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Name : SAAV_0418 (SAAV_0418) Accession : YP_003281363.1 Strain : Staphylococcus aureus ED98 Genome accession: NC_013450 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha-amylase family protein Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 460086 - 461726 bp Length : 1641 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCGAAAGAAATAGATTGGAGAAAATCCGTTGTATATCAAATTTATCCTAAGTCGTTTAATGATACGACGGGGAATGG TATAGGAGATATCAACGGAATTATAGAAAAATTGGATTATATCAAGTTATTGGGTGTTGATTATATTTGGTTAACACCAG TGTATGAATCACCTATGAATGATAATGGCTATGATATCAGCAATTATTTAGAAATCAATGAAGCCTTTGGAACGATGGAT GATTTTGAAAAGTTAATCAAAGTTGCTCATCAAAAAGACTTGAAAGTGATGTTAGATATTGTTATTAATCATACGTCGAC GGAGCATGAATGGTTTAAAGAAGCCCGTAAATCTAAAGATAACCCTTATAGAGATTATTACTTTTTCAGATCATCTGAAG ACGGGCCGCCAACAAATTGGCATTCTAAATTCGGTGGTAATGCATGGAAGTATGATTCTGAGACAGATGAATATTATTTA CATTTATTTGATGTCAGTCAAGCTGATTTAAATTGGGATAATCCGGAAGTACGTCAATCGTTATATCGCATAGTCAATCA TTGGATAGACTTCGGCGTTGATGGTTTTCGATTTGATGTCATTAACTTAATTTCTAAAGGTGAATTTAAGGACTCTGACA AAATAGGTAAAGAATTTTATACGGATGGTCCTAGAGTGCATGAGTTTCTGCATGAATTAAATCGTCAAACGTTTGGTAAC ACTGACATGATGACTGTAGGAGAAATGTCTTCGACGACGATTGAAAATTGTATTAAGTATACACAACCAGAACGCCAAGA ATTGAATAGTGTTTTTAATTTTCATCATCTAAAGGTTGATTATGTTGATGGTGAAAAGTGGACAAATGCGAAGCTTGATT TTCATAAGTTAAAGGAAATTCTGATGCAATGGCAACGAGGTATTTATGACGGTGGCGGATGGAACGCGATTTTCTGGTGT AATCATGATCAGCCACGGGTAGTGTCTAGATTTGGTGATGATACGTCGGAAGAGATGAGGATACAAAGTGCTAAAATGTT AGCTATCGCACTGCATATGTTGCAAGGGACGCCATATATTTACCAAGGTGAAGAAATTGGTATGACGGACCCACATTTTA CATCAATAGCACAATATCGTGATGTTGAATCGATTAATGCCTACCATCAGTTGCTAAGTGAAGGGCATGCTGAAGCGGAT GTATTAGCGATTTTAGGACAGAAGTCACGAGACAATTCGAGAACGCCTATGCAATGGAGTGATGATGTTAATGCTGGATT TACAGCTGGTAAGCCTTGGATTGATATTTCGGAAAATTATCATCAGGTCAACGTTAGACAAGCACTTCAGAATAAAGAGT CTATTTTCTATACGTATCAAAAATTAATACAATTAAGACATACGCATGATATTATTACGTATGGAGACATTGTGCCACGT TTTATGGATCATGATCATTTATTTGTTTATGAACGTCATTATAAGAATCAACAATGGCTAGTAATTGCGAATTTCTCAGC ATCGGCTGTTGATTTGCCAGAAGGATTGGCTAGAGAAGGTTGTGTTGTGATTCAAACAGGCACAGTGGAAAATAATACGA TAAGCGGGTTTGGTGCAATTGTAATCGAAACAAACGCGTAA Protein sequence : MSKEIDWRKSVVYQIYPKSFNDTTGNGIGDINGIIEKLDYIKLLGVDYIWLTPVYESPMNDNGYDISNYLEINEAFGTMD DFEKLIKVAHQKDLKVMLDIVINHTSTEHEWFKEARKSKDNPYRDYYFFRSSEDGPPTNWHSKFGGNAWKYDSETDEYYL HLFDVSQADLNWDNPEVRQSLYRIVNHWIDFGVDGFRFDVINLISKGEFKDSDKIGKEFYTDGPRVHEFLHELNRQTFGN TDMMTVGEMSSTTIENCIKYTQPERQELNSVFNFHHLKVDYVDGEKWTNAKLDFHKLKEILMQWQRGIYDGGGWNAIFWC NHDQPRVVSRFGDDTSEEMRIQSAKMLAIALHMLQGTPYIYQGEEIGMTDPHFTSIAQYRDVESINAYHQLLSEGHAEAD VLAILGQKSRDNSRTPMQWSDDVNAGFTAGKPWIDISENYHQVNVRQALQNKESIFYTYQKLIQLRHTHDIITYGDIVPR FMDHDHLFVYERHYKNQQWLVIANFSASAVDLPEGLAREGCVVIQTGTVENNTISGFGAIVIETNA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 8e-120 | 49 |
