|
Name : inlB (LM5923_0467) Accession : YP_003415675.1 Strain : Listeria monocytogenes 08-5923 Genome accession: NC_013768 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Internalin B Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4886 EC number : - Position : 471292 - 473184 bp Length : 1893 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGTCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTCCAGATGATGCTTTTG CAGAAACAATCAAAGACAATTTAAAGAAAAAAAGTGTGACAGATGCAGTGACACAAAATGAATTAAATAGTATAGATCAA ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG GAATAAACTAACAGATATAAAACCCTTAACAAACTTGAAAAATTTAGGATGGCTTTTTTTAGACGAAAATAAAATTAAAG ACCTAAGTTCGCTCAAGGATCTAAAAAAATTAAAATCACTTTCTTTGGAGCATAATGGTATAAGTGATATAAACGGACTT GTTCATTTACCACAGCTGGAAAGTTTGTATTTGGGAAATAATAAAATAACGGATATAACGGTTCTTTCACGTTTAACTAA ACTGGATACTTTGTCTCTCGAAGATAACCAAATTAGTGATATTGTGCCACTTGCAGGTTTAACTAAATTGCAGAACCTAT ATTTAAGTAAAAATCACATAAGCGATTTAAGAGCATTAGCAGGACTTAAAAATCTAGATGTTTTAGAATTATTTAGCCAA GAATGTCTTAATAAGCCTATTAATCATCAATCTAATTTGGTCGTTCCGAATACAGTGAAAAACACTGATGGGTCGTTAGT GACTCCAGAAATAATAAGTGATGATGGCGATTATGAAAAACCTAATGTTAAATGGCATTTACCAGAATTTACAAATGAAG TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTGCACC TAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAAAAAGCAGTCAACTTAACC CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT AGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAATGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACCGCTTATGCA AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAACACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACACCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGCATGGAAAAGCCAACCCGTTTAACT CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA Protein sequence : MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVSTPIKQIFPDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLTNLKNLGWLFLDENKIKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL VHLPQLESLYLGNNKITDITVLSRLTKLDTLSLEDNQISDIVPLAGLTKLQNLYLSKNHISDLRALAGLKNLDVLELFSQ ECLNKPINHQSNLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK EVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAETTEKAVNLT RYVKYIRGNAGIYKLPREDNSLKQGTLASHRCKALTVDREARNGGKLWYRLKNIGWTKAENLSLDRYDKMEYDKGVTAYA RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlB | CAC20629.1 | internalin B | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 99 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlB | YP_003415675.1 | Internalin B | VFG0076 | Protein | 0.0 | 99 |
