|
Name : SLGD_00287 (SLGD_00287) Accession : YP_003470562.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 Genome accession: NC_013893 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG3037 EC number : - Position : 302334 - 303695 bp Length : 1362 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCATGCCATATTAGATTTTATTGTTGATATTTTAAGTCAACCTGCGATTCTAGTTGCATTGATTGCGTTAATTGGTTT GTTAGTACAGAAAAAATCAGCCACAGCGATTACAACAGGTACCATTAAAACAATGTTAGGCTTTCTTATTTTAAGTGCCG GTGCAGGCGTTGTGTCTAATTCATTAGAACCTTTTGGAAAAATATTCCAACATGCATTTGGTGTTCAAGGTGTCGTGCCA AACAATGAAGCAATTATTTCATTAGCATTAAAGGACTATGGGACAACAGCTGCGTTAATCATGGTATTTGGTATGTTAAT TAATATTGTGATTGCACGCATATCAAATTTAAAATATATTTTCTTAACAGGACATCATACCTTTTATATGGCTGCCTTTT TAGCCATTTTATTGACAGTCGGTCATATTAAAGGTTATTTAACTGTAACAATTGGTGCTGTGTTACTAGGCTTATTAATG TCCATATTACCAACGTTAGCACAACCTACTATGCGTAAAATAACTGGAAATGATCAAGTTGCATTAGGTCATTTTGGAAC AATCAGTTACTGGGCAGCGGGTGAGGTTGGTAAACTCTTTAAAGGGAAATCTAAATCTACGGAAGAAATTAAATTTCCTA AAGGATTAAGTTTTTTACGAGAAAGTACAATTAGTATTTCTATTACCATGGCACTGCTATACTTGATTGCTTGTCTATTT GCCGGTGTAGGTTATGTGCATGATCATATTAGCCAAGGACAAAACTTTATAGTCTTTTCAGTTATTCAAGGTGTGACCTT TGCGGCAGGTGTTTTTATTATCTTAACAGGGGTACGTTTAATTTTAGCTGAAATTGTTCCGGCGTTTAAGGGTATTTCGG AAAAACTAGTACCGAGCTCTAAACCAGCATTGGATTGTCCAATTGTCTTTCCATATGCACAAAATGCTGTGCTAATAGGA TTCTTTGTTAGTTTTATTACCGGGGTAATTGGCATGTTCATTCTATTTTTCACGGGAGGCATTGTCATATTACCAGGTGT TGTTGCACACTTTTTCCTAGGTGCAACATCTGCTGTCTTTGGTAATGCTCGAGGCGGTATTAAAGGTGCTGTTGCTGGTG CGGCCTTGAATGGTATATTAATTACGTTCTTGCCATTATTATTTATCCCTTTCTTGGGAGACTTAGGTTTAGCGACAACA ACATTTTCAGATACAGACTTCTTAGCTGTAGGTATTATCTTTGGTAATATCGTTAAGTATGCAGGTATTATAGGTTCTGT CATCTTTATAGTCATTTTGGCAGCAGGCGCTATCTTCTTAAAAGGAAAAGCAGATAAGAAATATGAACAACAGCAATCAT AA Protein sequence : MHAILDFIVDILSQPAILVALIALIGLLVQKKSATAITTGTIKTMLGFLILSAGAGVVSNSLEPFGKIFQHAFGVQGVVP NNEAIISLALKDYGTTAALIMVFGMLINIVIARISNLKYIFLTGHHTFYMAAFLAILLTVGHIKGYLTVTIGAVLLGLLM SILPTLAQPTMRKITGNDQVALGHFGTISYWAAGEVGKLFKGKSKSTEEIKFPKGLSFLRESTISISITMALLYLIACLF AGVGYVHDHISQGQNFIVFSVIQGVTFAAGVFIILTGVRLILAEIVPAFKGISEKLVPSSKPALDCPIVFPYAQNAVLIG FFVSFITGVIGMFILFFTGGIVILPGVVAHFFLGATSAVFGNARGGIKGAVAGAALNGILITFLPLLFIPFLGDLGLATT TFSDTDFLAVGIIFGNIVKYAGIIGSVIFIVILAAGAIFLKGKADKKYEQQQS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 3e-96 | 57 |
| vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 3e-96 | 57 |
| ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 3e-96 | 56 |
