Gene Information

Name : GALLO_0398 (GALLO_0398)
Accession : YP_003429835.1
Strain : Streptococcus gallolyticus UCN34
Genome accession: NC_013798
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : PTS system ascorbate famfic transporter subunit IIC
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG3037
EC number : -
Position : 425688 - 427046 bp
Length : 1359 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAAGTGCTTTAAATATATTTGTTTCTATAGTTACTCAACCTGCCATTTTAGTCGCTCTCATTGCTTTAATTGGTTT
ACTTTTACAAAAGAAAAAATTCTCTGATGTAATGTCAGGGACAATTAAAACAATAGTTGGATTTCTTGTTTTAACAGGTG
GTTCAGGGATTTTGCAGAATGCCTTGGCTCCTTTTGCAAAAATGTTTCAAGTAGCTCTAAATACTCAAGGTGCTGTTCCT
AGTAATGAAGCTGTTGTTGCGATTGCTTTACAAGATTACGGAAGTCAAACAGCTTTAATTATGTTGGTTGGAATGATTGT
TAATATTCTATTGGCACGCTTTACACGTTTTAAATATTTATTTTTAACAGGTCAAGCTATGATGTATGTTTCTTGTATTA
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CACAATTATTTAGTTTTCTACGTGATTCAACAGTATCTATTATGTTATTAATGAGTGTAGTTTATGTCATCTTGGCACTG
GCAGCTGGCACAGGTTATGTAGAAAAAGAATTGAGTGATGGAACAAGTGCGATTGTTTATGCAATTATTCAAGCAGGGAC
ATTTACGGCAGGATTTGTAGTTGTTCTACAAGGTGTTCGTATGGTACTAGCAGAAATCGTTCCAGCATTTCAAGGTATTG
CTAAAAAATGGGTACCAAATTCTAAACCAGCATTGGATGTGCCAATTATCTTTTCTTATGCACCAAATGCAGTATTGATT
GGCTTTTTTACTAGTTTTATTGTTGGCACAATTTCAATGTTTATAATGATTGCTCTTCATACTACGGTTATTATTCCAGG
TGTAGTTGGACACTTCTTCTGTGGAGCTGCAGCAGGTATTTACGGAAATTCTACTGGTGGTAGAAGAGGAGCTGTTCTTG
GCTCTGCTGTTAATAGTTTACTTATAAGTTGGTTACCATTGGCTATTTTACCATTACTTGGTTCCCTTAAAATGGCAGCT
TCAACATTTGCTGATACAGATTATCTAATTCCAGGCTATATCTTAGGAAAAATTGGACAATTGGGGTCAGGTGCACTTAT
TACAGCAATCCTCGCTTTTGTATTTATTGTAATTGTAATAAGTATTATTCTTGATAAACGAACAGATTCTGAATTGTAA

Protein sequence :
MKSALNIFVSIVTQPAILVALIALIGLLLQKKKFSDVMSGTIKTIVGFLVLTGGSGILQNALAPFAKMFQVALNTQGAVP
SNEAVVAIALQDYGSQTALIMLVGMIVNILLARFTRFKYLFLTGQAMMYVSCITAVILISAGIKANPIVIILGGLFEGTL
LTITPALCQPFMKKITGNDNVAMGHTGNIGYAIAGWIGKWFGDKSKSTEDMDVPQLFSFLRDSTVSIMLLMSVVYVILAL
AAGTGYVEKELSDGTSAIVYAIIQAGTFTAGFVVVLQGVRMVLAEIVPAFQGIAKKWVPNSKPALDVPIIFSYAPNAVLI
GFFTSFIVGTISMFIMIALHTTVIIPGVVGHFFCGAAAGIYGNSTGGRRGAVLGSAVNSLLISWLPLAILPLLGSLKMAA
STFADTDYLIPGYILGKIGQLGSGALITAILAFVFIVIVISIILDKRTDSEL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 4e-81 50
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 4e-81 50
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 5e-81 49