|
Name : polA (FI9785_1446) Accession : YP_003293572.1 Strain : Lactobacillus johnsonii FI9785 Genome accession: NC_013504 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1365672 - 1368332 bp Length : 2661 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGCACAAAAGAAATTACTTTTAATTGACGGCAACTCTGTGGCCTTTCGTGCCTTTTATGCTTTATACCGTCAGCTTGA TCGTTTTACTAGTCCAGATGGCTTGCATACAAATGCAATTTTTACTTTTAAAAATATGCTTGACGCAATCATGAAACAGA CTAATCCAACTAATGTTTTAGTTGCTTTTGATGCAGGAAAAGTTACTTTTAGAACTGAGATGTATCAAGATTATAAAGGT GGTCGCCAAAAAACACCGAGTGAATTGTCAGAGCAACTTCCTGTAATTCGTGAAATGCTTAAAGACTTAGGAATAAAGAG TTATGAGCTAAAGAATTATGAAGCTGATGATATTATTGGAACACTTTCTAAGATGGGAGAAGATGCTGGGTATACAGTTG ATATTGTGACTGGAGATAGAGATTTAACTCAGCTTGCATCTGATAAAACTACAGTATTAATTACTAAAAATGGAGTTGGC GATACAGAAGCATATACTCCAGACCATATGAAAGAAGTTAACGGTGTTACTCCAACCGAATTCATTGATATGAAAGCTTT GATGGGGGATAGTTCAGATAATTATCCTGGTGTAACTAAGGTTGGCCCAAAAACTGCATCCCGTCTAATTCAAAAATATG GTTCTATTGAAGAACTTTATGAACATGTAGACGAAATGAAAAAGTCTAAGCTAAAAGAAAACTTAATTAATGATAAAGAT AAGGCATTTTTAGCTAAAAAGTTGGCCACTATTGATCGTGATTCGCCAGTGGAAGTAAATCTGGCTGATACTAAATTACA AGAACCAAATATTGAAGATTTGCGTAATTTGTATGAACGTTTAGGATTTAAAAAATTCTTAGCAGAATTAGGTAGCACGG GTACGACTAGTAGTGAACAAGAGATTGAAAAATACGAATATCTTGAATTAACTAATGAGAATATCGTTGAACTAGATAAA ATCAGTGAAAAAGAAGTAACTTTTTATTTAGCAATGCTAGGTGATAATTATCATCTGGCTCCAATTGAAGGCTTTTCTCT AAAAGTTGGTAATAAGATTTATGTATCTAAAGATCCAGTTTTGTTGCAAGAAAATCCACTTCGTAAAATGCTAGAAGATA AGACCATCAAGAAGAATGTTTTTGATATTAAAAGAACTTATGTAGGTTTACATCGACTAAATCTCAAGGCAGAAGGTCTA GACTATGATATGCTTCTTGCTTCATATTTAGTTAATAATGAAAATAATTCGAATGATCTTGGAGAAGTAGCTCATTTATA TGACGATTATTCTGTAAAGACTGATTTAGAAGTTTACGGAAAAGGTAAAAAACAAGCTGTACCTGACGATAATGAATTCT TTGAACATTTAGCAGCTAAAGTCGCAGTAATTGAGAAATTAAAGACTCCACTTCTTGAAAAACTAAAAGATCATGAACAA GATGATTTATATGAAACAATTGAAATTCCAGTGGCTTTCGTCTTAGCAAAGATGGAAATTACTGGAATCAAGGTTGAAGC ATCCGTTTTGAATCAATTAGGTAATGATTTTGCAGTTAAGTTACAAGAACTAGAACATAAGATTTATCAACAGGCTGGTG AAGAATTTAACTTGAACTCACCTAAGCAGTTGGGGCATATCCTATTTGAAAAATTAGGTTTACCACCAATTAAGAAGACT AAGACTGGTTACTCAACATCTGTTGAAGTATTAGAGCAATTAAAAATGAAAAGTCCAATTGTTTCAGAAATTTTGGACTA