|
Name : secA (MHO_0920) Accession : YP_003302629.1 Strain : Mycoplasma hominis PG21 Genome accession: NC_013511 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Preprotein translocase secA subunit Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 118920 - 121514 bp Length : 2595 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAATATTTGAATTTAAATCAACTGAAATGAGAATTGCAGAGGCAACCCTTAAGAGGATAAATGCTTTAGAACCAGA AATATCAAAATTAAGCAACGAGGAATTGCAACAAAAAACTATAGAGTTTAAGTCGCGTTTAAAAGCAGGAGAAACGCCAG AACAAATTAGACCTGAAACGTTTGCTGTTTGTAGAGAAGCAACAAAACGTATTTTAGGCAAAAGACCATTTGATGTTCAA ATGATAGGCGGAATAATTTTAGATTTAGGTTCTGTAGCAGAAATGAAAACCGGTGAAGGTAAAACTATTACTTCTATAGC ACCAATTTATTTAAACGCAATTACTGGTCAATCTGTTATTGTTTCAACAGTTAATGAATATCTAGCAGAACGTGATGCTC AAGAAATGGGGCAAGTTTTTAACTTTTTAGGTTTAAGTGTTGGAATAAACAAATCTCAAATGTCAAGTGAGTTGAAAAGA GAAGCATATGCTTGCGATATTGTTTATTCTGTTCATTCTGAATTGGGTTTTGATTATTTACGCGACAATATGGCAATGAG TAAAGAAGAAAAAGTTCAACGCGGGCTTGATTTTATTTTACTAGATGAGGTAGATTCAATATTGATTGATGAAGCAAAAA CTCCTTTAATTATTTCAGGCGGTGATAATGACGAAAGCAATTTGTATACAATTGCAGATTTGTTTGTAAGAACATTAAGT CAAGATGATTATTTTATTGATGAAGAAACAAAATCTGTTTATCTAACAGATAAAGGAATTGAAAAAGCTAATAAATATTT CAATTTTAAAAATCTTTATGATATAGAAAATTCTGAACTTGTTCATAGAATTCAAAATGCTTTAAGAGCACATAAAGTAA TGAAATTAGATGTTGAATATATTGTTAGAAACGACAAAATTGAATTAGTTGATTCCTTCACAGGTAGAATAATGGAAGGA AGAGCTTATTCAGAAGGATTGCAACAAGCAATTCAAGCAAAAGAACGCGTTGAAATTGAATCAGAAACCAAAACATTAGC AACAATTACTTATCAAAATTTTTTCCGTCTATTTAAAAAAATAAGTGGTATGACAGGAACAGCAAAAACAGAAGAAAAAG AATTTATTGATATTTATAATATGAGGGTCAATGTTGTTCCAACAAATAAACCAATAGCTAGATTTGATGATAAAGATGAA ATCTATGTTGATATGCACAGCAAATGAAAGGCAGTTACTGCAGAGGTTAAACGTGTTTATAAAAAGAAACAACCAATATT AATAGGAACTGCTCAAGTTGAAGATTCTGAAATATTGCATGAATATTTGCTATCTGAAGGCATACCTCATACAGTTTTAA ATGCAAAGCAAGATGCTTCAGAAGCAGAAATTATTTCTAAAGCAGGACAAGTAGGAGCAGTTACAATTGCCACAAACATG GCCGGACGTGGAACAGATATCAAACCTTCAAAAGAAGCACTAGAATTAGGTGGATTGTATGTTTTAGGTACTGAAAAAGC TGAATCAAGAAGAATTGATAATCAACTAAAAGGACGTTCTGGCCGTCAAGGAGATGTAGGATATACAAAATTCTTTTTAT