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Name : busAB (LLKF_1558) Accession : YP_003353987.1 Strain : Lactococcus lactis KF147 Genome accession: NC_013656 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter permease/substrate-binding protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 1605914 - 1607635 bp Length : 1722 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGATTTAGCTATTGGACAAGTACCCATAGCAAACTGGGTGTCATCGGCAACAGATTGGATTACTAGTACTTTTAG TTCAGGATTTGATGTGATTCAAAAATCAGGAACGGTATTGATGAACGGTATTACAGGTGCTTTAACTGCTGTTCCATTCT GGTTGATGATTGCTGTTGTTACTATCCTTGCCATTTTGGTTTCAGGTAAAAAAATTGCCTTTCCTTTATTCACTTTCATC GGTCTTTCTTTAATTGCTAACCAGGGCTTATGGTCAGATTTGATGAGTACAATCACACTTGTCTTACTTTCAAGTTTATT GTCAATCATCATTGGAGTTCCTTTAGGGATTTGGATGGCCAAATCTGATTTAGTGGCTAAGATCGTTCAACCGATTTTGG ACTTTATGCAAACAATGCCTGGTTTCGTTTATTTGATTCCAGCGGTTGCATTCTTTGGAATTGGAGTTGTTCCTGGGGTA TTTGCCTCTGTTATCTTTGCACTTCCACCAACAGTCAGAATGACTAACTTGGGAATTCGTCAAGTTTCAACAGAATTAGT TGAAGCGGCAGATTCATTTGGTTCAACTGCCCGTCAAAAGCTCTTTAAATTGGAATTTCCTTTGGCTAAAGGAACGATTA TGGCCGGTGTTAACCAAACGATTATGTTAGCTCTTTCTATGGTTGTTATCGCTTCTATGATTGGGGCGCCTGGCTTAGGT CGTGGTGTACTTGCAGCCGTTCAATCAGCTGATATTGGTAAAGGGTTTGTAAGTGGGATTTCATTAGTTATTTTGGCTAT TATTATTGACCGCTTTACACAAAAACTTAATGTTTCTCCTCTTGAAAAACAGGGAAATCCTACAGTTAAAAAATGGAAAC GTGGAATTGCCTTAGTTTCATTGTTAGCTTTAATTGTTGGTGCCTTTTCAGGAATGTCTTTTGGAAAAACAGCCTCTGAT AAAAAAGTTGACTTAGTTTATATGAACTGGGATTCAGAAGTTGCATCAATCAATGTTTTGACTCAAGCGATGAAAGAACA TGGCTTTGATGTAAAAACGACAGCTTTAGATAATGCAGTGGCTTGGCAAACGGTAGCCAATGGTCAAGCAGATGGAATGG TTTCTGCTTGGTTACCAAATACTCATAAAACACAATGGCAAAAATATGGTAAATCTGTTGATTTGTTAGGTCCTAACCTT AAAGGGGCTAAAGTTGGGTTTGTTGTTCCAAGTTATATGAATGTTAATTCAATTGAAGATTTAACAAATCAAGCGAATAA GACAATCACAGGTATTGAACCAGGTGCAGGTGTAATGGCTGCGAGTGAAAAAACGCTTAATAGCTATGATAATCTTAAAG ATTGGAAACTTGTTCCTTCATCATCAGGTGCAATGACTGTAGCTCTTGGTGAAGCAATCAAACAACATAAAGATATTGTC ATTACTGGTTGGTCTCCTCATTGGATGTTTAACAAATATGATTTGAAATATTTGGCTGATCCAAAAGGAACAATGGGAAC TTCAGAAAATATTAATACCATTGTTCGTAAAGGTTTGAAGAAAGAAAATCCAGAAGCTTATAAAGTTTTAGATAAGTTTA ATTGGACAACTAAGGATATGGAAGCTGTCATGCTTGATATTCAAAATGGTAAAACACCAGAAGAAGCTGCCAAAAATTGG ATTAAAGATCATCAAAAAGAAGTTGATAAATGGTTTAAATAA Protein sequence : MIDLAIGQVPIANWVSSATDWITSTFSSGFDVIQKSGTVLMNGITGALTAVPFWLMIAVVTILAILVSGKKIAFPLFTFI GLSLIANQGLWSDLMSTITLVLLSSLLSIIIGVPLGIWMAKSDLVAKIVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGV FASVIFALPPTVRMTNLGIRQVSTELVEAADSFGSTARQKLFKLEFPLAKGTIMAGVNQTIMLALSMVVIASMIGAPGLG RGVLAAVQSADIGKGFVSGISLVILAIIIDRFTQKLNVSPLEKQGNPTVKKWKRGIALVSLLALIVGAFSGMSFGKTASD KKVDLVYMNWDSEVASINVLTQAMKEHGFDVKTTALDNAVAWQTVANGQADGMVSAWLPNTHKTQWQKYGKSVDLLGPNL KGAKVGFVVPSYMNVNSIEDLTNQANKTITGIEPGAGVMAASEKTLNSYDNLKDWKLVPSSSGAMTVALGEAIKQHKDIV ITGWSPHWMFNKYDLKYLADPKGTMGTSENINTIVRKGLKKENPEAYKVLDKFNWTTKDMEAVMLDIQNGKTPEEAAKNW IKDHQKEVDKWFK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 1e-151 | 60 |
