Name : UCYN_00260 (UCYN_00260) Accession : YP_003421141.1 Strain : Cyanobacterium sp. UCYN-A Genome accession: NC_013771 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 22930 - 25536 bp Length : 2607 bp Strand : - Note : PFAM: tRNA synthetases class I (I, L, M and V); Anticodon-binding domain; tRNA synthetases class I (M); TIGRFAM: leucyl-tRNA synthetase, eubacterial and mitochondrial family DNA sequence : ATGAAAAATGTTCATAATAGAGAAACGATAGTGGAATCCCAGTATAAAACAGCAGAAATTGAAAATAAGTGGCAACAAGA GTGGCTGAGGCAAGGATTAGATAAAACCCCAGAAAACAGTGAAAAACAAAAATTCTACGCCTTATCAATGTTTCCTTATC CTTCTGGTAACTTACACATGGGACATGTGCGTAATTATGTAATTACTGACGTGATCGCTCGTTTCAAACGATTGCAAGGA TATTCTGTTTTACATCCTATGGGATGGGATGCTTTTGGGCTTCCAGCTGAAAACGCAGCTATTGATCGTGGTATTTCTCC TGAAGAGTGGACAAAAAAAAATATTGCAAAGATGAGACAACAACTCCAATCATTAGGTTTATCTATTGATTGGGAAAGAG AAATAACAACTTGTTCTCCTAGTTACTATAAGTGGACACAATGGCTGTTTTTACAATTCTATAAAGTTGGTCTAGCTTAT CAAAAAGAAGCAACTGTGAATTGGGATCCGGTTGATCAAACTGTCCTAGCAAATGAGCAGGTAGATACTGAAGGTTATTC TTGGCGTTCAGGCGCTAAAGTAGAAAAAAAACTCTTATGCCAATGGTTCTTAAAAATTACTGATTATGCTGAATATTTAT TAAATGATCTTAATACTTTAAAAGGATGGCCTGATAGTGTAAAGTTAATGCAAAAAAACTGGATAGGTAAATCTTTAGGG GCACATATACAGTTTCCTGTAAAAGATACTAAAAAAAGCATATCTATTTTTACTACTCGTCCAGACACTATCTATGGTGT AACTTACTTAGTCTTAGCGCCAGATCATCCTTTGGTAATGACAATAGCTAAGCCTGAACATAAAGAAAAGATAAGAAAAT TCACTCAAGAAGTAGCTAATGAGAGTGAGATTGAACGTACAGCAGATGATAAACCACTAAAAGGAATTTTTATAGGAGCG GAAGTAATCAATCCTTTTAGTGGGGATGAAATACCCGTATTTATAGCAAGTTATGTTCTACTTGACTATGGAACAGGCGC GGTAATGGGAGTTCCTGCCCATGATAATCGTGATTTTAAATTTGCTACAGAACAACAACTTCCTGTAAAAGTTGTTGTCA TTCCCAAAAATTCAAATTCAAGAGAAACTACTCAATTATCTTTGAAAGAAGCCTATATAGAATCAGGCACTATCATTAAT TCAGAACAATTTAATGGAATGTATTCAGAGGATGCAAAAGCTGCTGTCATTGAGTATGCAAAAAAACATTCTATTGGAGA GGCTAAAGTACAGTACAGAATAAGAGATTGGTTAATTTCTCGCCAACGTTACTGGGGTTGCCCCATTCCTATCATTCATT GCTCTGATTGTGGTACTGTGGCTATTCCTGATTCTCAATTGCCATTAGAATTGCCGAAAAATGTTGAATTTACTGGACGT GGAAGTTCTCCTTTAGAAGGCTTAAAAGAATGGGTTAATGTTCCTTGCCCTAATTGTGGCAAACTGGCAAAACGTGAAAC AGATACAATGGATACTTTTATTGATTCATCCTGGTATTACTTAAGATATACTGACTCCAAAAATTCTCAAGAAATATTTA