Gene Information

Name : LM5578_1961 (LM5578_1961)
Accession : YP_003414070.1
Strain : Listeria monocytogenes 08-5578
Genome accession: NC_013766
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG0733
EC number : -
Position : 1951584 - 1952939 bp
Length : 1356 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGCAAGAAAACAGAGAAGAATGGGGCTCAAAAGTCGGATTTATATTAGCATCCGCTGGGTCCGCAATAGGAATTGGTGC
AATATGGAAACTGCCTTATGTGGCTGCAACTGCAGGAGGTGGCGCATTTTTCTTATTGTTTTTAGTTTTAACTTTGCTCG
TTGTTATGCCGCTTTTAATTGCAGAATTTGTGATTGGACGAGGTTCTGGCGGTGATGCCGTTCAAGCTTATAAAACACTC
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TTCTCGATGCTTGAAGCGACGGTTGCGCCACTGATGAATGCGGGTGTTAATCGTAAAAAAGCAAGTCTTTGGATGGGACT
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TTGATGCTGCCGATTATCTTGTGTCGAATATTATCTTGCCAGTTGGTGCATTATTTATCGCGATTTTCGTTGGGTATCGA
TTACCTCGTGAACTTCTTTTAAAAGAATTTACCACAAGCAGTCATTTTGGTAAAAAAGTGTTTATTGTTTGGCTCTTTCT
TATTAAATATATTGCGCCAATCGCGATTATTTTGGTCTTTCTTTCAGCAACTGGTTTAATCGATTTTCTGTTTTAA

Protein sequence :
MQENREEWGSKVGFILASAGSAIGIGAIWKLPYVAATAGGGAFFLLFLVLTLLVVMPLLIAEFVIGRGSGGDAVQAYKTL
APGTKWSLLGKLGVVGASILFSFYSVVGGWIITYLIKTLAGGIAGENQASLLHDFQVTTANPWISVGATILFILLNVIVI
SRGVVSGIEKMSKFMMPALFILFIVLIIRSLTLPGAMEGVAFFLRPDFSHFTAQTVLITLGQAFFSLSVGISVMVTYSSY
LNRSTSLPQSAISVSLMNVFVSLLAGLAIFPAAFSFNITPDAGPGLLFVILPSIFNQMPFGMLFFIIFLILFLFAALTSS
FSMLEATVAPLMNAGVNRKKASLWMGLLIVLMAIPSALSFGVWSDVQIFGLSIFDAADYLVSNIILPVGALFIAIFVGYR
LPRELLLKEFTTSSHFGKKVFIVWLFLIKYIAPIAIILVFLSATGLIDFLF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAS0416 YP_042543.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 2e-61 46
SAR0458 YP_039907.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 2e-61 46