TCGTCAAATTGCTAAAATTCAAAACACTTATGTTAAGGGCTTGCTTGAATGTATTCAGCCTGATGGAAGAATCCATACTC GTTATTTACAGACTTTAACAGCTACCGGTCGTCTTTCTTCAGTTGATCCTAATTTACAAAATATTCCAACCAGAACTAAT GAAGGAAAGCAGATTAGAAAAGCTTTTGTTCCTTCAACAAAAGATGGGTATATTTTCTCTTGTGATTATTCTCAGGTTGA ACTAAGAGTGCTAGCTCATGTTTCTGGGGATGAACATATGCAAGAAGCATTCAAGTCAGGCTATGATATTCATGCCCACA CTGCAATGAAGATTTTCCACTTGGACTCACCTGATGAAGTAACGCCATTAATGCGTAGACATGCTAAAGCTGTTAATTTT GGTATCGTTTATGGTATTTCAGACTATGGCTTATCTAAAAACTTAGGTATTAGTCGTAAGCAGGCTAAGACGTTTATTGA AAATTACTTTGAACAATATCCTCAAATTAAAAATTATATGGATGACGCAATTAAAAAGGCTCGTGAGAATGGCTATGCAG AAACAATTATGCATAGAAGACGGTATTTACCAGATATTCATTCAAAGAACTTTAATGTCAGAAGTTTTGCGGAAAGAACT GCAATTAATTCTCCAATTCAAGGATCAGCAGCTGATATTATTAAGATTGCCATGATTAATATGCAGAAAAAACTTGATGA ACTACATTTAAAGACTAAAATGGTTTTACAAGTACACGATGAATTGATTTTTGATGTGCCAAAAGATGAGTTAGATACAA TTAAGAAAATTGTTCCAGAAGTTATGCAGTCAGCTGTCAAATTAGATGTTCCACTAATTGCTGATTCTAATTGGGGTCAT AATTGGTACGATGCAAAATAA Protein sequence : MAQKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLDRFTSPDGLHTNAIFTFKNMLDAIMKQTNPTNVLVAFDAGKVTFRTEMYQDYKG GRQKTPSELSEQLPVIREMLKDLGIKSYELKNYEADDIIGTLSKMGEDAGYTVDIVTGDRDLTQLASDKTTVLITKNGVG DTEAYTPDHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDSSDNYPGVTKVGPKTASRLIQKYGSIEELYEHVDEMKKSKLKENLINDKD KAFLAKKLATIDRDSPVEVNLADTKLQEPNIEDLRNLYERLGFKKFLAELGSTGTTSSEQEIEKYEYLELTNENIVELDK ISEKEVTFYLAMLGDNYHLAPIEGFSLKVGNKIYVSKDPVLLQENPLRKMLEDKTIKKNVFDIKRTYVGLHRLNLKAEGL DYDMLLASYLVNNENNSNDLGEVAHLYDDYSVKTDLEVYGKGKKQAVPDDNEFFEHLAAKVAVIEKLKTPLLEKLKDHEQ DDLYETIEIPVAFVLAKMEITGIKVEASVLNQLGNDFAVKLQELEHKIYQQAGEEFNLNSPKQLGHILFEKLGLPPIKKT KTGYSTSVEVLEQLKMKSPIVSEILDYRQIAKIQNTYVKGLLECIQPDGRIHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRTN EGKQIRKAFVPSTKDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDEHMQEAFKSGYDIHAHTAMKIFHLDSPDEVTPLMRRHAKAVNF GIVYGISDYGLSKNLGISRKQAKTFIENYFEQYPQIKNYMDDAIKKARENGYAETIMHRRRYLPDIHSKNFNVRSFAERT AINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVLQVHDELIFDVPKDELDTIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSNWGH NWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 55 |
