTTAAATCGGGTGCTAACATTATGGATAAATATCAGCAAGATAAAGTCATCTTTATCATTGACGAATGCCATC GTACCCAATTTGGAGAAATGCATCGCTTAATTAGACAACACTTTAAGCAAGCGCAATATTTTGGATTTACTGGTACGCCC CGCTTTGAAGAAAATGCCAGTCTAGATGGTCGAGCTACGGCAGACATTTTCGAAAAATGTTTACATACGTATTTAATTAA GGATGCTATTCGTGATGGTAACGTGTTAGGTTTCTCTGTAGAATATATCAGTACATTTGCCAATGCAATCCATGACATGG ATGAATCTTACGTATCTAGCATTGATGAAAATGAACTCTGGATGGCTGATGACCGACTAAACATGATTGCTAAGCATTTG GTGGCCAATCATCATAAAAAGACGCGTAATCAAATGTACACGTCTATCTTGACAGTTCAAAGTATTCCGATGGCTATTAA ATATTATAAAATTTTCAAGCAACTTAAAGACGCAGGTCAACATCATCTAAATGTCTCAACCATCTTTACTTATGCTGCAA ATGAAGATACACAAGAACAAATCGATAAAGTACATACTAAAGAAGAACTTGAACAAGTGATGTGTGATTATAATCAAATG TTTGATAAAAACTTTAGTCTAGACACGTTTGACGGTTTCTTTAATGATATTTCAAAACGTGTGAAACAAGGTAATCCGGC TGAACGCCTAGACATATTAATTGTCGTTGATATGTTCTTAACTGGTTTCGATAGTAAAAAGTTAAACACGCTATACGTTG ATCGTAATTTAAAATATCACGGCTTAATTCAAGCCTATTCACGTACAAACCGTGTTGAAAAGGAGACCAAACCCTACGGC AACATTGTATGTTATCGCAATCTTAAAGATAATACGGATAAAGCCATAGAACTCTTTTCTCAAACTAATGATACAGATAC AGTATTAAGCCCGTCATTCGATGTCTTATTATCTGATTTCAAGCATGTACTTACCCAATTACTTAACGTAGTTCCTACGC CTGATGATGTAGATAACCTAGAGCGAGAAGACGATCAACTCGACTTTGTACTCGCATATCGTGCCGTAGCGAGCTTGCTG CAAAGGTTAAAGACCTTTGATGAATTTGAATTTACTTCTGACCTTCTTGGCATTAGTCAACAGACATTTGAAGATTACCA AGGTAAATATTATGCCATTTATGACAAAGTCAAAGGTCAACGTCAAAGTGAAAAAACATCCGTGTTAGATGATATTGATT TCAAAATTGAAATTTTAAGAAATGATATGATTAATGTTCAATACATTCTTGATTTACTAAACAATATTGATTTAACGGAT AAAGCTCAAACCGAACGCGTGCGTAAACAAATCAAACAGTTATTAAGCAAGGCAGATGATGACAAATTACGTCTAAAAGC AGAACTGATTCGTGAATTCTTGGATAAAGTTATCCCTCACCTAGATAAAGATGCCGTGATTGAAGATGCTTACTTTAACT TTGAAGAAGAAGTAAAAGAACAGGAAATTCAAGAATTTGCTAATGACAAAGCATACCCTATCGACTTACTTAAAGAAGTC ATTAATGAGTATGAATTTAGCGGGCAACTTGATAATAACTTTGTCGAACAAGGTATTACAGGTGGTTTACTCGTCCGCAC ACAGAAAATTGAAAACGTTAAATCATTCGTTCAAGAAACAGCAGAAAAATATGGTGCAGCAAATTAA Protein sequence : MSYQGELALENDVIKQLESQGYERIILRNHEQLVENFRQILNERNKENLKNRPLSDTEFARLMTDISDKSVFDSAMQLRD SYTLERDDESKVYLYFLDTEHWCQNKFQVTNQVTVDDKYKARYDVTLLINGLPLVQIELKRSGIAISQAFNQIERYRKHN YRGLFRFIQLFVVSNKKETRYYANSDKEIFKSLMFYWSDKDNRRINNLKEFIQEFLDRCRIAKMISRYMITNETDKLLMA LRPYQVYAVESLLNRATETNNNGYIWHTTGSGKTLTSFKTSQILSKDPSIKKVIFLVDRKDLDSQTLAEFNKFQMDSVDL TDNTHKLLKQLDDPFQKLIVTTIQKMANAVKSGANIMDKYQQDKVIFIIDECHRTQFGEMHRLIRQHFKQAQYFGFTGTP RFEENASLDGRATADIFEKCLHTYLIKDAIRDGNVLGFSVEYISTFANAIHDMDESYVSSIDENELWMADDRLNMIAKHL VANHHKKTRNQMYTSILTVQSIPMAIKYYKIFKQLKDAGQHHLNVSTIFTYAANEDTQEQIDKVHTKEELEQVMCDYNQM FDKNFSLDTFDGFFNDISKRVKQGNPAERLDILIVVDMFLTGFDSKKLNTLYVDRNLKYHGLIQAYSRTNRVEKETKPYG NIVCYRNLKDNTDKAIELFSQTNDTDTVLSPSFDVLLSDFKHVLTQLLNVVPTPDDVDNLEREDDQLDFVLAYRAVASLL QRLKTFDEFEFTSDLLGISQQTFEDYQGKYYAIYDKVKGQRQSEKTSVLDDIDFKIEILRNDMINVQYILDLLNNIDLTD KAQTERVRKQIKQLLSKADDDKLRLKAELIREFLDKVIPHLDKDAVIEDAYFNFEEEVKEQEIQEFANDKAYPIDLLKEV INEYEFSGQLDNNFVEQGITGGLLVRTQKIENVKSFVQETAEKYGAAN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 60 |
