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Name : UCYN_07010 (UCYN_07010) Accession : YP_003421778.1 Strain : Cyanobacterium sp. UCYN-A Genome accession: NC_013771 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : - Position : 793320 - 795332 bp Length : 2013 bp Strand : - Note : PFAM: Transketolase, C-terminal domain; Transketolase, pyrimidine binding domain; Transketolase, thiamine diphosphate binding domain; TIGRFAM: transketolase, bacterial and yeast DNA sequence : ATGATTGCTGCTACCCGGTCGCTCGAAGAACTTTGTATTAACTCTATTCGTTTTTTAGCTGTTGATGCTGTTGAAAAAGC AAAATCAGGTCACCCAGGGTTGCCAATGGGCGCAGCTCCAATGGCATTTGTTTTATGGGATAAATTTATGCGGTTTAATC CTAAGAACCCAAAGTGGTTTAATCGTGACCGTTTTATTCTGTCTGCTGGACATGGCAGTATGTTGCACTATGCTTTGCTT TATTTAACTGGCTACGACAGTGTAACTATTGACGATATTAAGGAATTTCGCCAGTGGGGTTCGAAAACTCCTGGACATCC TGAAAATTTTGAGACTGATGGTATTGAAGTAACTACTGGTCCTTTAGGGCAAGGCATCGCTAATGGTGTTGGGCTGGCTC TTGCAGAAGCACATTTAGCAGCTAAGTTTAACAAGCCTGATGCTACTATCGTTGATCACTATACCTATGTCATTTTAGGT GATGGTTGTAACATGGAAGGGGTTGCCAGCGAAGCATGCTCTATTGCAGGACATTGGGGACTGGGGAAATTGATTGCCCT TTATGATGATAATCATATCTCTATTGATGGTTCTACTGATGTAGCATTCACAGAAGATGTGTCTAAACGTTTTGAGGCCT ATGGATGGCATGTTTTACATGTAGAAAATGGTAATACTGATTTAGTGGCGATCGCTGAAGCTATTGAAAAAGCCAAGCAA GTTACCGATAAACCTACAATGATAAAGGTCACAACTACTATCGGCTACGGTTCTCCTAATAGACAAAATACTGCTGGAAT TCATGGAGCTGCTTTAGGTGCAGAGGAGATTGCACTTACTCGACAAAATTTAGGTTGGGAATATGAACCTTTCGTCATAC CTGAAAATGTTCTCACTCATATGGGCAAATCTATTGATAGAGGTGTAGATCATGAATCACAATGGAATCTTACTCTTAAT GATTACAAAGCAAAATATCCTCTAGAAGCTGCTGAATTTGAACGTTATATGAGTGGTAGACTTCCTGAAAATTGGACTCA GGTACTTCCAAGTTTCACTCCAGAAGAAGCTGGATTATCTACTCGTAAGTATTCTGCTAATATGTTGAATTACCTTTCTC CTGTATTACCTGAGTTACTAGGAGGATCAGCAGATTTAACTCATTCTAATTTAACAGAACTTAAAAATTCTGGAGATTTC CAGAAGGGACAGTACGAGAATCGTAATGTTCATTTTGGGGTCAGAGAGCATGCTATGGGAGCTATCTGTAATGGAATAGC ACTCCATAACTCTGGTTTGATACCTTATTGTGCTACATTTTTAATTTTTACTGATTACGTAAGAGCTTCTATAAGGCTAT CTGCTTTATCTCAAGCAGGAGTAATTTGGGTAACGACTCATGATTCTATTGGACAAGGAGAAGATGGGCCTACTCATCAA CCAGTAGAAACTGTAATGTCTTTACGCGCAATTCCAACTCTAACAGTTATAAGGCCTGCTGATGGGAATGAATGTTCAGG TGCTTATAAGATTGCGATTGAAAATGCACAAAGTAATTTACCAACTTTACTAGTACTTACTCGTCAGAACGTACCTAATT TGGCTGGAACCTCTATAGAAGGAGTTGATAAAGGAGCATACACCATACTTGATTGCGATGGTGAACCTGATATTATTCTT ATGGGAACAGGTTCTGAAGTTAGTTTGTGTGTATCTGCTGCTGAACAATTATCAAATATGAGTAAAAAAGTTCGAGTGGT TTCTATGCCTTGTTGGGAAAAATTTGAAGCACAAAATGCAGCTTACAAAGAGTCTGTGCTGCCTAAAGCTGTAACAAAGA GATTGTCTGTAGAAGCAGGTATTAGCTTAGGATGGACAAAGTATGTAGGTACTGAGGGAGATACCATTAGTATTGATTCT TTTGGTGCTTCTGCTCCTGGTAAAGTATGTATGGAAAAATTTGGTTTTACCATTGAAAATGTTATTGCTAAAGCCAAAAT GCTTTTAGGATAA Protein sequence : MIAATRSLEELCINSIRFLAVDAVEKAKSGHPGLPMGAAPMAFVLWDKFMRFNPKNPKWFNRDRFILSAGHGSMLHYALL YLTGYDSVTIDDIKEFRQWGSKTPGHPENFETDGIEVTTGPLGQGIANGVGLALAEAHLAAKFNKPDATIVDHYTYVILG DGCNMEGVASEACSIAGHWGLGKLIALYDDNHISIDGSTDVAFTEDVSKRFEAYGWHVLHVENGNTDLVAIAEAIEKAKQ VTDKPTMIKVTTTIGYGSPNRQNTAGIHGAALGAEEIALTRQNLGWEYEPFVIPENVLTHMGKSIDRGVDHESQWNLTLN DYKAKYPLEAAEFERYMSGRLPENWTQVLPSFTPEEAGLSTRKYSANMLNYLSPVLPELLGGSADLTHSNLTELKNSGDF QKGQYENRNVHFGVREHAMGAICNGIALHNSGLIPYCATFLIFTDYVRASIRLSALSQAGVIWVTTHDSIGQGEDGPTHQ PVETVMSLRAIPTLTVIRPADGNECSGAYKIAIENAQSNLPTLLVLTRQNVPNLAGTSIEGVDKGAYTILDCDGEPDIIL MGTGSEVSLCVSAAEQLSNMSKKVRVVSMPCWEKFEAQNAAYKESVLPKAVTKRLSVEAGISLGWTKYVGTEGDTISIDS FGASAPGKVCMEKFGFTIENVIAKAKMLLG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 4e-150 | 51 |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 1e-150 | 51 |
