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Name : qoxB (LM5578_3008) Accession : YP_003415116.1 Strain : Listeria monocytogenes 08-5578 Genome accession: NC_013766 Putative virulence/resistance : Unknown Product : AA3-600 quinol oxidase subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 3012966 - 3014945 bp Length : 1980 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAATGGAATGAGTTTATCGTAACTGGCGACCCAATGATTTTAGGCGCGCAGATTTCTATCGTACTTGTAAGTATTGG TGTTGTTGCGTTACTAACTTATACAAAAAAATGGAAGTGGCTCATGAAAGAGTGGATTTCTTCCGTTGATCATAAAAAAA TAGGTATTATGTATTTGCTTGCTGCTGTCTTAATGTTTTTCCGTGGTGGTGTGGATGCGCTAATGATGCGTACCCAGCTC GCTTTACCGGATATGAAATTTTTAGACGCACAGCATTACAATGAAGTATTTTCTACTCACGGAACGATTATGATTTTATT TATGGCGATGCCGTTTATCATCGGATTGATGAACATTGCCGTACCACTTCAAATTGGTGCGCGTGATGTAGCATTTCCGT TTTTAAACAACTTAAGTTTTTGGACGTTCTTTATGGGAGCGATGCTATTTAACTTATCATTCGTAATTGGTGGTTCGCCA GATGCTGGTTGGACAAACTATGCGCCACTTGCGACAGATTTTAGCGCGGGATATGGAATTAACTTCTATCTTCTAGGTGT TCAAATCGCTGGTATTGGTACGCTGATGACGGGGATTAACTTTTTCGTTACGATTTTAAGAATGCGTACAAAAGGTATGA CGTTAATGAAAATGCCAATGTTTACTTGGTCTTCATTAATTACAAGTTTGATCATTATTTTCGCTTTCCCAGTTTTAACA GTGGCACTTGCTTTGATGTCATTTGACCGACTGTTTGGGACAGCATTCTTCACACTCACGAATGGTGGGCTCCCAATGAT GTGGGCCAACTTGTTCTGGGTTTGGGGGCATCCGGAAGTATATATTGTTATTTTGCCAGCTTTCGGTATTTTCTCAGAGA TTATTTCTACTTTCTCGAGGAAAAAATTATTCGGTTATCCGGCGATGGTTGCCGCGATGGCAGTTATTTCTTTACTAAGT TTCCTAGTTTGGGTCCATCACTTCTTTACAATGGGATCAGGGGCGCTTGTTAACTCCTTCTTCTCCATTACAACGATGAT GATTGCGATACCGACCGGGATTAAGATATTCAACTGGCTCTTTACGATGTACAAAGGGCGAATAACCTTTACAACGCCAA TGCTTTGGTCGCTTGCCTTTATCCCTAACTTTGTTGTTGGTGGGGTAACTGGGGTTATGCTTGCGATGGCTGCGGCCGAT TATCAATATCACAATACGTACTTCTTAGTATCCCATTTCCACTACGTATTAATTGCTGGAACCGTGTTCTCCTGCTTTGC CGGGCTTACATACTGGTATCCAAAAATGGTCGGTTACAGACTAAATGAAAAAATTGGTAAATGGTTCTTCTGGATTTTCG TTGTTGGATTTAACGTTTGTTTCTTCCCGCAATATTTCCTAGGACTAGATGGTATGCCGCGTCGTATTTACACTTACGTA CAAGGTGATGGCTGGACAACGCTTAACTTTATCTCTACAGTTGGCGGATTCTTGATGGGTGTGGCATTCTTAGTTCTTTG CTACAACATCTACTACAGCTACAAAAACTCTAAACGTGAAGTTACTGGTGACCCGTGGGATGCTCGTACGCTTGAATGGG CTACAAGTTCTGCAGTTCCTCCAAAATATAACTTTGCTGTTTTACCAGAATGGAATGACTTGGATGATTTCTGGAATAGA AAACAAAAAGGCGATCCATATGTAAATGATAAAAATTATAAACCAATCCATATGCCAAGTAATACCATGGTTGGGTTTGT AATGTCTGTCTTCTTCTTCATTGCAGGTTTCGGACTAGTCTTCTACTGGTACTGGATGGGAATTATTGGTCTAGTTGGTA TTTTAGGATGTATGATTTATCGTTCATTCCAAAATAACGATGGTTACCACGTTGAAGTGGAAGAAATTAAAGCAACAGAA GAACATAATGCGCGCGAACTTGCGACTGGTGTGAAGGAGGGAAACCCATGGAATCTGTAG Protein sequence : MKWNEFIVTGDPMILGAQISIVLVSIGVVALLTYTKKWKWLMKEWISSVDHKKIGIMYLLAAVLMFFRGGVDALMMRTQL ALPDMKFLDAQHYNEVFSTHGTIMILFMAMPFIIGLMNIAVPLQIGARDVAFPFLNNLSFWTFFMGAMLFNLSFVIGGSP DAGWTNYAPLATDFSAGYGINFYLLGVQIAGIGTLMTGINFFVTILRMRTKGMTLMKMPMFTWSSLITSLIIIFAFPVLT VALALMSFDRLFGTAFFTLTNGGLPMMWANLFWVWGHPEVYIVILPAFGIFSEIISTFSRKKLFGYPAMVAAMAVISLLS FLVWVHHFFTMGSGALVNSFFSITTMMIAIPTGIKIFNWLFTMYKGRITFTTPMLWSLAFIPNFVVGGVTGVMLAMAAAD YQYHNTYFLVSHFHYVLIAGTVFSCFAGLTYWYPKMVGYRLNEKIGKWFFWIFVVGFNVCFFPQYFLGLDGMPRRIYTYV QGDGWTTLNFISTVGGFLMGVAFLVLCYNIYYSYKNSKREVTGDPWDARTLEWATSSAVPPKYNFAVLPEWNDLDDFWNR KQKGDPYVNDKNYKPIHMPSNTMVGFVMSVFFFIAGFGLVFYWYWMGIIGLVGILGCMIYRSFQNNDGYHVEVEEIKATE EHNARELATGVKEGNPWNL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 5e-90 | 45 |
