Name : Kvar_1553 (Kvar_1553) Accession : YP_003438490.1 Strain : Klebsiella variicola At-22 Genome accession: NC_013850 Putative virulence/resistance : Unknown Product : capsular exopolysaccharide family Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG3206 EC number : 2.7.10.2 Position : 1668654 - 1670810 bp Length : 2157 bp Strand : + Note : KEGG: kpn:KPN_02510 tyrosine autokinase; TIGRFAM: capsular exopolysaccharide family; PFAM: lipopolysaccharide biosynthesis protein DNA sequence : ATGTCCTCATTGGCAAATAACAAAACTTCACCACAAGATTCTGACGAAATTGATCTGGGAAGAATAATAGGTGAAATACT TGATCATCGTAAATTAATAATAGCAGTTACAGCTGTTGTGACATTTGTTGCTTTAGTGTATGTCCTTTTAGCAACACCGG TCTATCAAGCAAATGCACTAATTCAAATAGAGCAAAAGCAGGGGAATGCAATACTGAATAGTTTGAGTCAGATGCTTCCA GATAGCCAGCCACAATCTGCTCCAGAAATATCGCTTTTACAGTCAAGAATGATCCTTGGGAAAACGATCGATGATCTAAA CTTGCAATATAAAATAGAGCAAAAACATTTTCCTGTTCTCGGTGCTGGCTTGTCTCGTCTTTTGGGTTTAAATGAAGGTT CTGTAGATGTAAAAAAGTTATATATCCCTAATAATGGCGATGAAAGTCAGGATATTCTACTAAAAATACTGGATGAAAGA AGATACCAGATTGTTACAGATAACATAACTATAAATGGCACTGTTGGAACTCTTTTAAATAATAATGGCATTAGCATTCT TATTGATAAGATTAATGCTGATCCAGGAACAGAATTTTATATAAGATATGAAACTAAATTAAAAAAAATTGATGACCTTC AAAAAAAATTCAATGTAGCAGATCAAGGTAAAGATACTGGAATGCTTAACCTTACGTTAGTAGGGGAGGATCCAAAGTTA ATTAGAGAAATTCTGAACAGCATTAGTCAGAACTATTTGGCACAGAACGTTGAAAGACAGGCAGCTCAGGATGCCAAAAG CTTAGAATTTTTAAATGAACAATTACCAAAAGTCCGAAGTGATTTAGATGCTGCGGAAGATAAGTTAAACAATTATCGGA AGCAAAAAGACTCTGTAGATTTAACTATGGAAGCAAAATCTATCCTCGATCAGATTGTAAATGTAGACAATCAATTAAAC TCTCTAACTTTTAGGGAGGCTGAGGTTTCGCAACTTTATACTAAAGAACATCCAACGTACAAAGCGTTAATGGAGAAGAA AAAGACTTTACAAGAAGAAAAAGCCAAACTGAACAAACGCGTGAGTTCTATGCCTTCTACTCAACAAGAAGTTTTGCGAT TGAGTAGAGATGTTGAGTCTGGTAGAGCAGTCTACTTGCAGTTGTTAAATAGACAACAAGAATTAAATATCGCAAAGTCA AGTGCAATAGGTAATGTGAGAATAATTGACCAAGCAATAACAGAACCAAAACCGATACAGCCGAAATCATTAATTGTGGT TGCTGTTGGAATTCTTGCAGGGTTGTTTATTTCAATTGGTATTGTGCTTATTAAAGTTTATTTAAGAAGAGGTATAGAGT CTCCAGAGCAATTAGAGGAAATGGGGATAAATGTTTATGCAAGCATACCTGTTTCAGAGTGGCTTACTAAAAACTCTAGT AAGATAAAACTGAAAAAAAATGAATCTGAAAAGCTGTTGGCAATTGAAAACCCTGCGGACTTAGCTGTAGAAGCTATTAG AAGCTTACGTACTAGCCTGCATTTTGCAATGATGGAAGCAAAAAATAATGTTTTAATGATTTCAGGTGCTAGCCCGAACG CAGGGAAAACATTTATCAGTACTAACTTATCGGCAACCATAGCTTCCACAGGCAAAAAAGTTCTTTTCATCGATGCTGAC CTTCGTAAAGGTTATGTGCATAAGATGCTTGGTGGACAAAACATCCATGGGCTTTCAGATGTTTTGTCAGGACAAAGTTC AGTTGAAAGTGTAATAGAACGAATTCCAAGTGCGGAATTTGATTATATAGGAAGAGGCCAGGTCCCACCAAATCCTGCGG AATTATTAATGCACCGACGATTCGAAGCATTGTTAAAATGGGCTTCTGATAACTATGAGCTTGTAATTATTGATACTCCT CCAATTTTAGCTGTGACTGATGCTGCAATTATTGGTCGTTATGCTGGGACAACTCTTTTGGTTGCAAGATTTGAGGAAAA CACTGCGAAGGAAATTGCTGTTAGCGTTAAACGTTTTGAGCAAAGCGGTGTACTGGTTCGTGGCTGTATACTTAATGGTG TAGTTAAAAAGGCTAGTAGCTATTATGGTTACGGATATAACCATTATGGTTATTCATACGATAATCAGAAAAAATAA Protein sequence : MSSLANNKTSPQDSDEIDLGRIIGEILDHRKLIIAVTAVVTFVALVYVLLATPVYQANALIQIEQKQGNAILNSLSQMLP DSQPQSAPEISLLQSRMILGKTIDDLNLQYKIEQKHFPVLGAGLSRLLGLNEGSVDVKKLYIPNNGDESQDILLKILDER RYQIVTDNITINGTVGTLLNNNGISILIDKINADPGTEFYIRYETKLKKIDDLQKKFNVADQGKDTGMLNLTLVGEDPKL IREILNSISQNYLAQNVERQAAQDAKSLEFLNEQLPKVRSDLDAAEDKLNNYRKQKDSVDLTMEAKSILDQIVNVDNQLN SLTFREAEVSQLYTKEHPTYKALMEKKKTLQEEKAKLNKRVSSMPSTQQEVLRLSRDVESGRAVYLQLLNRQQELNIAKS SAIGNVRIIDQAITEPKPIQPKSLIVVAVGILAGLFISIGIVLIKVYLRRGIESPEQLEEMGINVYASIPVSEWLTKNSS KIKLKKNESEKLLAIENPADLAVEAIRSLRTSLHFAMMEAKNNVLMISGASPNAGKTFISTNLSATIASTGKKVLFIDAD LRKGYVHKMLGGQNIHGLSDVLSGQSSVESVIERIPSAEFDYIGRGQVPPNPAELLMHRRFEALLKWASDNYELVIIDTP PILAVTDAAIIGRYAGTTLLVARFEENTAKEIAVSVKRFEQSGVLVRGCILNGVVKKASSYYGYGYNHYGYSYDNQKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 6e-151 | 45 |