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Name : SLGD_01238 (SLGD_01238) Accession : YP_003471456.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 Genome accession: NC_013893 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1277558 - 1280191 bp Length : 2634 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGGATAAATTAGTTTTAATTGATGGAAATAGTTTGAGTTTCAGGGCATTTTACGCTTTGCCTTTGCTGTCGAATAAGGC TGGTATTCATACAAATGCAATATATGGCTTTGCTATGTTACTAGAGAAAATATTGAAAGAAGAGCAACCTAATCATTTTT TAGTAGCATTTGATGCAGGTAAGACGACTTTCAGACACGAAAAATATAGTGAATATAAAGGTGGGAGACAAAGTACGCCT CCAGAATTAAGTGAACAATTCCCATATATTCGACAGTTATTAGATGCATATCATATTAAGTATTATGAATTAGAAAATTA TGAGGCTGATGATATTATTGGTACGTTGAGCAAACAAGCTGAAGCGTCAGGGTTAGAAACGATTATTATTACAGGAGATC GTGATTTAACACAATTAGCAACGGACCATGTAACAATTTATTACACGAAAAAAGGGGTTACTGATGTAGATCATTACACA CCAGAATTCATTGCTGAAAAATATAATGGATTGTTACCAAAACAAATTATTGATATGAAAGGTCTTATGGGAGATACTTC TGATAATATACCTGGAGTAGCTGGTGTTGGAGAAAAAACGGCAATTAAGTTACTTAACCAGTTTCATTCTGTTGAAGGTG TGTATAATCATCTTGATGAAGTTTCTGGAAAAAAACTTAAGGAAAACCTTGAGAATAGTAAAGCCGATGCGTTTATGAGT AAAGATTTAGCTACAATTAATTGTGACAGCCCTATAAAAGTGAATCTTAAAGATACAATTATGGGCGATTTAAATGATAA TAAAGATAAAATTGAGCTTTTCCAAAAATTAGAATTTAAACAATTACTTAATGATATAGACAGTAGTGCTAGTGAAAATA ACAGTGAAACTGAACACAATTTTGAAGTGATCCATCATTTTGATAATATAAATTTTAAAAAGCTAGATAATGCAATCATA CATTTTGAAATTGATGGTAGTAATTATTTAAAGGATAAAATTTTAAAGTTTGGATTATATGCACAAAATCAATATATCGT TATTTCGGCTGAGGATATCCATCAATATACTGAACTCATTGAGTGGTTAGAAAATGATCATAATAATAAAATTGTTTTTG ATGCTAAAAAGACTTATGTTGCTGCACATCGTTTAGAAATTAATCTGCAGCATATTGATTTTGATGTTATGTTAGCAAGT TATATTATTGATCCATCTCGTACTATAGAAGATGTTCAATCCGTAGTAAGTTATTATAATCAAAATTTTGTCAAAAGTGA TATTGCTGTATATGGTAAAGGGAAAAAACGACAAGTTCCACTAGATGATGTGTTGGAAGTGCATATCGCTGCCATTATGC AAGCTATTTATAATTGTAAACCATTAATGTCAGACATTCTGTCAGACCATAATCAAATGGACTTGTTGAATAATTTAGAG TTGCCATTAGCGAGAATACTTGCTGACATGGAAGAAACAGGTATTTATACAGACGTAAATGATCTTAAGGAAATGCAAAA CGAGCTTCAAGAAAAATTGGATAATCTTGTTTCAGAAATATATGAAGCAGCAGGTGAATCATTTAATATTAATTCACCTA AACAATTGGGCATTGTTTTATTTGAAACATTAAAATTACCTATTATTAAAAAAACAAAGACGGGTTATTCTACTGCGGTT GATGTACTTGAACAGTTACAAGGTAAACATCCTATTATTGATTACATTCTTGAGTATCGACAGTTGTCAAAATTACAATC AACATATGTAGAAGGCTTGCAAAAAGTCATAAGTGACGATCAACGTATCCATACGCGTTTTAATCAGACATTAGCGCAAA CTGGACGTCTTTCATCAATTGATCCGAATTTACAAAATATACCGATTCGTCTTGAGGAAGGTCGTAAAATTCGTAAAGCC TTTAAACCAACGTCAGATGATTATGTTATTTTATCTGCGGATTATTCTCAAATTGAACTTCGTGTATTAGCACATATGAC TCAAGATGAAAGTTTAAAAGAAGCTTTTATACATGGAGACGACATTCATGCTGCTACTGCTATGAAAGTGTTTGGAGTTG AAAAAGATCAAGTTAATGATTTAATGCGTAGACAAGCAAAAGCGGTTAATTTTGGCATTGTTTATGGTATAAGTGATTAT GGTCTTAGCCAAAATTTAGGTATTACACGTAAAAAAGCAAAAGCTTTTATTGATGATTATTTGGCTAGTTTTCCAGGTGT TAAACAATATATGACCGATATTGTTAAAGATGCAAAAGCCAATGGTTATGTTGAAACGTTATTACATCGACGCCGTTATA TTCCAGATATTACGAGCCGCAACTTTAATTTAAGAAGTTTTGCTGAAAGAACAGCCATGAATACGCCTATTCAAGGTAGT GCTGCAGATATTATTAAATTGGCAATGGTACAATTTGATAAAAATGTAAGAGAAACAAACTATCATGCCAAATTATTACT TCAAGTGCATGATGAATTAATATTTGAAGTTCCAAAGTCTGAGGTACAAGATTTTAGTGAATTTGTTGAAGAAATTATGG ATAATGCATTAACACTTGCTGTCCCATTGCTTGTAGATTCTAGCTATGGAGCTACATGGTATGATGCTAAATAG Protein sequence : MDKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAIYGFAMLLEKILKEEQPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQSTP PELSEQFPYIRQLLDAYHIKYYELENYEADDIIGTLSKQAEASGLETIIITGDRDLTQLATDHVTIYYTKKGVTDVDHYT PEFIAEKYNGLLPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFHSVEGVYNHLDEVSGKKLKENLENSKADAFMS KDLATINCDSPIKVNLKDTIMGDLNDNKDKIELFQKLEFKQLLNDIDSSASENNSETEHNFEVIHHFDNINFKKLDNAII HFEIDGSNYLKDKILKFGLYAQNQYIVISAEDIHQYTELIEWLENDHNNKIVFDAKKTYVAAHRLEINLQHIDFDVMLAS YIIDPSRTIEDVQSVVSYYNQNFVKSDIAVYGKGKKRQVPLDDVLEVHIAAIMQAIYNCKPLMSDILSDHNQMDLLNNLE LPLARILADMEETGIYTDVNDLKEMQNELQEKLDNLVSEIYEAAGESFNINSPKQLGIVLFETLKLPIIKKTKTGYSTAV DVLEQLQGKHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKA FKPTSDDYVILSADYSQIELRVLAHMTQDESLKEAFIHGDDIHAATAMKVFGVEKDQVNDLMRRQAKAVNFGIVYGISDY GLSQNLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMTDIVKDAKANGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGS AADIIKLAMVQFDKNVRETNYHAKLLLQVHDELIFEVPKSEVQDFSEFVEEIMDNALTLAVPLLVDSSYGATWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 49 |
