|
Name : malL (FI9785_582) Accession : YP_003292727.1 Strain : Lactobacillus johnsonii FI9785 Genome accession: NC_013504 Putative virulence/resistance : Unknown Product : oligo-1,6-glucosidase (Sucrase-isomaltase) Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.10 Position : 520404 - 522071 bp Length : 1668 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAATGGTGGCAAAGTTCAGTAATTTATGAAATATATCCTAAAAGTTTTTATGACACAAATAATGATGGCATAGGGGA TCTAAAAGGCGTAGAGAAAAAATTACCGTATCTTAAAGAATTAGGAATAGATGCGATTTGGTTAACACCTATTTATTTAT CTCCTCAGATTGATAATGGATATGATGTTGCTGACTATCGTACAGTAGATCCGATGTTTGGAAACAATCAAGATTTGAAA GAACTCATTGATCGAGCTCATAGATTAAATATTAAAGTTATTCTTGATATGGTAGCAAATCATACTTCGGATCAATGTAT CTGGTTTAAGGAAAGTAAAAAATCAAAAGATAATTATTTTAGTGATTTTTATATTTGGAAAGATCCAAAACCAGATGGAA GTGAACCTAATAATTGGGCAGCCAGTTTTGGAGGATCTGCATGGACATATGTTCCTGAAAGAAGTCAGTATTATCTTCAT TACTATGCTTCTCAGCAACCAGATTTAAATTGGGAAAATCCTTTAGTGCGACAATATGTATATGATGCAATGCGATATTG GAAGTCACAAGGGGTTGATGGATGGCGTTTAGATGTAATTACACAGATCTCTAAAGATTTAACCTTTAAGGATGTGCCTA CGACTGATTCTAACAAAAAATACATTCCATTAAAGAATACAAGCGGTCCACATATGCATAAGTTTATTCATGAACTAAAT CAGCAGGTCCTTAAGCCCTTTGATATGATGAGTGTCGGTGAGGCACCAAATAGTAATATTGAAGAGATCTTAAAGTTAAC TAGTCCTGAACGTGATGAGCTTAATATGGCATTTAGTTTTGAACATATGCGTATAGATAAAGCGATTGGGAAAAATGGTG CTATAGCAGTAAAAAAGCCAAACTTTTTGAAGTTGAAGCAAGTTTTATCGAAGATGCAGTATGAATTAAATAGTAAATCA TGGAATGCTTTATATTTTGAAAATCATGATCGATCAAGAATTCCAACAAGATGGGGGAATGATACAGAGTATCGTTATGA AAGTGCAACTGCGTTTGCCACAATTTTACATGGTTTAAAAGGTACGCCTTTTATTTTTCAAGGTGAAGAGATTGGGATGA CTAATCCTAAATATTCTGTAGATGAATACGAAGATATTGATTTGAAAAATAAATATCAGGAGCAAGTTAAAGAAAAGCAT TTATTAACTACAGATGAATTTTTAAAGGTTGAACATAAAATAGCACGTGATAATGCTCGAACCCCAATGCAATGGAATAA TAAGAAAAATGCTGGTTTTACGGAAGGAAAACCGTGGTATAAGGTTAATCCTAATTTCACTGAAATAAATGTGGAGTCAG ATAAATTAAGTAAAAAATCGATTTTTCGATATTATCAACAATTAATAACTTTACGACATAAAGAAGATATTTTAATAAAA GGTGACTATCAGGAATTATTAGAAGATGATAAAAATATCTTTGCATACCAGCGAAGTTGGAAGAATAAGAGTTGGTTGAT TTTAGTCAATATGACTGAAAAAGATTTATCGTTAAATGAATTGCATGATAATTTGAAAAATTATAAAAAGATAATTTTGC ATAATTATTTGAATCAGAAATTAGAAGATATTCTAAAGCCCTATGAAGCCTATATTCTAGAAAAGTAA Protein sequence : MKWWQSSVIYEIYPKSFYDTNNDGIGDLKGVEKKLPYLKELGIDAIWLTPIYLSPQIDNGYDVADYRTVDPMFGNNQDLK ELIDRAHRLNIKVILDMVANHTSDQCIWFKESKKSKDNYFSDFYIWKDPKPDGSEPNNWAASFGGSAWTYVPERSQYYLH YYASQQPDLNWENPLVRQYVYDAMRYWKSQGVDGWRLDVITQISKDLTFKDVPTTDSNKKYIPLKNTSGPHMHKFIHELN QQVLKPFDMMSVGEAPNSNIEEILKLTSPERDELNMAFSFEHMRIDKAIGKNGAIAVKKPNFLKLKQVLSKMQYELNSKS WNALYFENHDRSRIPTRWGNDTEYRYESATAFATILHGLKGTPFIFQGEEIGMTNPKYSVDEYEDIDLKNKYQEQVKEKH LLTTDEFLKVEHKIARDNARTPMQWNNKKNAGFTEGKPWYKVNPNFTEINVESDKLSKKSIFRYYQQLITLRHKEDILIK GDYQELLEDDKNIFAYQRSWKNKSWLILVNMTEKDLSLNELHDNLKNYKKIILHNYLNQKLEDILKPYEAYILEK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 5e-113 | 46 |
