|
Name : SAAV_0030 (SAAV_0030) Accession : YP_003280985.1 Strain : Staphylococcus aureus ED98 Genome accession: NC_013450 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 34713 - 36458 bp Length : 1746 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAGATTAATATTTATAAATCTATTTATAATTTTCAGGAAACAAATACAAATTTTTTAGAGAATCTAGAATCTTTAAA TGATGACAATTATGAACTGCTTAATGATAAAGAACTTGTTAGTGATTCAAATGAATTAAAATTAATTAGTAAAGTTTATA TACGTAAAAAAGACAAAAAACTATTAGATTGGCAATTATTAATAAAGAATGTATACCTAGATACTGAAGAAGATGACAAT TTATTTTCAGAATCCGGTCATCATTTTGATGCAATATTATTTCTCAAAGAAGATACTACATTACAAAATAATGTATATAT TATACCTTTTGGACAAGCATATCATGATATAAATAATTTGATTGATTATGACTTCGGAATTGATTTTGCAGAAAGAGCAA TCAAAAATGAAGACATAGTTAATAAAAATGTTAATTTTTTTCAACAAAACAGGCTTAAAGAGATTGTTAATTATAGAAGG AATAGTGTAGATTACGTTAGACCTTCAGAATCTTATATATCAGTCCAAGGACATCCACAGAATCCTCAAATTTTTGGAAA AACGATGACTTGTGGTACAAGTATTTCATTGCGTGTACCGAATAGAAAGCAGCAATTCATAGATAAAATTAGTGTGATAA TCAAAGAAATAAACGCTATTATTAATCTTCCTCAAAAAATTAGTGAATTTCCTAGAATAGTAACTTTAAAAGACTTGAAT AAAATAGAAGTATTAGATACTTTATTGCTAAAAAAACTATCGAATTCTTCAACTACAGAAAATATATCTATAGATATATC AAGATTTTTAGAACTAAGTAATATGATACTCTTGTTAGATGATATGCTCGACGTCAATATATATATAAATTCTTTTAAAA ATAATACATTAGAGACATTTGATGCGACTGATCCTGAAGTTGATTACATCACTGAAATAGGAGATTACTTATTAAAATAT GACGTTAATTCTATAAATGATGTCAGAATTGAAGTGATAGATAATTTGGGGCATTCAAATAATATGCTACTAAAAACGAT ACTACATGCAGAAGTTGAAATGGAAGATGGAAAGAAATATTTATTACAAAATGGGAAATGGGGTTATTTTAATAGAGAAT TTTTTGACCTTTTGAATGATCATTTGAATGAGATAGAAATTAGGTATAACACACTAACTCCCACAGGTTTAGTATTTAAA GAAGGAGAAGAAGGATATATAAAAGAAATAGTAGGAAGATTGCCAGAAGAATATTTAATGTTACATAAAAAATTCATAAA ACCAATAAATAAGAATTTTATAGTAAAAGGAAATGGAATAGAGTTGGCAGACTTATACAATATTAAAAACAAAGAGCTTT TCACGATTAAAAGAGGAATTAATACATCTTTATCTCTTTATAGTCTAGAACAGAATATAATAGCAATTAACGCCTTAAAA TATCCAGAATCATATAATTTTGAAGAATTAATAGAAGCTATTCCTGATAACTCGGAAAATATATTTAATGATATACAACG GAGTACAAATTTTAGTATAGTATGGATTTTACCGATATCATCTATTGATAATATGCCCATAAAAGATATGGTTCATACTA GTAACGTAATAAATAAAAACTTTCAATTAACTAATTTAGGTTCAGTATTACTTAAAAATAAATTAGTAGAGTGGTCTCTC TATTTAAAAGATCAAAGAATTAATCCAATTATTTATATGGAAACGCCAACTGAAGATAGAAATTAA Protein sequence : MKINIYKSIYNFQETNTNFLENLESLNDDNYELLNDKELVSDSNELKLISKVYIRKKDKKLLDWQLLIKNVYLDTEEDDN LFSESGHHFDAILFLKEDTTLQNNVYIIPFGQAYHDINNLIDYDFGIDFAERAIKNEDIVNKNVNFFQQNRLKEIVNYRR NSVDYVRPSESYISVQGHPQNPQIFGKTMTCGTSISLRVPNRKQQFIDKISVIIKEINAIINLPQKISEFPRIVTLKDLN KIEVLDTLLLKKLSNSSTTENISIDISRFLELSNMILLLDDMLDVNIYINSFKNNTLETFDATDPEVDYITEIGDYLLKY DVNSINDVRIEVIDNLGHSNNMLLKTILHAEVEMEDGKKYLLQNGKWGYFNREFFDLLNDHLNEIEIRYNTLTPTGLVFK EGEEGYIKEIVGRLPEEYLMLHKKFIKPINKNFIVKGNGIELADLYNIKNKELFTIKRGINTSLSLYSLEQNIIAINALK YPESYNFEELIEAIPDNSENIFNDIQRSTNFSIVWILPISSIDNMPIKDMVHTSNVINKNFQLTNLGSVLLKNKLVEWSL YLKDQRINPIIYMETPTEDRN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | BAA86635.1 | hypothetical protein | Not tested | Type-I SCCmec | Protein | 0.0 | 100 |
| unnamed | BAA94647.1 | - | Not tested | Type-II SCCmec | Protein | 0.0 | 100 |
| SAV0082 | NP_370606.1 | hypothetical protein | Not tested | Type-II SCCmec | Protein | 0.0 | 99 |
