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Name : SLGD_00212 (SLGD_00212) Accession : YP_003470487.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 Genome accession: NC_013893 Putative virulence/resistance : Unknown Product : bicyclomycin resistance protein TcaB Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG2814 EC number : - Position : 224367 - 225710 bp Length : 1344 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATATTAAAAAATATTTAATTTTTATTATAGGTGCGCTAGGCGGTTTACTTTATGGTTACGATAATGGGATTATTTC AGGTGCTTTAACCTATATCCCTAAAGATATTCCGTTAACAAGCTTTCAAAGTGGTTTAGTTGTGTCATCTATGCTGTTTG GTGCCGTTATTGGTGCAGGTAGTAGCGGGCCGCTATCAGATAAGATTGGACGACGTCGTTTAGTACTATTTATTGCGATT ATCTTCGCATTAGGTGCATTTATTTTAGCAATTGCGCCTAATGTTACGATATTAGTTCTTGGACGAATTGTCATAGGCCT AGCTGTAGGGGGTTCAATGGCAACAGTGCCAGTGTATTTATCTGAATTAGCACCAACAGAACTACGTGGTTCATTGGGTT CATTGAACCAACTGATGATTACAATCGGCATTTTGGCAGCTTATTTAGTAAGCTATGGCTTTGCAGATATGGGCGCATGG CGCTGGATGCTTGGACTTGCAGTGGTACCATCTATTATTTTATTAATAGGTATTGCTTTTATGCCGGAAAGCCCAAGATG GCTATTAGAAAATAAAACAGAAAAAGCAGCGCGTCACGTAATGCAAATTACATATAGTGATGAAGAAATCGACCGTGAGA TTAAAGAAATGAAAGAACTTGCTGAAAAGACGGAGAGTAGTTGGTCGGTATTAAAATCTAAATGGTTAAGACCGACGTTA ATCATCGGTTGTACGTTTGCTATCTTACAACAGTTTATTGGCATTAATGCTGTTATCTTCTATGCATCACCTATTTTAAC AAAAGCTGGCTTTGGAGAATCAGCGTCAATCTTAGGTTCTGTAGGCATTGGTGTAGTAAATGTGCTTGTAACAGTTCTGG CATTATTTATTGTCGATAAAATAGATCGTAAAAAATTATTGGTTGTCGGTAATATCGGTATGGTGGCTTCTTTAGTAATT ATGGCAATCTTGATTTGGACGTTAGGCATTCAATCATCTGCATGGATTATTATTGTTTGCTTATCACTCTTTATTGTATT CTTCGGTGCGTCTTGGGGACCAGTGTTATGGGTAATGTTACCAGAATTATTCCCAACGCGTGCACGTGGTGCTGCAACAG GGATTGCAACCTTAGTATTGAATATTGGTACGCTTATCGTGGCACAATTGTTCCCAATGATTAATGCAGCATTAGATGTT GAATGGGTATTCTTAATCTTTGCGGCAATTGGCGTTGTAGCCTTAATCTTTGTTATTAAGTTCTTGCCAGAAACAAGAGG CCGTAGCTTAGAAGAAATAGAAATTGAGCTTAGACAGCGTGCTGGTGTAAAAACAGAACAGTAA Protein sequence : MNIKKYLIFIIGALGGLLYGYDNGIISGALTYIPKDIPLTSFQSGLVVSSMLFGAVIGAGSSGPLSDKIGRRRLVLFIAI IFALGAFILAIAPNVTILVLGRIVIGLAVGGSMATVPVYLSELAPTELRGSLGSLNQLMITIGILAAYLVSYGFADMGAW RWMLGLAVVPSIILLIGIAFMPESPRWLLENKTEKAARHVMQITYSDEEIDREIKEMKELAEKTESSWSVLKSKWLRPTL IIGCTFAILQQFIGINAVIFYASPILTKAGFGESASILGSVGIGVVNVLVTVLALFIVDKIDRKKLLVVGNIGMVASLVI MAILIWTLGIQSSAWIIIVCLSLFIVFFGASWGPVLWVMLPELFPTRARGAATGIATLVLNIGTLIVAQLFPMINAALDV EWVFLIFAAIGVVALIFVIKFLPETRGRSLEEIEIELRQRAGVKTEQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0071 | YP_251986.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-118 | 67 |
