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Name : tex (LLKF_0335) Accession : YP_003352807.1 Strain : Lactococcus lactis KF147 Genome accession: NC_013656 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transcription accessory protein (S1 RNA binding domain) Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 327136 - 329274 bp Length : 2139 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGGAAAATGTTAAAAAAATTGCTGAATTGTTGAATATTAAAAATTCACAAGTTGAAAAAGTATTAGAATTGACGGCAGA GGGGAACACAGTTCCGTTTATTGCTCGTTATCGTAAAGAAGCAACAGGTTCACTTGACGAAGTTGAAATCAAAAAAATTA TTGATGAAGATAATTTACTGACAAAATTATCAGAACGTAAAACGGCTGTTTTGTCAAAAATTGAAGAGCTTGGTAAGTTG ACTGATTCGCTAAAAGCACAAATTTTGGCTGCTGAAAAACTAACAGAAGTTGAAGATTTATATTTGCCTTACAAAGAAAA ACGGCGCACAAAAGCAACGATTGCAAAGGAAAATGGTTTATTTCCTTTGGCTCAATTGATTGTAAAAAATTCAGCGAATC TTGAAGAAGAAGCTGAAAAATTTGTCAATGAGAATTTTACAAGTCCTCAAAAAGCTTTGGAAGGTGCCGTGGATATCTTG TCAGAAGCGATTTCTGAGGATGCACGGTTGCGTTCATGGCTGACTGGTGAAATCAAAAACAATAGTTTACTGACAAGTAG TTTGAAAAAAGATGCCGTTGATGAAAAGCAAGTTTTTCAAATGTATTATGAATTCTCAGAAAAAGTTTCAGAATTACCAA ATTATCGTGTATTGGCTTTAAACCGTGGTGAAAAATTGGGGATTCTGTCAGTAAAATTTGAAAATAACGAAGATAAAATT TTACGTTATTTTGCCGCCCGTTTTGCTGCTCAAAATAATCCAATGATGCAAGTGGCGATTAAAGATGCTGTCAAGAAAAA ATTGATTCCGGCTATGGAACGTAGTATTCGGACTGATCTGACAGAAAAAGCTGAAGCTTCTGCCATCGAAGTTTTTGGCG AAAATTTGAAAAATCTGTTGTTGGTGGCTCCGCTTAAAGGGCGTGTAGTCATGGGATTTGACCCTGCTTACCGTACTGGA GCAAAGCTTGCTATTGTTGATGAGACAGGTAAATTATTGATGACAACGGTCATTTATCCTGTGAAGCCAGCAAATGCAGG TCAAATTGCTCAAGCGAAAAAAGATTTAGCAAAATTCATTCGAGAATATGGTGTGAATATGATTGCGATTGGGAATGGAA CTGCCAGTCGCGAATCTGAAAGTTTTGTTGCAGAAGTACTCAAGGAAAATAATTTTTCTGATGTTTATTATGTGATTGTC AGTGAATCTGGAGCCTCTGTTTATTCAGCGAGCGAGTTGGCACGTGAAGAATTTCCAGAATTGACTGTTGAAAAACGTTC AGCAATTTCGATTGCACGCCGTTTGCAAGATCCATTGGCTGAACTTGTAAAAATCGAACCAAAAGCCATTGGTGTTGGTC AATATCAACATGATGTTTCTGAGAAAAAATTAACAGAAAATCTTGATTTTGTCGTGGAAACAGTAGTTAACCAAGTTGGT GTTAATGTCAATACAGCCAGTCCTAGTTTGCTTTCACACGTAGCTGGTCTTAATAAAAGTTTGGCACAGAATGTAGTAAA ATATCGTGAAGAAAATGGCGCACTCAAAACAAGAGCGGAACTAAAAAAAGTCCCACGTTTGGGAGCTAAAGCATTTGAAC AAGCGGCAGGTTTCTTAAGAATTCCAGAAGGTAAAAATTTCCTTGACAACACCGGTGTTCACCCAGAATCTTATAAAGTG ACGGAACAACTTTTGGCGGAAATTTCCGCTGATAAACCTGTCAGTAACGAAGAATTGCTGACCAAACTTTCGTCAGTAAA TATTCCTGAAATGGCTGAAAAACTTGGTCTTGGTCAGGAAACATTGACTGATATTATCAATGATTTACAAAAACCGGGCC GTGATTTGCGTGATAGTTTTGATGCCCCAATTTTAAGACAAGATGTTTTGTCAGCTGGAGATTTACAAATTGGTCAACAA CTTGAAGGTGTGGTCCGTAACGTTGTCGATTTCGGTGCCTTTATTGATATCGGAATTAAAAATGATGGCTTGGCACACGT TTCTGATTTGAGCAAATCTTTTGTCAAAAATCCAAGTGATGTTGTCGCTGTAGGACAAATCGTAACGGTTTGGGTTAAAT CTCTCGATTTACAAAGAGGGAAAATTAATTTAACCTTAGTGAACCCACGAGAAAAATAA Protein sequence : MENVKKIAELLNIKNSQVEKVLELTAEGNTVPFIARYRKEATGSLDEVEIKKIIDEDNLLTKLSERKTAVLSKIEELGKL TDSLKAQILAAEKLTEVEDLYLPYKEKRRTKATIAKENGLFPLAQLIVKNSANLEEEAEKFVNENFTSPQKALEGAVDIL SEAISEDARLRSWLTGEIKNNSLLTSSLKKDAVDEKQVFQMYYEFSEKVSELPNYRVLALNRGEKLGILSVKFENNEDKI LRYFAARFAAQNNPMMQVAIKDAVKKKLIPAMERSIRTDLTEKAEASAIEVFGENLKNLLLVAPLKGRVVMGFDPAYRTG AKLAIVDETGKLLMTTVIYPVKPANAGQIAQAKKDLAKFIREYGVNMIAIGNGTASRESESFVAEVLKENNFSDVYYVIV SESGASVYSASELAREEFPELTVEKRSAISIARRLQDPLAELVKIEPKAIGVGQYQHDVSEKKLTENLDFVVETVVNQVG VNVNTASPSLLSHVAGLNKSLAQNVVKYREENGALKTRAELKKVPRLGAKAFEQAAGFLRIPEGKNFLDNTGVHPESYKV TEQLLAEISADKPVSNEELLTKLSSVNIPEMAEKLGLGQETLTDIINDLQKPGRDLRDSFDAPILRQDVLSAGDLQIGQQ LEGVVRNVVDFGAFIDIGIKNDGLAHVSDLSKSFVKNPSDVVAVGQIVTVWVKSLDLQRGKINLTLVNPREK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 3e-138 | 46 |