ATCCTGACAAAGCTAAATATTGGGCACCAGTCGATCAATATGTAGGAGGAGTTGAGCACGCAATATTACATCTTCTGTAC TCTCGTTTCTTAACAAAGTTTTTAAAGAATCAAAAATTGATAGATATAAATGAACCCTTTAAAAATTTATTAACACAGGG AATGGTTCAAGGAATAACATACAAAAATTTAAAAACAGGAAAATATATTCCCTGTGATCAAGTGAATTCTGCAAAACCAA CAGATCCCGTTACAGGAGATGATTTAGAAGCCTTTTATGAGAAAATGTCTAAGTCTAAATATAATGGAGTAGATCCACAA GAGGTCTTGGAAAAATATGGAGCAGATACTGCGAGAATGTTTATATTATTTAAAGCACCTCCGGAAAAAGATCTAGAGTG GAGTAGCTCAGATGTTGAGGGACAGTTTCGTTTCTTAAATCGAGTATGGCGTCTAGTTCATTTATATATACAAAATAAAA ACAACAAGACACAAAGTAAAACATTAACTAAAAATGAAAAAGATCTAAAGCGTTCTATTCATACCATTATCAAAGAAGTA TCTCAAGACTTGGAAGAAAATTATCAATTCAATACAGCAATTGCAGAATTAATGAAATTAAGTAATGTACTTAATGATTT TAAAGATATCAATTCTTCAGTATACCAAGAGGGTATAGTAGCTCTTTTGACTTTGTTATCACCCTTTGCCCCTCATATTT CTGAAGAATTATGGCATAGCCTAGGATATAAAGAATCAATACATCTACAGAAATGGCCATCAGTTGATAATCAAGCCTTA GTTTTAGATGAAGTTACTATAGTAATTCAAGCTATGGGAAAAACAAAAGGAACTATTCAAGCTCCAGCAAATAGTAGTAA TGAAGAATTGGAGAAGTTAGCTCGTAATTCGGAAATTGGCAAACGTTTGCTAAACAAAAAAGAAATTAAAAAAACTATTG TAGTTCCTCAAAAACTAGTTAACTTTGTATTAATTAATAATAATTAA Protein sequence : MKNVHNRETIVESQYKTAEIENKWQQEWLRQGLDKTPENSEKQKFYALSMFPYPSGNLHMGHVRNYVITDVIARFKRLQG YSVLHPMGWDAFGLPAENAAIDRGISPEEWTKKNIAKMRQQLQSLGLSIDWEREITTCSPSYYKWTQWLFLQFYKVGLAY QKEATVNWDPVDQTVLANEQVDTEGYSWRSGAKVEKKLLCQWFLKITDYAEYLLNDLNTLKGWPDSVKLMQKNWIGKSLG AHIQFPVKDTKKSISIFTTRPDTIYGVTYLVLAPDHPLVMTIAKPEHKEKIRKFTQEVANESEIERTADDKPLKGIFIGA EVINPFSGDEIPVFIASYVLLDYGTGAVMGVPAHDNRDFKFATEQQLPVKVVVIPKNSNSRETTQLSLKEAYIESGTIIN SEQFNGMYSEDAKAAVIEYAKKHSIGEAKVQYRIRDWLISRQRYWGCPIPIIHCSDCGTVAIPDSQLPLELPKNVEFTGR GSSPLEGLKEWVNVPCPNCGKLAKRETDTMDTFIDSSWYYLRYTDSKNSQEIFNPDKAKYWAPVDQYVGGVEHAILHLLY SRFLTKFLKNQKLIDINEPFKNLLTQGMVQGITYKNLKTGKYIPCDQVNSAKPTDPVTGDDLEAFYEKMSKSKYNGVDPQ EVLEKYGADTARMFILFKAPPEKDLEWSSSDVEGQFRFLNRVWRLVHLYIQNKNNKTQSKTLTKNEKDLKRSIHTIIKEV SQDLEENYQFNTAIAELMKLSNVLNDFKDINSSVYQEGIVALLTLLSPFAPHISEELWHSLGYKESIHLQKWPSVDNQAL VLDEVTIVIQAMGKTKGTIQAPANSSNEELEKLARNSEIGKRLLNKKEIKKTIVVPQKLVNFVLINNN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 4e-169 | 44 |