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Name : secA (FI9785_1357) Accession : YP_003293484.1 Strain : Lactobacillus johnsonii FI9785 Genome accession: NC_013504 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Preprotein translocase subunit SecA Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 1280716 - 1283115 bp Length : 2400 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGCTAATATTCTTAAAAAAATTTACGATAACGATAGAAGAGAATTAAAGAAATTTGAAAAATTAGCAACTAAGGTAGA ATCTTTAGGAGACGAGTACGAAAAATTATCTGATGAGCAACTCCAAGCAAAGACACCAGAATTCCGTAAGCGTTTAGAAA ATGGTGAAACGTTAGACGATATTCTACCAGAAGCATTTGCTACAGCACGTGAAGGTGCAAAAAGAGTTTTAGGATTATAT CCTTTCCGTGTTCAAATTATTGGTGGTATTGCGCTTCATTATGGTAATATCGCCGAAATGATGACTGGGGAAGGTAAGAC CTTAACTGCTACTTTGCCAGTTTATTTAAATGCTTTAACGGGGAAAGGTGTTCATGTGGTAACAGTTAATGAATACCTGT CTAGCCGTGATGAAAGTGAAATGGGGCAATTATATAAGTGGCTCGGTTTATCTGTAGGTTTAAACCTTAATTCGATGTCT GCAGATGAAAAAAGAGATGCTTATAATTGTGACGTTACTTATTCAACGAACTCAGAATTAGGATTTGATTATTTAAGAGA CAATATGGTTGTCTACAAAGATCAAATGGTTCAACGTCCACTTAACTATGCAATTATCGATGAGGTTGACTCAATCTTAA TTGATGAAGCTAGAACACCATTAATTATTTCTGGACAAGCAGAGCAAGCAAACAGTGAGTATATTCGTGCTGATCGTTTT GTTAAAACCTTAGTTGAAGATAAAAGTGATGACGATGTAGATGATGAAGAAGACCATGGTGACTACAAGATTGATTGGCC AACCAAAACAATTAATTTGACCAATCAAGGAATTAAAAAAGCTTGTGAACACTTTGGTTTGAAGAATTTGTATGACATTG ATAACCAAGTTTTAGTTCACCATATTGATCAAGCGTTAAGAGCTAACTACATTATGTTGAAAGACATTGATTATGTAGTT CAAAATGGCGAAGTTATGATTGTCGATTCTTTCACCGGACGTGTAATGGAAGGTCGTCGCTATTCTGATGGACTTCACCA AGCAATTGAGGCAAAAGAAGGGGTTAAGATTCAAGAAGAGTCTAAAACTCAAGCGACTATCACTTACCAGAACTTCTTTA GAATGTATAAAAAGCTCGCAGGTATGACAGGTACAGCTAAGACGGAAGAAGAAGAATTTCGTGAGATCTATAACATGGAA GTAATCACTATTCCAACTAACCGTCCTATTGCTCGTAAAGACTTACCAGATATTTTATATCCAACCTTAGATTCTAAATT TGAAGCTGTAGTAAAGGAAATTAAGGAGCGTCACGCCAAAGGACAACCGGTATTGGTTGGTACTGTTGCTATTGAAAGTT CTGAACGTTTAAGCCAAATGCTTAACCAAGCAGGTATCCCACATGCAGTTTTGAATGCAAAAAACCATGCTAAAGAAGCA GAGATCATTATGAATGCTGGTCAAAGAGGAGCAGTTACAATTGCTACTAACATGGCTGGTCGTGGTACTGATATTAAATT AGGGCCAGGTGTTAAAGAATTAGGCGGTCTAGCTGTTATTGGTACTGAGCGTCATGAATCTCGTCGTATTGATAATCAGC TTCGTGGTAGATCTGGTCGACAGGGTGATCCTGGTGTAACAAGATTTTATCTATCTTTAGAAGATGATTTGATGAAGCGT TTTGGTGGAGATCGAGTAAAATTATTCCTTGATCGAATATCTGATAATGATGACGACAAAGTCATTGAATCACGTATGAT TACTAAGCAAGTTGAATCAGCTCAAAAGCGTGTTGAAGGTAACAACTACGATACTCGTAAGCAAACTTTGCAATACGATG ATGTTATGCGTACGCAACGTGAAATTATTTACGGGGAAAGAATGCAGGTTATTTCTGAAGATAAATCATTGAAACCTGTT TTAATGCCGATGATTAAGCGGACTATTGATCATAAGATTGATATGTATACCCAAGGCGACAAAAAAGATTGGCGTAATGA TCAATTAAGAGATTTTATTTCATCTGCTATTACCGATGAAGAAACTACGAAAAAGCTTAATATGAAGCACTTAAGTGCGG AAGAACTTAAGAAGCGCCTTTATCAGATTGCAGAAGATAATTACGCTGAAAAAGAAAAACAACTTGCTGATCCTGAACAA ATGTTAGAATTTGAGAAAGTTGTTATCTTACGTGTTGTAGATGAACGCTGGACTGATCATATCGATGCGATGGATCAATT ACGACAATCTATTAGTCTAAGAGGATATGGACAATTAAATCCATTAGTTGAATATCAAGAAGCGGGCTATAGAATGTTTG AAGAAATGATCAGTAATATCGAATTTGATGCCACCCGTCTATTTATGAAGGCTCAAATAAGACAAAACATTAGTCGATAA Protein sequence : MANILKKIYDNDRRELKKFEKLATKVESLGDEYEKLSDEQLQAKTPEFRKRLENGETLDDILPEAFATAREGAKRVLGLY PFRVQIIGGIALHYGNIAEMMTGEGKTLTATLPVYLNALTGKGVHVVTVNEYLSSRDESEMGQLYKWLGLSVGLNLNSMS ADEKRDAYNCDVTYSTNSELGFDYLRDNMVVYKDQMVQRPLNYAIIDEVDSILIDEARTPLIISGQAEQANSEYIRADRF VKTLVEDKSDDDVDDEEDHGDYKIDWPTKTINLTNQGIKKACEHFGLKNLYDIDNQVLVHHIDQALRANYIMLKDIDYVV QNGEVMIVDSFTGRVMEGRRYSDGLHQAIEAKEGVKIQEESKTQATITYQNFFRMYKKLAGMTGTAKTEEEEFREIYNME VITIPTNRPIARKDLPDILYPTLDSKFEAVVKEIKERHAKGQPVLVGTVAIESSERLSQMLNQAGIPHAVLNAKNHAKEA EIIMNAGQRGAVTIATNMAGRGTDIKLGPGVKELGGLAVIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGVTRFYLSLEDDLMKR FGGDRVKLFLDRISDNDDDKVIESRMITKQVESAQKRVEGNNYDTRKQTLQYDDVMRTQREIIYGERMQVISEDKSLKPV LMPMIKRTIDHKIDMYTQGDKKDWRNDQLRDFISSAITDEETTKKLNMKHLSAEELKKRLYQIAEDNYAEKEKQLADPEQ MLEFEKVVILRVVDERWTDHIDAMDQLRQSISLRGYGQLNPLVEYQEAGYRMFEEMISNIEFDATRLFMKAQIRQNISR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 3e-145 | 43 |
