Gene Information

Name : LLKF_1780 (LLKF_1780)
Accession : YP_003354184.1
Strain : Lactococcus lactis KF147
Genome accession: NC_013656
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : PTS system subunit IIC
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG3037
EC number : 2.7.1.69
Position : 1836596 - 1837981 bp
Length : 1386 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAATGGTATTTTAAACTTTATTGTATCAGTCGCAACTACTCCAGCGCTTTTAGTTGGATTAATTGCAATGTTGGGATT
GATTTTGCAGAAAAAAACAGCAAGTACAGTTATCCAAGGTTCAATTAAAACATTTGCAGGTTTTTTGGTTTTGACCGGGG
GTGCGGGGATATTAGTTACCTCATTGAATCCCTTTGCAACGATGTTTCAACATGTCTTTAATGCTAAGGGAGTTGTACCA
TCCAATGAAGCGGTGGTTGCTTTAGCATTAGTGAAGTATGGAACACCCGCTGCCTTAATTATGATTGTGGGATTTATTGT
CAATGTAATACTTGCACGTTTTACAAGATTTAAATATATTTTCTTGACTGGGCAAGCAATGCTCTATGTATCAACAATGT
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CAATATGGGCTATGCTCTATCCGGTTGGCTTGGAGAAAAATTTGGAAATAAGGATCCAGAAAAATCAACTGAAAAATTAA
ATATCCCTAAAAACCTTGGGTTTTTGAGAGATTCTACTGTTTCTATTTCTCTAGTAATGATGGTTGTCTATATTATTTTA
GCGTTAATTGCAGGGCCTCATTTTGTTGAAAGTCCAGCTTTGTCTGCTGGAACTAATTATATTGTCTATGCGGTCATTCA
AGCAGGGACTTTTGCAGCAGGATTTGTGGTTGTTCTTCAAGGTGTTCGTATGATTTTGTCAGAAATTATTCCAGCATTTC
AAGGGATTGCTAAAAAGCTTGTTCCTAACTCAAAGCCTGCATTAGATGTTCCGATAGTATTTCCTTATGCGCCCAATGCT
GTTTTAATTGGATTTTTTGTCTCATTTATTGTTGGAGTTATTTCTATGCTAATCATGCTTGGCTTAGGAACAACTGTAAT
TATTCCTGGTGTTGTTGGTATCTTCTTTTGTGGAGGAGCAGCAGGAGTTTATGGCAATGCTTTTGGAGGTTTGCGTGGGG
CGATTATCGGCTCAACGGCGAATGGAATACTGTTAGCTTGGGGTCCACTTTTAATTCTGCCTGCCTTAGGTTCGTTTGGA
GCGAATTCTGCATCGACCTTTGCAGATTCAGATTATATTGTTTCAGGAGGATTGCTTGGGGTAATTGGCAAAGCTGGATC
AATAGCATTAATTTCCTTTATAATAATTTTTCTCTTGATTGTATTAATGACGAGTTTGATTTTGAATAGAAGAGATAAAA
TTAATTCAAAAAGCAAAGAATTATAA

Protein sequence :
MNGILNFIVSVATTPALLVGLIAMLGLILQKKTASTVIQGSIKTFAGFLVLTGGAGILVTSLNPFATMFQHVFNAKGVVP
SNEAVVALALVKYGTPAALIMIVGFIVNVILARFTRFKYIFLTGQAMLYVSTMSAVVLISAGLGNGWLTILLGGIFEGTL
LTITPALTQRYMRKITSNDGVAMGHTGNMGYALSGWLGEKFGNKDPEKSTEKLNIPKNLGFLRDSTVSISLVMMVVYIIL
ALIAGPHFVESPALSAGTNYIVYAVIQAGTFAAGFVVVLQGVRMILSEIIPAFQGIAKKLVPNSKPALDVPIVFPYAPNA
VLIGFFVSFIVGVISMLIMLGLGTTVIIPGVVGIFFCGGAAGVYGNAFGGLRGAIIGSTANGILLAWGPLLILPALGSFG
ANSASTFADSDYIVSGGLLGVIGKAGSIALISFIIIFLLIVLMTSLILNRRDKINSKSKEL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 5e-90 49
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 5e-90 49
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 4e-90 49