CATTAGATGACCAATTAATTTTGCGTTTTTCAGTTCAAGATCACTGAAAAGAAATTTTCAAAGAATATGGCGAAGATCCA ATTCCTGGTGAAGCAATTAGAAAGGCCTTTTTGAGGGCTCAAAAAAAGATTGAAGGGTTTAACTTTGATAATAGAAAAAG CGTCCTAAATTTTGATGACGTAATTAGACAACAACGTGATTTAATTTATGAACAACGTGATCTAATTTTAAATAGAGATG ATCTTGGAACAATAATTAGAAAAATGATATCAGTTGCAGCAGAAAAAACAGTAAATAACCCATTCTTTATAAAAAACAAT AGTTTGGATTTAATAGAATTTGTAAAGCATCTAAATAACAATTTTATGATTTTAACAAACAAAGAATTTAGTGTTGAAGA ATTAGTTGAATATGATCGTGAAGAATTAATTCAATACTTAATTGAAACCTGAAATAAATGTTATGACCAACTAAGACAAA ATATCATTGATAAATATGGGATATCTTCATTAATAAATTCTGAAAGAAATATAATATTAAGCGTTTTTGATGCTGCGTGA CAAGATCATATTAATATAATGGACAGATTAAGAAGAAGTACAAATTTAGTTCAATATTCTCAAAAGAACCCATATCAAGT TTACACTCAATTGGGTTCAAAGAAATTCAAAGAATTAACAGGCAGAATTGCTTTGGAATGCACAATTAATTTAATGAATA ATTACGACGCAATACCTTCAACAAATACTGATGTTGATTTATCATGGTTAACAAATGCTTTTGAAGAAAAAACAGATATG GCTCAAACAACTTCAAAGAACCAGCAAGCTCTTGAATTTATCAATTATTTATTGAAGTCAGAACGTGATCATTTGATTAA AGAAGGTTTAAACGAACAAGAAGTGGATGATAAACTAAAGGAAGTGGAAAGATCAATATTAAAAGAGTTCCAATTCCAAC TTGCTTCTTTGCAAACTAATGAAGAAAAAAAATAA Protein sequence : MKIFEFKSTEMRIAEATLKRINALEPEISKLSNEELQQKTIEFKSRLKAGETPEQIRPETFAVCREATKRILGKRPFDVQ MIGGIILDLGSVAEMKTGEGKTITSIAPIYLNAITGQSVIVSTVNEYLAERDAQEMGQVFNFLGLSVGINKSQMSSELKR EAYACDIVYSVHSELGFDYLRDNMAMSKEEKVQRGLDFILLDEVDSILIDEAKTPLIISGGDNDESNLYTIADLFVRTLS QDDYFIDEETKSVYLTDKGIEKANKYFNFKNLYDIENSELVHRIQNALRAHKVMKLDVEYIVRNDKIELVDSFTGRIMEG RAYSEGLQQAIQAKERVEIESETKTLATITYQNFFRLFKKISGMTGTAKTEEKEFIDIYNMRVNVVPTNKPIARFDDKDE IYVDMHSKWKAVTAEVKRVYKKKQPILIGTAQVEDSEILHEYLLSEGIPHTVLNAKQDASEAEIISKAGQVGAVTIATNM AGRGTDIKPSKEALELGGLYVLGTEKAESRRIDNQLKGRSGRQGDVGYTKFFLSLDDQLILRFSVQDHWKEIFKEYGEDP IPGEAIRKAFLRAQKKIEGFNFDNRKSVLNFDDVIRQQRDLIYEQRDLILNRDDLGTIIRKMISVAAEKTVNNPFFIKNN SLDLIEFVKHLNNNFMILTNKEFSVEELVEYDREELIQYLIETWNKCYDQLRQNIIDKYGISSLINSERNIILSVFDAAW QDHINIMDRLRRSTNLVQYSQKNPYQVYTQLGSKKFKELTGRIALECTINLMNNYDAIPSTNTDVDLSWLTNAFEEKTDM AQTTSKNQQALEFINYLLKSERDHLIKEGLNEQEVDDKLKEVERSILKEFQFQLASLQTNEEKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 1e-124 | 41 |
