Name : FI9785_288 (FI9785_288) Accession : YP_003292439.1 Strain : Lactobacillus johnsonii FI9785 Genome accession: NC_013504 Putative virulence/resistance : Unknown Product : maltogenic amylase or neopullulanase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.135 Position : 234916 - 236640 bp Length : 1725 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCAACTTGCAGCTTTAAAACATAGAACTGAAAGTGAAGATTGTTTTGTTATTGATCATTCACACGTTAAAATTAGACT TTATACAGCAAAAGATGATGTGGAAAAAGTAATTGTTCATTACACGGATAACTATCTCCCACCAAAACAAGCTAAAGAAC TTGAAATGGAGAAAATAGGTAGTGGTCAAGTTAATGATTACTGGGGAGCAACCTTAACTGCTCCATATCACCGAATTAAA TATACTTTTGAAGTGATTGGCAAAGATGGAAGTCATGTGCTCTTCGGTGATCGTAGTATTGAAAAATTTAGCGATAAAAA GTTAAGAGAAGATGGAATGTATTTTAAAGTTCCGTACTTCCATGATATTGATCGCATCAAGACTCCAAAATGGCTTAAAG ACATTGTTTGGTATCAAATTTTTCCGGAGCGTTTTGCTAATGGCGATAAAAGTAATGATCCAGCAAATGTTAAAGAGTGG AATCCGGAAGATCATCCAGGTAGAGAAGATTTTTATGGGGGAGACTTACAGGGAGTCTTAGATCATCTAGATGATCTACA GAAATTAGGGGTTACGGGATTATATTTCTGCCCAATTTTTAAGGCAAGTTCTAATCATAAATATGACACAATTGATTATT TACAAGTAGATCCAGCTTTTGGAGACAAGGATTTATTTGCAAAAGTAGTTAATGAAGCACATAAGCGTGGTATGAAAGTA ATGCTTGATGCTGTATTTAATCACTTAGGTGACCAATCAATGCAGTGGCAAGATGTAGTTAAAAATGGCGAAAAATCACG TTTTAAAGATTGGTTCCACATTAATTCATATCCTGTTGAACCCTATCGGGACCCAAGTAAAGGTGAAAAAAATCCACCAT ATGAAACTTTTGCCTTCGAAAAACATATGCCTAAATTAAATACGGCTAACCCAGAAGTACAGGACTTTTTATTAGAAATT GCGACCTACTGGGTAAAATATTTTGATATTGATGCATGGCGTCTAGATGTTGCAAATGAAGTTGACCATCATTTCTGGAA GAGATTCCATGATGAATTAATTAAAATAAAGCCTGATTTCTATATTGTTGGTGAAATATGGCATTCAGCTCGTCCATGGC TTCAGGGAGATCAATTTACAGGTGTCATGAATTATCCATATACTTTACAAATTGAAGATCATTTCTTCAAGCATAAAATG GATGCTAAAGACCTAAGTGAACACTTAACTGATCAGCTAATGATGTATCCTGATATGGTTGACCAGGCTATGATGAATAT GCTTGATTCCCATGATACGGCTAGAATTTTAACTTTAGCAAAAGACAATCAAGATTTAGCTTTACAAGCAGTTGCGTATG AATTTGTTCAACCTGGAGTGCCATGTATTTACTATGGAACAGAGATGGGAATGAGCGGCGATAATGATCCGGATTGTCGC AAACCAATGGATTGGAGCAAGCTCGAAGGACCAGTATGGCAAAGAGTCCATGAATTAGTGAAATTCAGACTTGATCATAG CGATACTTTGAATAAAGGTACTGTTAAGTTAACGGTAACAGAAAAAGGTCTCTTAAAAGTTGAACGAACAGGCAAAGAAA TAATAAAGGCCTACTATAACACAGGTAAAAAAGGTATTAAAATTGATAAAACAGCAGTACTTAGTCAGAACTATAAATCG GGAGTATTAGCGCCAGATGGCTTTTTGATCGAAGTTGAAGCTTAA Protein sequence : MQLAALKHRTESEDCFVIDHSHVKIRLYTAKDDVEKVIVHYTDNYLPPKQAKELEMEKIGSGQVNDYWGATLTAPYHRIK YTFEVIGKDGSHVLFGDRSIEKFSDKKLREDGMYFKVPYFHDIDRIKTPKWLKDIVWYQIFPERFANGDKSNDPANVKEW NPEDHPGREDFYGGDLQGVLDHLDDLQKLGVTGLYFCPIFKASSNHKYDTIDYLQVDPAFGDKDLFAKVVNEAHKRGMKV MLDAVFNHLGDQSMQWQDVVKNGEKSRFKDWFHINSYPVEPYRDPSKGEKNPPYETFAFEKHMPKLNTANPEVQDFLLEI ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKRFHDELIKIKPDFYIVGEIWHSARPWLQGDQFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKM DAKDLSEHLTDQLMMYPDMVDQAMMNMLDSHDTARILTLAKDNQDLALQAVAYEFVQPGVPCIYYGTEMGMSGDNDPDCR KPMDWSKLEGPVWQRVHELVKFRLDHSDTLNKGTVKLTVTEKGLLKVERTGKEIIKAYYNTGKKGIKIDKTAVLSQNYKS GVLAPDGFLIEVEA |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 3e-128 | 45 |