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Name : yvdF (lse_2115) Accession : YP_003465348.1 Strain : Listeria seeligeri SLCC3954 Genome accession: NC_013891 Putative virulence/resistance : Unknown Product : maltogenic amylase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 2170402 - 2172177 bp Length : 1776 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGAAAAAGCAGGAATTTATCATCAACCAGCCAGTAGCTATGCTTATAGTTATGATGCTAAAACACTACATATTCGGAT TAGGACGAAACGCTTGGATATTAGCGAAGTTATCTTAATTGCTGCCGACCCTTATTTATGGAAAGATGGCAAGTGGCAAA GTAACTCTTATTCAATGCGGAAAATAGCGGAAACAGAAGAACATGATTATTGGTTTATCCCTGTAACACCAGAACATAGA CGTTTGCAATATGGCTTTTTAATTACTGATACAGAAGGCGAAACAACCTTTTACGGTGGACGCGGTTTTTTTGAAGCAAC AGAAGCAAATTTAGAAACGATGGATTATTACTTTAAATTTCCGTTTATTCATGCGGTGGATACTTTTGAAGCGCCTGAGT GGGTTGGAAATACGATTTGGTATCAAATTTTCCCTGAACGTTTTGCAAATGGGAATCCAAGTTTGTCGCCTGAAAATGTG TTGCCATGGGGAAGTAAAGATCCGACGCCAACTGACTTTTTCGGTGGGGACATCGAAGGAATCACTCAGCATTTAGATTA TTTAGTAGAGTTAGGAATTAATGGCGTCTATCTAACACCAGTTTTTGAAGCACCGACAAATCACAAATACGATACGATTG ACTATAAAAAAATTGATCCGCATTTTGGCGATAAAGAAGCTTTTAGAAAGTTAGTTCAAGAAGCGCATAAACGTGGCATT CGCATTATGTTAGATGCTGTATTTAATCATATTGGAGATACGTCGGCAGAATGGCAAGATGTTGTGGAAAAAGAAGAAAA ATCAGCCTATCGTGATTGGTTCCATATTCATAGTTTCCCAGTTCGCCCGAATGAAAATGGCAATATAGAAGGAGAACCTA CTCTTTCTTATGATACATTCGCATTTACAACGCATATGCCTAAATTAAATACTGCAAACCCTGAAGTTCAAGCGTATTTG CTTGATATTGCGACTTATTGGATTCGCGAATTTGATATTGACGGTTGGCGTTTGGATGTGGCTAATGAGGTAGATCATGC TTTCTGGAAAGAATTTAAAAAGGCAGTGCAAGCGGAGAAAGAAGATATCTATATATTAGGCGAAATTTGGCATGATTCCT GGATTTGGTTGCTTGGCGATGAATTCCATGCAGTAATGAATTATCCGTTTACCCAAACAATTATTGAAAACTTTATTGAA GAAAAAATTACACCGGAACAAATGGTTTCAGGTATTAATGAGCAATACATGCGCTATCCAAATCAAGTAAATGAAGTGAT GTTTAATATGCTTGATAGCCATGATACTGCGCGAATCTTAACAAGAGCAAATAATGACATTGATAAAGTAAAACAAGCAT TAACCTTCATGTTTGCGCACACTGGCTCCCCGTGTATTTACTACGGAACAGAAATTGGTATGAACGGCGGAAATGACCCT GGTTGCCGGAAATGCATGGAATGGGACACGAAAAAACAAAATCAAGACATGCTCGCTTTCACTAAAAAATTAATTGCGCT TAGAAAAGAAAATCAAGCAATTATTACTTCAGGAGAGTTAAGTTGGCTGGCAGCAAGCAGTGAAACAGGAATCACGGCAT TCAAACGAGAACTAAATGGTGAAAAACTGTATTTCGTATTTAACCAAGCAACGGAAAATAAAAATTTCACAATATCTTTT GAAAATCAAGCGACAGATATTTGGAATAAGGAAGTTGTAACTGAAAATCTAACTGTACCTGCTAAAGGATTCCTTGTTAT TAAAGAAAACAGTTAA Protein sequence : MEKAGIYHQPASSYAYSYDAKTLHIRIRTKRLDISEVILIAADPYLWKDGKWQSNSYSMRKIAETEEHDYWFIPVTPEHR RLQYGFLITDTEGETTFYGGRGFFEATEANLETMDYYFKFPFIHAVDTFEAPEWVGNTIWYQIFPERFANGNPSLSPENV LPWGSKDPTPTDFFGGDIEGITQHLDYLVELGINGVYLTPVFEAPTNHKYDTIDYKKIDPHFGDKEAFRKLVQEAHKRGI RIMLDAVFNHIGDTSAEWQDVVEKEEKSAYRDWFHIHSFPVRPNENGNIEGEPTLSYDTFAFTTHMPKLNTANPEVQAYL LDIATYWIREFDIDGWRLDVANEVDHAFWKEFKKAVQAEKEDIYILGEIWHDSWIWLLGDEFHAVMNYPFTQTIIENFIE EKITPEQMVSGINEQYMRYPNQVNEVMFNMLDSHDTARILTRANNDIDKVKQALTFMFAHTGSPCIYYGTEIGMNGGNDP GCRKCMEWDTKKQNQDMLAFTKKLIALRKENQAIITSGELSWLAASSETGITAFKRELNGEKLYFVFNQATENKNFTISF ENQATDIWNKEVVTENLTVPAKGFLVIKENS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 1e-144 | 49 |
