|
Name : Smon_0676 (Smon_0676) Accession : YP_003306026.1 Strain : Streptobacillus moniliformis DSM 12112 Genome accession: NC_013515 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ABC transporter Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG1132 EC number : - Position : 764507 - 766228 bp Length : 1722 bp Strand : + Note : PFAM: ABC transporter related; SMART: AAA ATPase; KEGG: dno:DNO_0443 ABC transporter DNA sequence : ATGAAGAATTATTATAAAAAAATTTATTCCTTATCTGAACAAGGTGCAAAGAATTTAACTAAATCAACATTGATTTGTTT TATAACATACTTCATTAATTTAGCTCCAATAACTATTTTAATGTTATTACTTAATCAATTAATTTTAGGAGATGTAATTA GCCCATTTAAATATGTATTTATGAGTATATTAACTTTAGTATTTATGTATTTATTATTATCGACTGAATATGTTAATTTA TATAATGCAACTTACAAGGAATCGGCAAATTTAAGAAAAGAAATTTCTAAAAATTTAGCTGACCTTTCTATTTCTTATTT CTCTAAGCATGATTTATCAGATTTATCTCAAACTATTATGTCAGATGTACAAGTTATTGAACATGCTATGAGCCACTCTA TACCAAAAGTGGTTGGTATGTGGTTATTTTTCCCAATTATGGGAGTTATGATGTTAATTGGTAACTGGAAATTAGGTCTT GCTGTTATTATTCCAACTCTTTTAAGTTTTGTAATATTACCATTAAACAAGAGAAAAATAAATTCAGGAGATAGTAAATA TTTTAATATACTTAGGGAAAATTCAGAATTATTTCAAGAAACAATAGAGTTACAACAAGAAATAAGCAGTTTTAATCAAT CTGATAAAGTAAAAAAAGAATTATATAAAAAAATGGAAGAAAGAGAAAAAATTCATTTTAAAATTGAAATAAAGTTATTT TCAATTGTTGCTTTATCTTCACTTTTTTCTTATGCTAGTGTAGCAGTAGTAATATTAGTTGGAATATATCTTTTAATTAA TAATCAAATAAACCTTATATATTTAATTGGATATATAATATCAGCTATAAAAGTAAAAGAATTATTTGATATTTCTAAAG AAGGATTATTAGAAATGTTTTATATAGAACCTGCTGTTATAAGAATTAAAGAAATGAAAAATGAGGTTATTAAAGAGGGA GAAGATGTAAGTTTTTCTAATTATGATATAGAATTTAAAAATGTATCATTTTCTTATAACAAAGACAATAAAGTATTAAA GGATATAAGTTTTGTAGCTAAACAAGGAGAAGTTACTGCGCTTGTAGGTACTTCTGGTTCTGGTAAAACATCAATTCTAA GACTTGTATCAAGACTTTATGATTATAATGATGGGCATATATTAATTGATGGTAAAGAGATTAAAAATGTATCAACTGAC TCATTATTTAAAAACATTTCTATAGTTTTCCAAGATGTAGTTTTATTTAATACAAGTATTTTAGAAAATATTCGTTTAGG TAATGAAAAAGCTACTGATGAAGAAGTTAAAAAAGCAGCAGAACTTGCAAATTGTATGGATTTTATAGAAAAACTTCCAG ATGGTTTTGATAGCTATATTGGTGAAAACGGAGCAGAGTTATCAGGTGGAGAAAGACAAAGAATTTCTATTGCTAGAGCT TTTTTAAAGAATGCACCAATATTAATATTAGATGAAATATCATCGAGCCTTGATGTAGATAATGAAAAGAAAATACAGGA AAGTTTAAATAAATTAATAAAAGATAAAACTGTAATAATTATTTCACATAGATTAAAATCAATTGAAAATGTAAATAAAA TAGTTGTTATAGATGAAGGTTACGTTGAAAATATAGGGAATCATGAAGAGCTTATGAAATCTTCAAAAGTATATAAAAAT TTAGTTCAAAAAACAAAATTAGCAGATGAATTTAATTATTAG Protein sequence : MKNYYKKIYSLSEQGAKNLTKSTLICFITYFINLAPITILMLLLNQLILGDVISPFKYVFMSILTLVFMYLLLSTEYVNL YNATYKESANLRKEISKNLADLSISYFSKHDLSDLSQTIMSDVQVIEHAMSHSIPKVVGMWLFFPIMGVMMLIGNWKLGL AVIIPTLLSFVILPLNKRKINSGDSKYFNILRENSELFQETIELQQEISSFNQSDKVKKELYKKMEEREKIHFKIEIKLF SIVALSSLFSYASVAVVILVGIYLLINNQINLIYLIGYIISAIKVKELFDISKEGLLEMFYIEPAVIRIKEMKNEVIKEG EDVSFSNYDIEFKNVSFSYNKDNKVLKDISFVAKQGEVTALVGTSGSGKTSILRLVSRLYDYNDGHILIDGKEIKNVSTD SLFKNISIVFQDVVLFNTSILENIRLGNEKATDEEVKKAAELANCMDFIEKLPDGFDSYIGENGAELSGGERQRISIARA FLKNAPILILDEISSSLDVDNEKKIQESLNKLIKDKTVIIISHRLKSIENVNKIVVIDEGYVENIGNHEELMKSSKVYKN LVQKTKLADEFNY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| EF0584 | NP_814349.1 | ABC transporter ATP-binding protein/permease | Not tested | Not named | Protein | 5e-165 | 63 |
| ef0102 | AAM75305.1 | EF0102 | Not tested | Not named | Protein | 4e-165 | 63 |
